Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 987,418 | A→T | 5.0% | intergenic (‑436/+167) | ompF ← / ← asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 987,418 | 0 | A | T | 5.0% | 796.5 / 23.7 | 230 | intergenic (‑436/+167) | ompF/asnS | outer membrane porin 1a (Ia;b;F)/asparaginyl tRNA synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (109/106); new base T (6/6); total (118/112) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.87e-01 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
TATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGG > NC_000913/987268‑987567 | atGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCaa < 2:2013514/150‑1 (MQ=255) tttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAg > 1:5340202/1‑150 (MQ=255) tttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCAAAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAg < 1:4635347/150‑1 (MQ=255) ttCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGa > 1:3453717/1‑150 (MQ=255) ccTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAAt < 2:5784087/150‑1 (MQ=255) cTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATg < 2:313538/150‑1 (MQ=255) cTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATg > 2:3558933/1‑150 (MQ=255) ttATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAATATCTTGTTTCAGTCATCCAGAATGCCATAATTTAGTATGAAAATTGTGCTATTTGCTTAGTAAATTCTATTCCGGTATTAGAATgg > 2:177430/1‑149 (MQ=255) ttATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGc < 1:843797/150‑1 (MQ=255) atatTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCgg < 1:3765456/150‑1 (MQ=255) tttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAtt < 2:5686876/150‑1 (MQ=255) tttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAtt > 2:178280/1‑150 (MQ=255) tttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAtt > 1:3580420/1‑150 (MQ=255) ttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTa < 2:3050628/150‑1 (MQ=255) ttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTa < 1:965142/150‑1 (MQ=255) ttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTa > 2:9236/1‑150 (MQ=255) ttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTa < 2:5112437/150‑1 (MQ=255) ttAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTa < 2:1956064/150‑1 (MQ=255) aaaTTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGt < 1:2802829/150‑1 (MQ=255) aaaTTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTACAGACATCCAGAATGCAAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGt < 1:2659329/150‑1 (MQ=255) aaTTAACTACCCGGAATTTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTCTGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAATAACTAATCCGCAATAAGACTGCGGATTAGtt < 2:3774096/150‑1 (MQ=255) ttAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGtttt > 1:73689/1‑150 (MQ=255) aaCTAAACGGAAAGTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGCGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGtttttt < 2:4737055/150‑2 (MQ=38) aaaCGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGcgcg > 1:2170494/1‑150 (MQ=255) aaCGGAATTTTTGTGTGTGCTGGAAACTTTAACGACCTTGCACAAAATCTTCTTTCTGACATCAATAATGCCAAAAATTAGTATTAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCATTCTTTTTGCGGTTTAGttttttcttag < 1:3904838/150‑7 (MQ=19) aaCGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTGTTTGCGCGt > 2:4165982/1‑150 (MQ=255) ggAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGcgcggtct > 1:5009841/1‑146 (MQ=255) ggAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTaaa < 2:470090/150‑1 (MQ=255) ggAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAACAGTTCATGcgcgactc > 2:1867015/1‑146 (MQ=255) gAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAAt > 2:5101506/1‑150 (MQ=255) ttttGTTTCTGATTTAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTg < 1:1295655/150‑1 (MQ=255) ttttGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCTGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTg < 2:3382788/150‑1 (MQ=255) ttttGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTg < 1:1010205/150‑1 (MQ=255) ttGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAGTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCa > 2:4228820/1‑150 (MQ=255) tttCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATg < 2:3241395/150‑1 (MQ=255) tCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAACAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTa < 2:2423022/150‑1 (MQ=255) tCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTa > 1:3684199/1‑150 (MQ=255) tCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTa > 1:761646/1‑150 (MQ=255) tCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTa < 2:946514/150‑1 (MQ=255) cTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAATTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAATAACTAATCAGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTaa > 2:4864977/1‑150 (MQ=255) ggAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCATACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTc < 1:5040382/150‑1 (MQ=255) gAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCACTAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTCAATGTTGCAATGTAATATTcg > 2:5009677/1‑149 (MQ=255) gAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTcc < 2:2972445/150‑1 (MQ=255) aaaCTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAATATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCg < 2:410033/150‑1 (MQ=255) cTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTaa < 1:5272210/150‑1 (MQ=255) tttATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAAc < 1:5738806/150‑1 (MQ=255) tttATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAAc > 1:4427934/1‑150 (MQ=255) tttATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAAc > 2:2204511/1‑150 (MQ=255) ttATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACa < 1:1772968/150‑1 (MQ=255) aTCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAgg > 2:2762895/1‑150 (MQ=255) gACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGgatg > 1:2862749/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCCATGTAATATTCCGTAACAGgatga > 1:5536219/1‑150 (MQ=255) cTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTTCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATc < 2:643400/150‑1 (MQ=255) tGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCg > 2:3958708/1‑150 (MQ=255) acaAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTAt > 1:1363872/1‑150 (MQ=255) caAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATg > 1:5702207/1‑150 (MQ=255) tcttctTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTCATATTCCGTAACAGGATGATCGTGAGGGCggg > 1:4497359/1‑150 (MQ=255) tttCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGAGGATTAGTTTTTTAGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGc > 2:4398771/1‑150 (MQ=255) tCAGACATACAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCaa < 1:4931093/150‑1 (MQ=255) aGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAAt < 2:460456/150‑1 (MQ=255) aGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGAGTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCaact > 2:1336264/1‑148 (MQ=255) cAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTACCAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGc > 1:4150779/1‑150 (MQ=255) gactGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCtt < 2:104668/147‑1 (MQ=255) gAATGCCAAAAAATAGTAAGAAAATAGAGCTATTACCTAACAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGATGCAAATAGATTGCtt < 1:2957982/150‑1 (MQ=255) aTGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGa < 1:208259/150‑1 (MQ=255) gCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACt < 2:4925308/150‑1 (MQ=255) ccAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACtt > 2:468828/1‑150 (MQ=255) cAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTa > 2:1422518/1‑150 (MQ=255) cAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTa > 1:2992908/1‑150 (MQ=255) cAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTa < 2:2332088/150‑1 (MQ=255) aaaaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaa < 1:3231158/150‑1 (MQ=255) aaaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaac < 1:3729633/150‑1 (MQ=255) aaaaTAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaaca > 1:1221144/1‑150 (MQ=255) tAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTaacaaaca < 1:4271048/150‑1 (MQ=255) tATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGAAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATATATTGCTTGACTAAACAAACAGAt > 1:1569447/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGGTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACt > 2:4800594/1‑150 (MQ=255) aaaTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACtt > 2:388131/1‑150 (MQ=255) aTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGa < 1:615403/150‑1 (MQ=255) aTTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGa < 1:5101506/150‑1 (MQ=255) tATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGacaa > 2:4019547/1‑150 (MQ=255) tATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGaaaa < 2:3567237/150‑1 (MQ=255) gCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCTATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaa < 2:2537575/150‑1 (MQ=255) gCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaa < 2:73689/150‑1 (MQ=255) tAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaa > 1:4584773/1‑150 (MQ=255) tAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaa > 2:1279060/1‑150 (MQ=255) aaGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaa < 1:4300278/150‑1 (MQ=255) aGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaa < 2:2480574/150‑1 (MQ=255) gAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTTCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaaa < 1:178200/150‑1 (MQ=255) gAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaaa < 2:1461197/150‑1 (MQ=255) gAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATaaaaaaa < 1:178280/150‑1 (MQ=255) aaaaCTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAACGATAAAAAAagag > 2:5490131/1‑150 (MQ=255) tAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGTTTTTTCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGc > 1:1451514/1‑150 (MQ=255) tAATCCGCATTCTTATTGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCACATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGc > 1:1918987/1‑150 (MQ=255) tAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTg > 1:4289124/1‑103 (MQ=255) tAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTg < 2:4289124/103‑1 (MQ=255) tCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCggg > 2:2938096/1‑150 (MQ=255) tCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCggg > 2:1661040/1‑150 (MQ=255) gCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGgcgc > 2:547560/1‑150 (MQ=255) aaTAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTg > 2:5365306/1‑150 (MQ=255) aTAAGATTGCGGATTAGTTTTTGCTTTTAATTGTTGATTTTTATTTTTCCGTAACTGGTTTCTGGTTTTGGCGGGTTTGAAAATTTTTTGCTTGAGTTAACAAACTCATAACTTTACTTAAAATATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTgg < 1:4062167/150‑1 (MQ=255) | TATGATTTCCTTATATTTAAATTAACTAAACGGAAATTTTGTTTCTGATGGAAACTTTATCGACCTGGCACAAAATCTTCTTTCAGACATCCAGAATGCCAAAAAATAGTATGAAAATTGTGCTATTAGCTAAGAAAAAACTAATCCGCAATAAGAATGCGGATTAGTTTTTGCGCGTAAATGTTGCAATGTAATATTCCGTAACAGGATGATCGTTATGGCGGGGTTGCAAATAGATTGCTTGACTTAACAAACAGATAACTTGACAGAAAAGATAAAAAAAGAGCCAGCGGGCGCTGG > NC_000913/987268‑987567 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |