| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,229,322 | C→G | 5.1% | intergenic (+257/+116) | yohP → / ← dusC | uncharacterized protein/tRNA‑dihydrouridine synthase C |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,229,322 | 0 | C | G | 5.1% | 874.8 / 30.9 | 263 | intergenic (+257/+116) | yohP/dusC | uncharacterized protein/tRNA‑dihydrouridine synthase C |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (121/127); new base G (6/8); total (128/135) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 264 total aligned reads displayed.
CGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCC > NC_000913/2229174‑2229471 | agggggcggcggcGATTGGCCGCC‑CCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCa > 2:2652861/8‑150 (MQ=11) cAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCAt < 2:839590/150‑1 (MQ=32) cAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCAt < 2:2762301/150‑1 (MQ=32) cAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCAt < 2:3739353/150‑1 (MQ=32) gggggCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCAtgt < 2:3571350/150‑1 (MQ=32) gggCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTgg < 1:4162334/150‑1 (MQ=32) gggCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTgg < 2:5304135/150‑1 (MQ=32) gggCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCAAGTgg > 1:4590732/1‑150 (MQ=17) gcggcCCATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGGGGGc > 1:1354996/1‑150 (MQ=17) gcggcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATGGATGTGGGc < 2:40298/150‑1 (MQ=17) gcggcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGc < 2:1823323/150‑1 (MQ=32) gcggcCAATCGCCGACGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGc > 2:2557424/1‑150 (MQ=17) cggcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATGGATGTGGGCt < 1:1106788/150‑1 (MQ=17) cggcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCt < 2:2931458/150‑1 (MQ=32) ggcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTg > 2:233723/1‑150 (MQ=32) ggcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTg > 2:1285494/1‑150 (MQ=32) ggcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTg > 2:731846/1‑150 (MQ=32) gcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATGGATGTGGGCTga < 2:1398454/150‑2 (MQ=17) gcCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGc > 2:4817930/1‑150 (MQ=32) aaTCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGcccc > 2:3038134/1‑150 (MQ=32) tCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCgg < 2:564632/150‑1 (MQ=32) tCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCgg > 1:3800221/1‑150 (MQ=32) tCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCgg > 2:640049/1‑150 (MQ=32) cgccgccgcCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGc < 1:4802703/150‑1 (MQ=32) cgccgccgcCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGc < 1:3563137/150‑1 (MQ=32) gccgccgccCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACCTCCATGTGGGCTGCCCCGGcc > 2:2306870/1‑150 (MQ=17) ccgccgccCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCt > 2:5464041/1‑150 (MQ=32) cgccCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAg < 2:2432815/150‑1 (MQ=32) gccCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAgg > 1:5267875/1‑150 (MQ=32) cccccTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAggg < 2:5557765/150‑1 (MQ=32) cccTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGaa < 1:5213268/150‑1 (MQ=32) cTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACg < 1:1893405/150‑1 (MQ=32) ccccGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCgg > 2:4239404/1‑150 (MQ=32) cGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGACCCGGCCTTCAGGGACCGCCTCGGCaa > 2:4431435/1‑150 (MQ=18) cGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTAACCCTTACGGCAACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCAGAAAAAAGCGCCCTCAGCCCACATCCAAGTGGGCTGCCCCGGCCATCAGGGAACGCCTCGGCaa > 2:2176806/1‑150 (MQ=11) ggCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTCTCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCGTCAGGGACCGCCTCGGCaagt > 2:1083316/1‑148 (MQ=255) ggCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACCTCCATGTGGGCTGCCCCGGCCGTCAGGGAACGCCTCGGCAAtt > 2:1082983/1‑150 (MQ=21) gCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATACCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCCTGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAttt > 2:1497448/1‑150 (MQ=21) tctGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 2:52331/1‑150 (MQ=34) tctGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCGCGGCTTATCCCGTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGGAACCTCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCCCATCCAAGTGGGCGGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCGCGGCAAgtttt > 1:2551734/1‑149 (MQ=11) ctGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGa < 1:1121717/150‑1 (MQ=34) gCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGc > 2:1371493/1‑150 (MQ=34) gCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCGTATACCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAAGCGCCCTCAGCCCACAACCAAGTGGGCTGCCCCGGCCGTCAGGGACCGCCTCGGCAATTTTGTCGc > 1:4904253/1‑150 (MQ=11) cGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGcc < 1:72078/150‑1 (MQ=34) cGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCGCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCACAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGcc > 1:160640/1‑150 (MQ=21) gAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCTGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGcca < 1:1013361/150‑1 (MQ=21) gAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGcca < 1:1013463/150‑1 (MQ=34) gAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGcca < 1:1800289/150‑1 (MQ=34) aaCAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCGTATACCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCACACCCCACCTACAAGTGGGCTGCCCCGGCCGTCAGGGAACGCCGCGGCAATTTTGTCGccac > 1:4972128/1‑150 (MQ=11) cAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGccacca < 2:1400340/150‑1 (MQ=34) aaaaTCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCaa > 2:4349016/1‑150 (MQ=34) aaaTCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCaaa < 2:3286518/150‑1 (MQ=35) aTCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAaaca < 2:3976888/150‑1 (MQ=37) tCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAaacaa > 2:3086019/1‑150 (MQ=38) cgccgcTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAaacaac < 2:3239935/150‑1 (MQ=38) tGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCg > 2:1732053/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTTCGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCTTGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGc < 1:735664/150‑1 (MQ=255) gTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTAt < 1:3704277/150‑1 (MQ=255) tCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATaa > 2:2260101/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATaa > 1:3235788/1‑150 (MQ=255) tCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATaa < 2:2544659/150‑1 (MQ=255) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAag < 1:4668265/150‑1 (MQ=255) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAaga > 1:3285707/1‑150 (MQ=255) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAaga < 1:5578571/150‑1 (MQ=255) tATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCt < 2:5189293/150‑1 (MQ=255) tATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCt > 1:667688/1‑150 (MQ=255) aTCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTa > 1:5373354/1‑150 (MQ=255) tCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTaa < 1:585348/150‑1 (MQ=255) tcTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAaca < 2:5277099/149‑1 (MQ=255) cTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAGTTTGACGCCCCCAAACAACCGTGCGGCCTAGTGATAAAGAGCTAacac > 2:1985614/1‑150 (MQ=255) ttACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAAcaca > 1:2319120/1‑150 (MQ=255) aCGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACAtt < 2:5330012/150‑1 (MQ=255) gCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTc < 2:3852440/150‑1 (MQ=255) aCCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCaaa < 2:4964080/150‑1 (MQ=255) ccGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCaaaa < 1:2800731/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACAt < 1:3000824/150‑1 (MQ=255) tCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACAt < 1:3001051/150‑1 (MQ=255) gggCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCAGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCa < 1:409514/150‑1 (MQ=255) gcgAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTAt < 1:5780198/150‑1 (MQ=255) tAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGtttt > 1:5106847/1‑150 (MQ=255) tAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGtttt > 1:885510/1‑150 (MQ=255) aaCATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGttttt > 1:2768898/1‑150 (MQ=255) cATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTa > 1:1450701/1‑150 (MQ=255) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCTCATGCATGTGGTCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACTCCAACAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTATCACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTaga < 1:2176806/150‑1 (MQ=25) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTaga < 1:5570940/150‑1 (MQ=255) ccccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCCTGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTaga < 1:1567925/149‑1 (MQ=255) tGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGttt > 1:1630876/1‑150 (MQ=255) aaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCg < 1:2608610/150‑1 (MQ=255) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGCTAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGa < 1:2652181/150‑1 (MQ=255) gcgcCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGatat > 2:5720781/1‑150 (MQ=255) gcgcCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACAACACTATGGTTTTTTAGAGTTTATCGatat > 1:2856421/1‑150 (MQ=255) gcCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCa < 1:1510465/150‑1 (MQ=255) aGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGcc < 2:758607/150‑1 (MQ=255) gCCCACATGGATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCt > 2:1237883/1‑150 (MQ=255) gCCCACATGGATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCt > 1:212528/1‑150 (MQ=255) gCCCACATGGATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCt > 2:3391933/1‑150 (MQ=255) gCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCt < 1:4335131/150‑1 (MQ=255) cccACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTg > 2:3345483/1‑150 (MQ=255) caTCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATa < 1:5639907/150‑1 (MQ=255) caTCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATa < 1:1294562/150‑1 (MQ=255) | CGCAGGGGGCGGCCAATCGCCGCCGCCCCCTGCACCCCCGGGCTCTGGCGAACAAAATCGCCGCTGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGCCACCAAACAACCGTGCGGCCTATTGATAAAGAGCTAACACATTGTCAAAAAACATCACTATGGTTTTTTAGAGTTTCTCGATATCAATTGCCTGAATAGCC > NC_000913/2229174‑2229471 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |