| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 53,413 | G→A | intergenic (+45/‑94) | U712_00230 → / → U712_00235 | Protein sspF/4‑diphosphocytidyl‑2‑C‑methyl‑D‑erythritol kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 53,413 | 0 | G | A | 98.8% | 914.6 / ‑1.3 | 256 | intergenic (+45/‑94) | U712_00230/U712_00235 | Protein sspF/4‑diphosphocytidyl‑2‑C‑methyl‑D‑erythritol kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base A (93/160); total (95/161) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.49e-01 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
TGGAGGCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTGGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCAATCTGTCACT > CP006881/53266‑53559 | tGGAGGCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGa > 1:3339529/1‑150 (MQ=255)tGGAGGCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATAGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGa < 2:3614693/150‑1 (MQ=255) ggAGGCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGat < 2:752592/150‑1 (MQ=255) aGGCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGatat > 2:3093480/1‑150 (MQ=255) aGGCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGatat < 1:450952/150‑1 (MQ=255) ggCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGAtata > 2:3215468/1‑150 (MQ=255) gCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATaa < 2:2186910/150‑1 (MQ=255) cTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATaaa > 2:3529003/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAAt > 1:2903194/1‑150 (MQ=255) tGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAAt < 2:1888346/150‑1 (MQ=255) gggTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCGAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATAc < 2:16711/150‑1 (MQ=255) gAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGGCCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTGTTGATGTTAGATATAAATACATaa > 2:3718066/1‑150 (MQ=255) gAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATaa < 1:3212862/150‑1 (MQ=255) aaaTTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAAt > 2:337813/1‑150 (MQ=255) aTTGGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGTATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATgg < 1:937003/150‑1 (MQ=255) tCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGc > 1:511037/1‑150 (MQ=255) ggCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGa < 1:2783861/150‑1 (MQ=255) cccGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAat < 2:1058566/150‑1 (MQ=255) gcgATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATg < 2:814941/150‑1 (MQ=255) cgATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATgg > 2:1141012/1‑150 (MQ=255) cgATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATgg < 2:2693374/150‑1 (MQ=255) gATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGa < 1:3784896/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGat < 2:472845/150‑1 (MQ=255) aTGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGat < 2:860380/150‑1 (MQ=255) gCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGatat < 1:3529003/150‑1 (MQ=255) ccGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATg < 2:2142469/150‑1 (MQ=255) tAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCa > 1:1644930/1‑150 (MQ=255) tGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTg < 2:637694/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAAGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGGTATGTTCATCCTGt > 1:215175/1‑150 (MQ=255) gTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTa < 1:1690371/150‑1 (MQ=255) tGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTAc < 1:1952940/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCCAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTc < 2:1598528/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTc > 2:2554613/1‑150 (MQ=255) gCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCa < 2:511037/150‑1 (MQ=255) gCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAACAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCa < 2:3768707/150‑1 (MQ=255) tATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAAtgtg > 2:2089874/1‑150 (MQ=255) aTTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCC‑GGGGACGTGCTATTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGAt < 2:576562/150‑1 (MQ=255) gAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCC‑GGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACa < 1:1816815/150‑1 (MQ=255) aTCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAAt < 2:2824415/150‑1 (MQ=255) tCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGCCCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATg < 2:1535259/150‑1 (MQ=255) cGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAGCCGATAAGGATGTGGCCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTTCTTCAAATGTGGTACAATgg > 2:1971390/1‑149 (MQ=255) gCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGtt < 2:3465399/150‑1 (MQ=255) gCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGtt < 1:3092765/150‑1 (MQ=255) cGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCa < 2:2236887/150‑1 (MQ=255) aCAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATAc < 1:2521694/150‑1 (MQ=255) cAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACt > 1:1294331/1‑150 (MQ=255) aGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACtt < 1:368509/150‑1 (MQ=255) aGCAAATGGCCCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACtt < 1:1254741/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGt > 2:2416142/1‑150 (MQ=255) aaTGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGt > 2:3884746/1‑150 (MQ=255) aTGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGtt < 2:3589348/150‑1 (MQ=255) aTGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGtt > 2:896954/1‑150 (MQ=255) gCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAg > 2:2616235/1‑150 (MQ=255) gCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAg > 2:1262820/1‑150 (MQ=255) cTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGa < 1:1078091/150‑1 (MQ=255) tcagaatcagaaTAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGAt < 2:3839622/150‑1 (MQ=255) cagaatcagaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATg < 2:3915813/150‑1 (MQ=255) cagaatcagaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATg < 1:2660326/150‑1 (MQ=255) gaatcagaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGga < 1:3827979/150‑1 (MQ=255) aatcagaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGgag > 2:1931771/1‑150 (MQ=255) atcagaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGgaga < 2:3015557/150‑1 (MQ=255) cagaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAg < 1:2109137/150‑1 (MQ=255) agaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAg > 1:1196128/1‑149 (MQ=255) agaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAg < 2:1196128/149‑1 (MQ=255) gaatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTa > 2:1366150/1‑150 (MQ=255) aatAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAg < 2:2516945/150‑1 (MQ=255) tAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTACTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGt > 1:2234783/1‑150 (MQ=255) aCCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGa < 1:1134507/150‑1 (MQ=255) ccGATAAGGATGTGTCCCGGGGGTCGTGCTGTTCCCTGGTTATTTTTATTTAGATATAATTACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGaa < 2:1471459/150‑1 (MQ=255) aTAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGc < 2:2309264/150‑1 (MQ=255) aGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTAt < 1:680840/150‑1 (MQ=255) ggATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATg < 1:559226/150‑1 (MQ=255) gATGTGACCCGGGGGACTTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATTTAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGc < 1:1503223/150‑1 (MQ=255) gATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTAATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGcgaagc > 1:2646261/1‑145 (MQ=255) gtgACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTa < 2:966140/150‑1 (MQ=255) tgACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTAt < 2:2715619/150‑1 (MQ=255) tgACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTAt < 2:3408849/150‑1 (MQ=255) cccGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTAtttt > 2:1276758/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTGGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAAGGTTCATACTTATGTTTAGATGGGGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGGATTTTa > 1:2330105/1‑150 (MQ=255) ccGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGAAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTa > 1:605355/1‑150 (MQ=255) cGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAg < 1:1034381/150‑1 (MQ=255) cGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAg < 1:1919794/150‑1 (MQ=255) ggggACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGTTGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGaa > 2:3158973/1‑150 (MQ=255) aCGTGCTGTCCCCTGGTTTTTTTTTTTTAGATATAAATTCATGATGGGCAGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAg < 1:356039/150‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAgcg > 1:2700317/1‑150 (MQ=255) cTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCa < 2:347343/150‑1 (MQ=255) gTTCCCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGc > 2:1395431/1‑150 (MQ=255) ttCGCTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCt < 1:3120218/150‑1 (MQ=255) ccTGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACATTGTTCTTACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGAGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAg > 2:2871658/1‑150 (MQ=255) tGGTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAATGCGCCAGCTAAGAt < 1:2024869/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCa < 1:3310791/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCa < 1:2607097/150‑1 (MQ=255) gTTTTTTTATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCa < 2:2916902/150‑1 (MQ=255) tttttATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCAATc > 1:1597810/1‑150 (MQ=255) ttttattttaGATATAAGTACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCAATCt > 1:1712953/1‑150 (MQ=255) tttATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCAATCTg > 2:446335/1‑150 (MQ=255) tATTTTAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCAATCTGTc < 2:2477713/150‑1 (MQ=255) ttttAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGTTGGAGAAGGAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGGTCAATCTGGCAc > 1:805846/1‑150 (MQ=255) ttttAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATGTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGGTCAATCTGTCAc > 2:1677434/1‑150 (MQ=255) tttAGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCAATCTGTCACt > 2:373493/1‑150 (MQ=255) | TGGAGGCTGGGGTGAAATTCGGGCCCGCGATGCCGGTAACATGGTGAAGCGTGCTATTGAAATCGCCGAACAGCAAATGGCTCAGAATCAGAATAACCGATAAGGATGTGACCCGGGGGACGTGCTGTTCCCTGGTTTTTTTATTTTGGATATAAATACATAATGGGCTGAATATGGATATGTTCATCCTGTACTTCAAATGTGATACAATGTTCATACTTATGTTTAGATGGAGAAGTAGGTGAAAGCTATGCGTATTTTAGAAAAAGCGCCAGCTAAGATCAATCTGTCACT > CP006881/53266‑53559 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |