| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 521828 | 87 (0.960) | 5 (0.060) | 5/258 | NT | 5.5% | coding (1413/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease |
| ? | NC_000913 | = 521858 | 90 (1.060) | coding (1443/2415 nt) | ybbP | putative ABC transporter permease | |||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
GCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATC > NC_000913/521680‑521976 | gctggATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTG < 1:1480567‑M1/149‑1 (MQ=255) ggATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGCCGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCCGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCC‑‑‑CTGCTGCTGgtt > 2:1330306/1‑148 (MQ=255) ggATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGgtg > 2:1383904/1‑149 (MQ=255) gATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGgtgt > 1:1238238/1‑149 (MQ=255) aTGCTGCTGAATGGACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGGCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGtt < 1:41009/149‑1 (MQ=255) ctgctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGGTGCg > 2:1052518/1‑149 (MQ=255) tgctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGt > 2:51526/1‑149 (MQ=255) tgctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGt > 2:1451221/1‑149 (MQ=255) tgctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTGATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGt > 2:866705/1‑149 (MQ=255) gctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTg > 1:1366303/1‑149 (MQ=255) ctgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTgg > 2:250787/1‑149 (MQ=255) tgAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGccagcggtcgag > 2:1378482‑M1/1‑137 (MQ=255) aaTGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGa > 2:35390/1‑149 (MQ=255) aaTGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGa > 2:29248/1‑149 (MQ=255) aTGTTCTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGGGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGAt < 1:659308/149‑1 (MQ=255) cgcATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGGTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCGCTCCTTTATTCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGGTGCTTGTCGATCTGCTCGACCg > 2:910218/1‑149 (MQ=255) cATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCGCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCt > 1:478943/1‑149 (MQ=255) tGAAACCGCAGCCGCGGCCCCTGGGGGGTAGCCGCCTGTTACGTCACCCCGGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcag < 1:132544‑M1/149‑37 (MQ=255) 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tcCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACa > 1:1174099/1‑149 (MQ=255) tcCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACa > 2:756592/1‑149 (MQ=255) cTTTTTGCTGCTGGCA‑‑‑CTCCTTCTGGCGTTGCGTTCCGATCTGCTCTACCGCTGCCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGACCACCTTTTTAATTATCATCGCCTCAGAAGTGGAAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATc < 1:1075765/149‑1 (MQ=255) cTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATc > 1:634493/1‑149 (MQ=255) cTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATc < 1:130915/149‑1 (MQ=255) ttATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCATCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAg > 1:155206/1‑149 (MQ=255) ttATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAg > 1:1208964/1‑149 (MQ=255) aaTGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCGGCTGCGGTTGCGTGGCGCGCGGCCCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGACAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTGCCTCGCGGAACATCAGa < 2:271940/148‑1 (MQ=255) tgctgcTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGAGATCTGCTCGACCGCTTGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCTCAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATa < 1:1348179/149‑1 (MQ=255) tgctgGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACCTCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTc < 1:1280129/149‑1 (MQ=255) gctgGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTcc < 2:1347314/149‑1 (MQ=255) ctgGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTccc > 2:739420/1‑149 (MQ=255) ctgGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTccc < 2:425855/149‑1 (MQ=255) tgGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCg < 1:1526847/149‑1 (MQ=255) tgGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCg < 2:1238238/149‑1 (MQ=255) ggCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCgg > 2:1478039/1‑149 (MQ=255) a‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAAt > 1:1361883/1‑149 (MQ=255) ctgctgctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATc < 1:1383904/149‑1 (MQ=255) ctgctgctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATc < 1:945795/149‑1 (MQ=255) tgctgctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcgattt < 1:1378482‑M2/149‑112 (MQ=255) gctgctgccagcggtcgagcagatcgccacgcaacaccagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcgatttc > 2:853821‑M1/1‑7 (MQ=255) gctgctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGcagcagcagcagtgccagcagcataaaggagagcgaaaatgccgaaagctgacttaacgttgaccacggctgacgtaacaggcggctaaccgccaggcgcagaggcagcgat < 1:349728‑M2/149‑113 (MQ=255) tgctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAAATACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGttt > 1:747083/1‑149 (MQ=255) gctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGtttt < 1:463726/149‑1 (MQ=255) gctgGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGAAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGtttt < 1:250787/149‑1 (MQ=255) ggTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAACGCCCGAACTACTTTATAATTAACATCGCCACAGCACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGCTAGTCCCGGAATCGTTTTATc > 2:904684/1‑149 (MQ=255) ggTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATc < 1:756592/149‑1 (MQ=255) | GCTGGATGCTGCTGAATGTACTTCGCCGCATGACGCTGAAATCGCTGCCTCTGCGCCTGGCGGTTAGCCGCCTGTTACGTCAGCCGTGGTCAACGTTAAGTCAGCTTTCGGCATTTTCGCTCTCCTTTATGCTGCTGGCA‑‑‑CTGCTGCTGGTGTTGCGTGGCGATCTGCTCGACCGCTGGCAGCAGCAGCTACCTCCAGAAAGCCCGAACTACTTTTTAATTAACATCGCCACAGAACAGGTAGCACCGCTAAAAGCGTTCCTCGCGGAACATCAGATAGTCCCGGAATCGTTTTATC > NC_000913/521680‑521976 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |