| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4209883 = | 20 (0.060) | 5 (0.020) | 3/256 | NT | 10.1% | intergenic (+34/‑160) | gltV/rrlE | tRNA‑Glu/23S ribosomal RNA of rrnE operon |
| ? | NC_000913 | 4209923 = | 71 (0.220) | intergenic (+74/‑120) | gltV/rrlE | tRNA‑Glu/23S ribosomal RNA of rrnE operon | |||||
GAAAGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTAATATCTCAAAACTCATCTTCGGGTGATGTTTGAGATATTTGCTCTTTAAAAATCTGGATCAAGCTGAAAATTGAAACACTGAACAACGAAAGTTGTTCGTGAGTCTCTCAAATTTTCGCAACACGATGATGAATCGTAAGAAACATCT > NC_000913/4209734‑4210031 | gAAAGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTa > 1:5710375/1‑150 (MQ=31)gAAAGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTa > 2:3552776/1‑150 (MQ=31)gAAAGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTa > 2:77974/1‑150 (MQ=31)gAAAGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTa > 2:77918/1‑150 (MQ=31)atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaa < 1:2300769‑M1/1‑1 (MQ=255)atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaa < 2:3292256‑M1/1‑1 (MQ=255)atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaa > 2:1097619‑M1/150‑150 (MQ=255)atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaa > 1:304828‑M1/150‑150 (MQ=255)atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagacaaacgaaaaactatcgttgttcagtgtttcaattttaagctttctccagatttttaaagatcaa < 1:4170420‑M1/1‑1 (MQ=255)atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagaagtttcttacgatacatcatcgtgatgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaa < 2:4282330‑M1/1‑1 (MQ=255)atccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcaaaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaa < 1:2199291‑M1/1‑1 (MQ=255) tccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaaa > 1:4359950‑M1/149‑150 (MQ=255) tccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaaa < 1:2608933‑M1/2‑1 (MQ=255) tccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaaa > 2:5769825‑M1/149‑150 (MQ=255) tccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactgtcgttggtcagtgtttcaattttcagcttgatccagattttgaaagagcaaa < 1:2602555‑M1/2‑1 (MQ=255) aaaGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACCGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTaa < 1:771905/150‑1 (MQ=11) aaaGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTaa < 2:2996257/150‑1 (MQ=11) aaaGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTaa < 2:5805452/150‑1 (MQ=11) aaaGTGAAAAGCAAGGCGTCTTGCGAAGCAGACTGATACGTCCCCTTCGTCTAGAGGCCCAGGACACCGCCCTTTCACGGCGGTAACAGGGGTTCGAATCCCCTAGGGGACGCCACTTGCTGGTTTGTGAGTGAAAGTCACCTGCCTTaa < 2:343610/150‑1 (MQ=11) ccaccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAat > 1:3104136‑M1/148‑150 (MQ=255) ccaccgtgtacgcttagtcgattaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAat > 1:3104035‑M1/148‑150 (MQ=255) caccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaCata < 2:4839185‑M1/4‑1 (MQ=255) caccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAata > 2:5167093‑M1/147‑150 (MQ=255) caccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAata < 2:4839753‑M1/4‑1 (MQ=255) caccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAata < 1:5384627‑M1/4‑1 (MQ=255) caccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagctggatccagatttttaaagagcaAata < 1:765354‑M1/4‑1 (MQ=255) caccgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcgtgatccagatttttaaagagcaCata < 2:3719250‑M1/4‑1 (MQ=255) accgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAatat > 2:3322164‑M1/146‑150 (MQ=255) cgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtct > 1:4452760‑M1/144‑150 (MQ=255) cgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtct > 1:2533770‑M1/144‑150 (MQ=255) cgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtct < 1:2312338‑M1/7‑1 (MQ=255) cgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtct > 1:4960328‑M1/144‑150 (MQ=255) cgtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtct < 1:2310454‑M1/7‑1 (MQ=255) gtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtctc > 1:3015706‑M1/143‑150 (MQ=255) gtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtctc < 1:5769220‑M1/8‑1 (MQ=255) gtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtctc > 2:1726782‑M1/143‑150 (MQ=255) gtgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATAtctc > 1:2099651‑M1/143‑150 (MQ=255) tgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCa < 2:291408‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCa > 1:1759405‑M1/142‑150 (MQ=255) tgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCa < 1:5096778‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCa < 2:4526331‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCa < 1:3899872‑M1/9‑1 (MQ=255) tgtacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCa > 2:5329446‑M1/142‑150 (MQ=255) 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tacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCaaa > 2:1749110‑M1/140‑150 (MQ=255) tacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCaaa > 2:2909841‑M1/140‑150 (MQ=255) tacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCaaa > 1:2345334‑M1/140‑150 (MQ=255) tacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCaaa > 1:486812‑M1/140‑150 (MQ=255) tacgcttagtcgcttaacctcacaacccgaagatgtttcttacgattcatcatcgtgttgcgaaaatttgagagactcacgaacaactttcgttgttcagtgtttcaattttcagcttgatccagatttttaaagagcaAATATCTCaaa > 1:5053927‑M1/140‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |