Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 420,941 | T→A | 5.3% | intergenic (+31/‑45) | brnQ → / → proY | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val/proline‑specific permease |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 420,941 | 0 | T | A | 5.3% | 675.4 / 20.4 | 189 | intergenic (+31/‑45) | brnQ/proY | branched‑chain amino acid transport system 2 carrier protein; LIV‑II transport system for Ile, Leu, and Val/proline‑specific permease |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (82/97); new base A (4/6); total (86/103) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.58e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.63e-01 |
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
CGTTTACCGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGAC > NC_000913/420794‑421090 | cGTTTACCGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCTCGGGGCTGc < 2:3117907/150‑1 (MQ=255) cGTTTACCGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGc < 2:2170108/150‑1 (MQ=255) tACCGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATg > 1:1294309/1‑150 (MQ=255) ccGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGcc < 1:1560910/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACAGTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCg > 2:237641/1‑150 (MQ=255) tGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGt < 2:2993825/150‑1 (MQ=255) tGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGt < 2:1001517/150‑1 (MQ=255) ggCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCATCGCAGCCCCGTg < 1:1179932/150‑1 (MQ=255) ggCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCATCGCAGCCCCGTg < 1:1199077/150‑1 (MQ=255) ggCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCATCGCAGCCCCGTg < 1:2102095/150‑1 (MQ=255) gCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTgg > 2:1171539/1‑150 (MQ=255) gCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCATCGCAGCCCCGTgg < 2:1808132/150‑1 (MQ=255) cGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑tt > 2:721428/1‑150 (MQ=255) aaCAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑tttt < 1:1257112/150‑1 (MQ=255) cAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑tttttt < 2:1572783/150‑1 (MQ=255) aaGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTa > 1:69144/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATtgtg < 2:2263404/150‑1 (MQ=255) tGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATg > 1:58399/1‑150 (MQ=255) gTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATggg > 1:1094762/1‑150 (MQ=255) ttAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGt > 2:485446/1‑150 (MQ=255) aaTGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTa > 1:1622187/1‑150 (MQ=255) aaTGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTa > 1:2543683/1‑150 (MQ=255) aaTGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTa > 1:2242091/1‑150 (MQ=255) gCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGa > 2:1208769/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGaa > 1:1985776/1‑150 (MQ=255) ccAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGaa > 1:2130279/1‑150 (MQ=255) gtggtgATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGACTTGATg > 1:2770633/1‑150 (MQ=255) ggtgATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGa < 1:1921932/150‑1 (MQ=255) gtgATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATTGaa < 2:2116358/150‑1 (MQ=255) gtgATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGaa < 2:2823144/150‑1 (MQ=255) gtgATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGaa < 2:2823235/150‑1 (MQ=255) gtgATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGaa < 2:3036304/150‑1 (MQ=255) aTGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGt < 1:419531/150‑1 (MQ=255) gtggtTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAg < 1:450969/150‑1 (MQ=255) tggtTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGa < 1:916842/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACa > 1:1297297/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACa > 2:1396734/1‑150 (MQ=255) tCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACaa < 2:115014/150‑1 (MQ=255) cTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAg < 1:2420053/150‑1 (MQ=255) tGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGc > 1:2345941/1‑150 (MQ=255) ggCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTGTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGACTTGATGGAAAGTAAGAACAAGCt > 1:1583266/1‑150 (MQ=255) gCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTa > 1:1706195/1‑150 (MQ=255) gCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTa < 1:2193164/150‑1 (MQ=255) ccATTATCTGTGATCGCGCGGCAGCTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTTAACATTTGTTTTAACAACGTGGCTGAGATGACCCGTGG‑ATTTTTATTGTGTTTATGGGGTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAAAAAGCTaa > 2:1943701/1‑150 (MQ=255) ccATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTaa > 1:2899965/1‑150 (MQ=255) ggATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATGTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGCTGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCt > 2:1320075/1‑150 (MQ=255) aTCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTaa < 2:2718651/150‑1 (MQ=255) gcgGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTAcc > 2:586664/1‑150 (MQ=255) cgGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTAccc > 1:928856/1‑150 (MQ=255) aGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCca < 1:382448/150‑1 (MQ=255) gtcAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATAc > 2:2317995/1‑150 (MQ=255) gtcAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATAc < 1:1056701/150‑1 (MQ=255) gtcAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATAc > 2:605638/1‑150 (MQ=255) gtcAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATAc > 1:2272368/1‑150 (MQ=255) cAGGTGACCTCCATAGATCTATAAATCACTGAACTTTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCGGTGT‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGATTTGATGTAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGTCTAAGTACCCGCCACATACGc < 1:721428/150‑1 (MQ=255) tGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTa < 1:843218/150‑1 (MQ=255) tGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTa < 1:2580327/150‑1 (MQ=255) tGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACAGTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTGTTTATTGGGTTGCTGGGTTAGGAAGTGAGGGACAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCtttc > 2:2224616/1‑149 (MQ=255) aCCTCCAGCGCTCACTAACTCACTGAACATTTGTGTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑ATTTTTCTTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTATGTACCCGCCACATACGCTTTATg < 1:2213206/150‑1 (MQ=255) aCCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATg < 1:1408293/150‑1 (MQ=255) ccTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATgg > 2:1627636/1‑150 (MQ=255) tCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTCACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCa < 2:2875782/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCGTTATGGCa > 1:477689/1‑150 (MQ=255) ccAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCAc < 2:2625463/150‑1 (MQ=255) ccAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCAc > 2:553578/1‑150 (MQ=255) gcgcTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTgg < 1:2543300/150‑1 (MQ=255) cTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGtt > 2:2420451/1‑150 (MQ=255) tCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTc > 2:3129270/1‑150 (MQ=255) cACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCa < 2:2763050/150‑1 (MQ=255) cACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCa < 1:906760/150‑1 (MQ=255) cACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCa < 2:2542784/150‑1 (MQ=255) aCTAAATCACTGAACCTTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGAGGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTGTATGGCACTGGGTTCAg > 2:731187/1‑150 (MQ=255) tAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGcc > 1:3113107/1‑149 (MQ=255) aTCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAGCAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAAtt < 2:2883105/150‑1 (MQ=255) aTCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAAtt < 2:2943286/150‑1 (MQ=255) tCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTg < 2:2071441/150‑1 (MQ=255) tCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTg < 2:2066380/150‑1 (MQ=255) cTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCa < 1:1919783/150‑1 (MQ=255) cTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TGTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCAAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCCCAGACGCGTTATGGCACAGGGTTCAGCACATGGCa > 1:2517968/1‑150 (MQ=255) gAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTTATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTTGCAcc > 1:2988907/1‑150 (MQ=255) gAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGTTGGGTTTGGAATTGTTGGAAAGTAAGAACAAGCTAAATCGTGGGCGAAGTACCCGCCACAAACCCGGTATGGCACTGGGTTCAGCAAATGGCAcc > 1:553206/1‑150 (MQ=255) aattGTTTAAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGGGTTGATGGGATAGGAATTGATGGACAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCACTTGGCACCGGGc > 2:2425702/3‑150 (MQ=255) tttGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGTCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCt < 2:1647438/150‑1 (MQ=255) tttGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCt > 1:1822975/1‑150 (MQ=255) tttGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCt > 1:745091/1‑150 (MQ=255) tgtGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCt < 2:2214742/148‑1 (MQ=255) ttGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTTTGTTGTTTGGTTAGGAATTTATGGAAAGTAAGAAAAAGCTAAAACCTGGGCTAAGTAACCCCCACAAAACCGTTATTGCACAGGGTTAAGCAATTGGCACCGGGCTg > 1:1479479/1‑150 (MQ=255) ttAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTa < 2:907514/150‑1 (MQ=255) aaaCCACGGGGCATCGCAGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAAATGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTAACCGCCACAAAAGCGTTATGGCACAGGGTTCAGCCATTGGCACCGGGCTGTTTTAc > 1:2843084/2‑150 (MQ=255) aaCCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACg < 2:1544206/150‑1 (MQ=255) aaCCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACg < 1:1336451/150‑1 (MQ=255) cACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTTTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTAACCGCCACAAACGCTTTATGGCACAGGGTTCAGCAAATGGCACCGGGCTGTTTTAAGGtt > 1:2812088/1‑150 (MQ=255) cACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATGGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGtt > 2:1862602/1‑150 (MQ=255) aCGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCCCAAACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTc > 1:2016831/1‑150 (MQ=255) aCGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCCCCGGGCTGTTTTACGGTTc > 1:2016835/1‑150 (MQ=255) aCGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTc < 2:1083566/150‑1 (MQ=255) tGCGATGCCCCGTGGTTTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGa > 2:437775/1‑150 (MQ=255) tGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGAc > 2:280413/1‑150 (MQ=255) tGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGAc > 2:2351582/1‑150 (MQ=255) tGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGAc < 1:208974/150‑1 (MQ=255) | CGTTTACCGCTGGCCGAACAAGGTCTGGCGTGGTTAATGCCAACAGTGGTGATGGTGGTTCTGGCCATTATCTGGGATCGCGCGGCAGGTCGTCAGGTGACCTCCAGCGCTCACTAAATCACTGAACATTTGTTTTAACCACGGGGCTGCGATGCCCCGTGG‑TTTTTTATTGTGTTGATGGGTTAGGAATTGATGGAAAGTAAGAACAAGCTAAAGCGTGGGCTAAGTACCCGCCACATACGCTTTATGGCACTGGGTTCAGCAATTGGCACCGGGCTGTTTTACGGTTCGGCAGAC > NC_000913/420794‑421090 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |