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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP006881 | 1,663,565 | 0 | G | A | 14.8% | 1227.1 / 134.4 | 406 | G116R (GGG→AGG) | U712_08555 | Flagellar basal‑body rod protein flgG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (153/193); new base A (26/34); total (179/227) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 422 total aligned reads displayed.
AAATCGGTTTAGGTTCATCATCTGGCACAATTGATACAATTCATTCAACAAGCGCGACACAAAGCACAGGAAGAACACTTGATTTAGCAATTGACGGCGACGGTTACTTCCGAATTGATACAGGTGACGGGACAGCTTATACAAGAGCAGGGAACTTCTATTTAGATAATACTGGAACACTGGTTACAGGTGATGGCTACCATGTACTAAATATGAATGGCGGAACAATTAAAATTCCTACTGATGCTCAAAGCTTTAGCATTGGTTCTGATGGAAAGGTGTCAATTGTTGATGCTGAGG > CP006881/1663416‑1663715 | aaaTCGGTTTAGGTTCATCATCTGGCACAATTGATACAATTCATTCAACAAGCGCGACACAAAGCACAGGAAGAACACTTGATTTAGCAATTGACGGCGACGGTTACTTCCGAATTGATACAGGTGACGGGACAGCTTATACAAGAGCAg > 1:4166672/1‑150 (MQ=255) aaTCGGTTTAGGTTCATCATCTGGCACAATTGATACAATTCATTCAACAAGCGCGACACAAAGCACAGGAAGAACACTTGATTTAGCAATTGACGGCGACGGTTACTTCCGAATTGATACAGGTGACGGGACAGCTTATACAAGAGCAgg > 1:4311926/1‑150 (MQ=255) aTCGGTTTAGGTTCATCATCTGGCACAATTGATACAATTCATTCAACAAGCGCGACACAAAGCACAGGAAGAACACTTGATTTAGCAATTGACGGCGACGGTTACTTCCGAATTGATACAGGTGACGGGACAGCTTATACAAGAGCAggg < 1:5190754/150‑1 (MQ=255) 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agagCAGGGAACTTCTATTTAGATAATACTGGAACACTGGTTACAGGTGATGGCTACCATGTACTAAATATGAATGGCGGAACAATTAAAATTCCTACTGATGCTCAAAGCTTTAGCATTGGTTCTGATGGAAAGGTGTCAATTGTTGAt < 2:4695344/150‑1 (MQ=255) aGGGAACTTCTATTTAGATAATACTGGAACACTGGTTACAGGTGATGGCTACCATGTACTAAATATGAATGGCGGAACAATTAAAATTCCNACTGATGCTNAAAGCTTTAGCATTGGTTCTGATNGAAAGGTGTCAATTGTTGATNCTgn < 1:4520752/150‑2 (MQ=255) | AAATCGGTTTAGGTTCATCATCTGGCACAATTGATACAATTCATTCAACAAGCGCGACACAAAGCACAGGAAGAACACTTGATTTAGCAATTGACGGCGACGGTTACTTCCGAATTGATACAGGTGACGGGACAGCTTATACAAGAGCAGGGAACTTCTATTTAGATAATACTGGAACACTGGTTACAGGTGATGGCTACCATGTACTAAATATGAATGGCGGAACAATTAAAATTCCTACTGATGCTCAAAGCTTTAGCATTGGTTCTGATGGAAAGGTGTCAATTGTTGATGCTGAGG > CP006881/1663416‑1663715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |