Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 580,727 | 0 | G | T | 12.2% | 556.9 / 18.5 | 187 | intergenic (‑282/‑107) | ylcI/nohD | DUF3950 family protein, DLP12 prophage/DLP12 prophage; DNA packaging protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (102/56); new base T (2/27); total (104/83) | |||||||||||
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Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
TGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGG‑TTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGA > NC_000913/580581‑580876 | tgACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGG‑TTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGtattt > 2:3155308/1‑150 (MQ=255) gACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGG‑TTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGtattta > 1:1410647/1‑150 (MQ=255) gACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGG‑TTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGtattta < 2:3852704/150‑1 (MQ=255) 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ttcttcTTAATTTAATTTATTTTTTTAAAAAACCCCCTCAAAATAATGTAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAgctggct < 1:2145253/150‑1 (MQ=14) tcttcgcAACTCAATGTATTAATTAAAAAACCCCCCTTAAACCAACGTAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAgctggctg < 1:3586968/147‑1 (MQ=14) cgtcgtAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAACAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGa < 2:3708628/150‑1 (MQ=255) tcgtAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACa < 2:4041344/150‑1 (MQ=255) tcgtAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACa > 2:24346/1‑150 (MQ=255) 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ttAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGGGGACTGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCgg > 1:1928186/1‑150 (MQ=255) ttAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGATTTTTGGCATCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTGTTTTCCGTGGAATGTGCAAGGGAAGTCCACAAAAAGCAGCTGGCGGACATTTTCgg > 1:2142188/1‑150 (MQ=14) | TGTGACATGTAGATGATAATTATTATCATTTTGTGGGTCCTTTCCGGCGATCCGACAGGTTACGGGGCGGCGACCTCGCGGGTTTTCGCTATTTATGAAAATTTTCCGG‑TTTAAGGTGTTTCCGTTCTTCTTCGTCGTAACTTAATGTATTTATTTAAAATACCCCCTGAAAAGAAAGGAAACGACAGGTGCTGAAAGCGAGCTTTTTGGCCTCTGTCGTTTCCTTTCTCTGTTTTTGTCCGTGGAATGTGCAATGGAAGTCAACAAAAAGCAGCTGGCTGACATTTTCGGTGCGA > NC_000913/580581‑580876 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |