New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2250781 = | 70 (0.770) | 5 (0.060) | 4/256 | NT | 7.3% | intergenic (+15/‑59) | yeiH/nfo | UPF0324 family inner membrane protein/endonuclease IV with intrinsic 3'‑5' exonuclease activity |
? | NC_000913 | 2250833 = | 62 (0.740) | intergenic (+67/‑7) | yeiH/nfo | UPF0324 family inner membrane protein/endonuclease IV with intrinsic 3'‑5' exonuclease activity |
TGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGC > NC_000913/2250633‑2250928 | ttgcgtcgtgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggac < 1:1094661‑M1/1‑1 (MQ=255) ggggTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCGGGGGCGTAACCTCAGCTGATGGCACAGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGGGCGATTAACTTTGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGc < 1:565311/148‑1 (MQ=255) gcgtcgtgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTc > 1:692084‑M1/147‑149 (MQ=255) gTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTcc > 1:378112/1‑149 (MQ=255) tCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCt < 1:53092/149‑1 (MQ=255) tGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCGGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGt < 1:361667/149‑1 (MQ=255) ggaggaatCACGTTAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAAGCTCTGCTTATGGCAGTGGTACTGTTTGCCTGTCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCTTAAACCACTACATCTTGCTCCTGt < 2:9832/142‑1 (MQ=255) gtgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGtt < 1:306541‑M1/8‑1 (MQ=255) tgagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTa < 2:1508971‑M1/9‑1 (MQ=255) aCCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTa < 2:889343/149‑1 (MQ=255) gagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTaa > 1:101047‑M1/140‑149 (MQ=255) gagcggtgcggcacgccactgacgttggtttttggtgaacaaggcaaacgcggtggcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTaa > 1:95993‑M1/140‑149 (MQ=255) cTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAAccc > 1:1166952/1‑149 (MQ=255) cTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAAccc < 2:900785/149‑1 (MQ=255) tCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCg > 1:969151/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCAtt > 1:1216437/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTGAAAAAAGCTGCGGCCAAACCTCTGCTGATGGCACTGGAACACTTAGCCTCGATGATAGAAGGAGGAGGTGCGATTATCTATGTGATTGCAAGCGACATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCaat > 1:1061343/1‑147 (MQ=255) gcTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCg > 2:1197463/1‑149 (MQ=255) aaaaaaGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGtttt < 2:520177/149‑1 (MQ=255) aaaaaaGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGAAGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGtttt < 2:65132/149‑1 (MQ=255) aaaaaGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACAGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGGCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTtc < 1:479881/149‑1 (MQ=255) gtttttggtgaacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAg < 2:819955‑M1/37‑1 (MQ=255) tGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCAGTACCGTTTTCCTCCAGc > 2:1030976/1‑149 (MQ=255) 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aaCCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGAGTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATGGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGATAACCCGCTATCATTACCGGTTTCCTCCAGCGGGTTTaa < 2:492508/149‑1 (MQ=255) aacaaggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAAc < 2:828497‑M1/47‑1 (MQ=255) ccTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACa < 1:1197463/149‑1 (MQ=255) ctctGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAg > 2:1094661/1‑149 (MQ=255) ctctGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAg > 2:808111/1‑149 (MQ=255) cgctgctgATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTTATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGAGTCATCGAATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAg < 2:1540006/147‑1 (MQ=255) tctGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAgg > 2:629962/1‑149 (MQ=255) ctgctgATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGa < 2:477440/149‑1 (MQ=255) aggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGa > 1:819955‑M1/99‑149 (MQ=255) ggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAg > 1:828497‑M1/98‑149 (MQ=255) ggcaaacgcggttgcgtcgatttcggcggcgcgaattgcggcatttgccagaccgccagcagcactaacgtgcgctccaatgtatttcatgcgaggaCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAg > 1:1381882‑M1/98‑149 (MQ=255) gATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTTGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATAGCATAAAACACTACATCTTGCTCCTTTTAAACCTCAATCATTACAGTTTTAATCCACCGGCATTAACAGGAgaaaa > 1:38379/1‑145 (MQ=255) gATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTcat > 1:1126678/1‑147 (MQ=255) aTGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTATCCCGCTATCATTACCGTTTTCATCCAGCGGGTTTAAGAGGAgtcgtc > 1:668506/1‑149 (MQ=255) aCTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATg > 2:364283/1‑149 (MQ=255) 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tCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCTTTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCACTTCGCGACGCCGa > 2:1035191/1‑149 (MQ=255) tCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGa > 1:214071/1‑149 (MQ=255) gCATAACCCACTACATCTTGCTCCTGTTACCCCGCGATCATTACCGATTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGACATAAATTGCATCGCCAGTTAGTGCGACTGACGTTCTGGCAAAGGCCTCAATTCGCGCCGCCTaaa > 2:1446681/1‑149 (MQ=255) aTAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATc > 2:657315/1‑149 (MQ=255) ccACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGc < 1:1255642/149‑1 (MQ=255) cATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACcgc > 2:306541/1‑149 (MQ=255) ttGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGttt < 2:503377/149‑1 (MQ=255) ttGCTCCCGTTAAACCGCCAACAATACCGGTTTCCTCCCGCGGGGTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGttt < 1:449611/149‑1 (MQ=255) gCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTgg > 1:1130109/1‑148 (MQ=255) gCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGc < 2:1216437/149‑1 (MQ=255) gCTCCTCTTATCCCGCCATCTTTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTATCAGGAGTCCTCGCTTGTATTACATTGGAGCGAACGGTAGGGCGGCTGGCGGTCTCGCATATGCCGCTATTCGCGCCGCCGCAATCGACGCAAGCGGGTTTGc < 2:1061343/149‑1 (MQ=255) | TGGGTCTGACCACTCACGTCAGCGCGCTGAAAAAAGCTGGGGCGAAACCTCTGCTGATGGCACTGGTACTGTTTGCCTGGCTGATTGTTGGTGGTGGTGCGATTAACTATGTGATTCAAAGCGTCATCGCATAAACCACTACATCTTGCTCCTGTTAACCCGCTATCATTACCGTTTTCCTCCAGCGGGTTTAACAGGAGTCCTCGCATGAAATACATTGGAGCGCACGTTAGTGCTGCTGGCGGTCTGGCAAATGCCGCAATTCGCGCCGCCGAAATCGACGCAACCGCGTTTGC > NC_000913/2250633‑2250928 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |