| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2422239 = | 178 (0.930) | 3 (0.020) | 3/266 | NT | 1.9% | coding (532/894 nt) | yfcH | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase |
| ? | NC_000913 | 2422290 = | 148 (0.800) | coding (583/894 nt) | yfcH | putative NAD‑dependent nucleotide‑sugar epimerase | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
AAGAAATTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGCATCGCCCG > NC_000913/2422141‑2422439 | aagaaATTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGt > 1:1314334/1‑150 (MQ=255) aaaTTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATc > 2:316711/1‑150 (MQ=255) aaaTTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATc > 2:2249827/1‑150 (MQ=255) aaaTTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATc > 1:1409504/1‑150 (MQ=255) aTTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTg > 1:873376/1‑150 (MQ=255) aTTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTg < 1:2420081/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCTGCTGTATCTgg < 2:2436316/150‑1 (MQ=255) ttGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTgg < 2:2543921/150‑1 (MQ=255) tgcctgccGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGACCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGc < 1:1596832/150‑1 (MQ=255) gcctgccGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGcc < 1:323924/150‑1 (MQ=255) gcctgccGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGcc < 1:256457/150‑1 (MQ=255) ctgccGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTg < 1:319874/150‑1 (MQ=255) gggCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTc > 2:1202998/1‑150 (MQ=255) gcgcAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCat < 1:555575/150‑1 (MQ=255) gcgcAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCat > 1:365822/1‑150 (MQ=255) gcgcAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCat > 2:1097076/1‑150 (MQ=255) gcAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCatat < 2:1886029/150‑1 (MQ=255) aaaGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATtg > 1:1140456/1‑150 (MQ=255) aaaGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATtg > 1:2180202/1‑150 (MQ=255) gTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATtgatg < 1:1352977/150‑1 (MQ=255) tGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATtgatga > 2:7374/1‑150 (MQ=255) aCAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGata > 2:904337/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATg > 1:2676333/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATg > 2:1432562/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATg < 1:367198/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATg < 1:640512/150‑1 (MQ=255) aaaaCGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATg > 2:2096517/1‑150 (MQ=255) aaaCGAGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTATCGGTAAAATGCTGCCGCAGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGTCAGTATCTGGCCTGGATTAATATTGATGATATgg > 1:2131314/1‑150 (MQ=255) 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ccTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATtct > 2:815579/1‑150 (MQ=255) ctgctgCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATtctc > 2:1286355/1‑150 (MQ=255) tgctgcGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTctct > 1:592854/1‑150 (MQ=255) tgctgcGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTctct > 1:567070/1‑150 (MQ=255) gctgcGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTg < 2:403741/150‑1 (MQ=255) 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cTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGcc > 1:2007551/1‑150 (MQ=255) tGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGccc < 2:3255860/150‑1 (MQ=255) gcCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCt > 2:1378760/1‑150 (MQ=255) ccGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTc > 1:708084/1‑150 (MQ=255) taTTGGCTATGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGACATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACTCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCgg < 1:1466230/149‑1 (MQ=255) 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gCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATg > 2:2341595/1‑150 (MQ=255) ctctGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATTGTCAAAGGTATTCTCTGTCTTCTGGATAACTAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTAAGCAATTAACAATTTGCCCATGCGCTAGGTCATgc < 2:2131314/150‑1 (MQ=255) ctctGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATgc > 1:1287663/1‑150 (MQ=255) tctGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATgcg > 1:1749561/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCt < 1:1872215/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCt > 1:2953520/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCt > 1:1550293/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCt < 2:2883614/150‑1 (MQ=255) ggTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTg > 2:3080200/1‑150 (MQ=255) gTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGc < 2:2888258/150‑1 (MQ=255) tCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGCa > 1:2283111/1‑150 (MQ=255) ggcagTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGCATc < 1:2132733‑M2/145‑1 (MQ=255) cagTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGCATCGc > 1:800238‑M2/4‑150 (MQ=255) cagTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGCATCGc > 2:516571‑M2/4‑150 (MQ=255) agTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGCATCGcc > 2:1549525‑M2/3‑150 (MQ=255) | AAGAAATTGCCTGCCGGGCGCAAAGTGACAAAACGCGAGTGTGCCTGCTGCGTACCGGTGTAGTGCTGGCACCGGATGGCGGTATTCTCGGTAAAATGCTGCCGCCGTTTCGTCTTGGCCTGGGCGGGCCGATTGGCTCTGGTCGGCAGTATCTGGCCTGGATTCATATTGATGATATGGTCAACGGTATTCTCTGGCTGCTGGATAACGAGCTGCGCGGGCCATTTAATATGGTTTCGCCCTACCCGGTACGCAATGAACAATTTGCCCATGCGCTCGGTCATGCGCTGCATCGCCCG > NC_000913/2422141‑2422439 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |