| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP006881 | 126,246 | G→A | 5.8% | V230M (GTG→ATG) | U712_00560 → | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP006881 | 126,246 | 0 | G | A | 5.8% | 1937.5 / 51.8 | 518 | V230M (GTG→ATG) | U712_00560 | DNA‑directed RNA polymerase subunit beta' |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (256/231); new base A (15/15); total (271/247) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.52e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 533 total aligned reads displayed.
AAGATATCGATCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTGCGCCTAGCATC > CP006881/126097‑126395 | aaGATATCGATCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGAtg > 2:3636593/1‑150 (MQ=255) gATATCGATCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGAtgtg < 1:1619595/150‑1 (MQ=255) atatCGATCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGc > 1:701977/1‑150 (MQ=255) aacGATCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGGAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCtt > 2:3555208/3‑150 (MQ=255) cGATCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGCGCTGAAAACTTCACAAGGGCAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTCAAGTTTTAGACGCCTTCCGTAACTCAGGGAACATGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTcc > 1:3564951/1‑150 (MQ=255) aTCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTg > 2:473573/1‑150 (MQ=255) tGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTAt < 1:102243/150‑1 (MQ=255) gTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTAtt < 1:4038258/150‑1 (MQ=255) tAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATtc < 2:4588464/150‑1 (MQ=255) agaagTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATATGCTTCCTGTTATtcctcc > 1:5063189/1‑150 (MQ=255) aagTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCgg > 1:901545/1‑150 (MQ=255) gATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCtt > 2:861542/1‑150 (MQ=255) gATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCtt < 2:5613437/150‑1 (MQ=255) tatGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATATGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAg < 1:1486923/150‑1 (MQ=255) tGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGAc > 2:4420661/1‑150 (MQ=255) gTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGGAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGAcc > 1:2469186/1‑150 (MQ=255) gTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGAcc < 2:3366296/150‑1 (MQ=255) ttAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCg > 1:5579142/1‑150 (MQ=255) tAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGa < 1:3640849/150‑1 (MQ=255) aaaaGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGAt < 2:5674703/150‑1 (MQ=255) aaaaGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGAt < 2:4559949/150‑1 (MQ=255) aagaagAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGTCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATgg > 2:1338648/1‑150 (MQ=255) ataagaACTGAAAACTTCACAAGGTCAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGt > 1:5666276/3‑150 (MQ=255) agaagaGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGt > 2:4168016/1‑150 (MQ=255) agaagaGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGt < 1:1439534/150‑1 (MQ=255) agaagaGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGt < 2:4849289/150‑1 (MQ=255) agCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGc > 2:5503904/1‑150 (MQ=255) cTGAAAAATTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAAAGTCTTGAAGTTTTAGATGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGCTGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGGGCTTAGACCGATGGTTCAACTa > 2:1200269/1‑150 (MQ=255) tGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAg > 1:1201557/1‑150 (MQ=255) tGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAg > 1:3947962/1‑150 (MQ=255) tGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACATCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAg > 1:3750783/1‑150 (MQ=255) gAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGa > 2:774649/1‑150 (MQ=255) gAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGa > 2:1454437/1‑150 (MQ=255) taaaCTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGAt < 2:5228348/149‑1 (MQ=255) aaacCTTCACAAGGACAACGCCGAACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGAt < 2:1715019/150‑1 (MQ=255) aaaaCTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTCTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGAt > 1:3130984/1‑150 (MQ=255) acaAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACg < 2:4329782/150‑1 (MQ=255) aaGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGtt < 1:5324488/150‑1 (MQ=255) aaGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGtt < 1:3423542/150‑1 (MQ=255) aGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTAAGTCCGATGGTTCAGCTAGACGGCGGACGttt > 1:2746021/1‑150 (MQ=255) gACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTg > 2:3997493/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGa < 2:10905/150‑1 (MQ=255) aCGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTNCCTGTTATTNCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTNAGCTAGATGGCGGACGTTTTNCGan < 1:4521351/150‑2 (MQ=255) gCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACtt > 1:2628707/1‑150 (MQ=255) cGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCt > 1:4164727/1‑150 (MQ=255) cGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCt > 2:2371336/1‑150 (MQ=255) cGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCt < 1:2683287/150‑1 (MQ=255) gTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTg > 1:5468020/1‑150 (MQ=255) tACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGa < 1:1899660/150‑1 (MQ=255) aCTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGAt > 2:1003979/1‑150 (MQ=255) cTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGAtt < 1:1992982/150‑1 (MQ=255) cGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTg < 2:5777687/150‑1 (MQ=255) cGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTg > 2:4501653/1‑150 (MQ=255) cAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCt < 1:3767429/150‑1 (MQ=255) cAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCt > 1:811427/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCtt > 1:493568/1‑150 (MQ=255) aaaCGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATATGCTTCCTGTTATTACTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCtt < 1:4370789/150‑1 (MQ=255) aCGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTa > 2:2193785/1‑150 (MQ=255) tCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTAtcg < 2:2976441/150‑1 (MQ=255) ttGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTAtcgtc < 1:288488/150‑1 (MQ=255) tGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATATGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCAATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTAtcgtcg > 1:2239486/1‑150 (MQ=255) gTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGtc > 1:2071203/1‑150 (MQ=255) aGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCaa > 2:2701441/1‑150 (MQ=255) ccTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGAGTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTa > 1:4768299/1‑150 (MQ=255) ccTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTa > 2:3042672/1‑150 (MQ=255) ccTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTa < 2:2020533/150‑1 (MQ=255) cTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATATGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTaa > 2:166474/1‑150 (MQ=255) tCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACa < 2:1526905/150‑1 (MQ=255) tCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACa < 1:2375288/150‑1 (MQ=255) cGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAAt > 1:3469082/1‑150 (MQ=255) cGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAAt > 2:3885510/1‑150 (MQ=255) gTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACTGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATc > 1:5813405/1‑150 (MQ=255) gTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGGCCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATc > 2:2747308/1‑150 (MQ=255) gTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATc > 1:2987935/1‑150 (MQ=255) gTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATc > 1:2348212/1‑150 (MQ=255) cTCAGGAATCAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTGCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGttt < 1:4289448/150‑1 (MQ=255) cTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGttt < 1:3875698/150‑1 (MQ=255) cTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGttt < 2:4989486/150‑1 (MQ=255) cAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGa < 2:1881827/150‑1 (MQ=255) gAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAAc > 2:2802337/1‑150 (MQ=255) aaaCAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACg > 1:2331405/1‑150 (MQ=255) aaCAAGCCTTCTTGGGTGATCCTTGATGGGCTTCCTGTTATTCGTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGc > 2:3807690/1‑150 (MQ=255) aGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCttt > 1:5185924/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTg > 1:1112426/1‑150 (MQ=255) ccTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTg < 2:198144/150‑1 (MQ=255) cttcttGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTgg < 2:2456720/150‑1 (MQ=255) cttGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGAcc > 1:1355374/1‑150 (MQ=255) ggATGATCCTTGATATGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTg < 1:1836642/150‑1 (MQ=255) gatgatCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTgg > 1:3284500/1‑150 (MQ=255) atgatgCTTGATGTGCTTTCTGTTATTTGTCCGGAGCTTAGACCCATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGt < 1:5429306/150‑1 (MQ=255) atgatCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCTGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATCACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGATACGCCTTTTGGACCTTgtt < 1:4617981/150‑3 (MQ=255) atgatCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGt > 2:3131676/1‑150 (MQ=255) gatCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTgc > 2:2845219/1‑150 (MQ=255) gatCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTgc > 1:2901699/1‑150 (MQ=255) atCCTTGATATGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTgcg > 1:1748024/1‑150 (MQ=255) tCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTGTGAAACGCCTTTTGGACCTTNGTgcgc > 1:3682712/1‑150 (MQ=255) ttGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTGCGCCTa > 1:4702990/1‑150 (MQ=255) ttGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTGCGCCTa < 2:701977/150‑1 (MQ=255) tGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTGCGCCTAg > 2:5325370/1‑150 (MQ=255) gtgCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTGCGCCTAGcatc > 1:3351333/1‑150 (MQ=255) | AAGATATCGATCTTGTAAAAGAAGTTGATATGTTAAAAGAAGAGCTGAAAACTTCACAAGGACAACGCCGTACTCGTGCGATCAAACGTCTTGAAGTTTTAGAAGCCTTCCGTAACTCAGGAAACAAGCCTTCTTGGATGATCCTTGATGTGCTTCCTGTTATTCCTCCGGAGCTTAGACCGATGGTTCAGCTAGATGGCGGACGTTTTGCGACTTCTGATTTGAATGACCTTTATCGTCGTGTCATCAACCGTAACAATCGTTTGAAACGCCTTTTGGACCTTGGTGCGCCTAGCATC > CP006881/126097‑126395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |