Predicted mutation | |||||||
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JC JC | NC_000913 | 2,375,828 | IS186 (+) +4 bp | 100% | coding (132‑135/963 nt) | menC ← | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 2375828 = | 0 (0.000) | 62 (0.710) | 51/268 | NT | 100% | coding (135/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
? | NC_000913 | = 2515617 | NA (NA) | noncoding (1345/1345 nt) | IS186 | repeat region | |||||
* | ? | NC_000913 | = 2375831 | 0 (0.000) | 70 (0.800) | 55/268 | NT | 100% | coding (132/963 nt) | menC | O‑succinylbenzoyl‑CoA synthase |
? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region |
CATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGACT > NC_000913/2515471‑2515764 | cATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATa < 1:565050/149‑1 (MQ=11) aTCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATaa > 1:1314964/1‑149 (MQ=31) cTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTTACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCCCCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGGTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTAGGGGATAAtt > 2:899795/1‑149 (MQ=255) cTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAAtt > 1:1538585/1‑149 (MQ=32) gAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTccc > 1:674753/1‑149 (MQ=21) aGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTCTCCCTGACAGCCTACAACACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTcccc < 1:1002508/149‑1 (MQ=21) gCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCg < 1:1195145/149‑1 (MQ=34) gCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCg < 2:216760/149‑1 (MQ=34) tACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTAATGGGATAATTCCCCGG‑tt > 1:452705/1‑149 (MQ=37) aCAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAATAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑ttt < 2:1054509/149‑1 (MQ=38) aGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCACTGACAGCCTACAATACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑ttttt > 1:1202537/1‑149 (MQ=255) gTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCAGG‑ttttttt > 1:1327985/1‑149 (MQ=255) tGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTa < 2:636247/149‑1 (MQ=255) ccATTCGTGTGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGGGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTATTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGc < 2:1437286/149‑1 (MQ=255) ccATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGc > 1:1077639/1‑149 (MQ=255) ccATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATAGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGc < 2:25521/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGTAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCt < 2:1105016/149‑1 (MQ=255) aTTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCt > 2:403250/1‑149 (MQ=255) tCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGt < 2:973097/149‑1 (MQ=255) tGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAACCGCAATTGAAGCACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTACCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTaa > 2:1481164/1‑149 (MQ=255) ggACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATc < 1:726936/149‑1 (MQ=255) gACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTACGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCa < 2:947100/149‑1 (MQ=255) gACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCa < 1:1554509/149‑1 (MQ=255) cAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGc < 2:661182/149‑1 (MQ=255) tATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTaa < 1:693776/149‑1 (MQ=255) tCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACTCCTGTTAATCAGCTAATg > 2:1453593/1‑149 (MQ=255) cccTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATgg < 1:1523640/149‑1 (MQ=255) cccTGACAGCCTACAAAACGCAATAGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATgg < 1:1030881/149‑1 (MQ=255) tGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCCTCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTTGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTACCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTCTTAATCTGCTAATGGCTg > 1:313781/1‑149 (MQ=17) tGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTg > 1:469889/1‑149 (MQ=255) aCAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCg < 2:825717/149‑1 (MQ=255) aCAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCg < 2:1283626/149‑1 (MQ=255) cAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg < 1:713918/149‑1 (MQ=255) cAGCCTACAAAACGCAATAGCAGAACGCGCGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCgg < 1:1464094/149‑1 (MQ=255) aGCCTACAAAAGGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGGCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCggg < 2:1312534/149‑1 (MQ=255) gCCTACAAACCGCAATAGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCCTCAGATGGGTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGc < 2:1362249/149‑1 (MQ=255) gCCTACAAAACCCAATTGAAGAACGCGATGCATCGTCTTAACGAGTCACCGAGGCTTCGCATTCTTCAGATTGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTTATCAGCTAATGGCTGCGGGc < 2:285248/149‑1 (MQ=18) cTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGa > 1:1423495/1‑149 (MQ=255) tACAATACGCAATTGATGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGGGCACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGGTTTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGa < 1:29054/149‑1 (MQ=18) tACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGAc > 1:375163/1‑149 (MQ=255) cGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCACCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCaa > 1:767230/1‑149 (MQ=255) cGCAATTGAAGAACGCCAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCGTAAGTTAGCGCTTATGGGATAAGTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTACTAAGCTAATGGCTGCGGGCGACCACTcta > 2:323030/1‑147 (MQ=18) ccaatacaagacCGCGAGGCATCGGCTTAACTAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCaaa < 1:1570027/142‑1 (MQ=21) 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ttctttAGATGGTTCAACACTTTTGTTAGGGCTTATTGTATAATTCGTCTG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTATTGGCTGCTGGCGACCAATCAATTTCGCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCGTATGCAATAGCGCctgctgctg < 2:854943/149‑1 (MQ=255) tcttcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGt < 1:439162/149‑1 (MQ=255) tcAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATATTTCCCCGG‑TTGTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGc < 2:677878/149‑1 (MQ=255) gATGGTTCAACCCTAAAGTTCGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGtc < 1:899795/149‑1 (MQ=255) tCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGaaa > 2:707378/1‑147 (MQ=255) aaCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACaaa < 2:1423495/149‑1 (MQ=255) aCCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGCCAAAc > 1:598246/1‑149 (MQ=255) cTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTcc < 1:1370822/149‑1 (MQ=255) aGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGa < 2:1538585/149‑1 (MQ=255) cTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATATCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTc < 2:779621/149‑1 (MQ=255) cTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGCCAAACTCCGCGACCACACTc > 1:1484483/1‑149 (MQ=255) ttGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAAt < 2:1202537/148‑1 (MQ=255) gggATAATTCCCCGG‑TGTTTTTACGCCTGTTAATCAGATAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGa > 2:208365/1‑149 (MQ=255) gcgATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATAAGCTAATGTCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGAGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGCCCACAGTCAAGGa > 2:1448167/3‑149 (MQ=255) ggATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCAGACGCAATGAc > 2:1091541/1‑149 (MQ=255) gATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCACGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGACt > 1:462507/1‑149 (MQ=255) | CATCTGGAGCTTACAGGTGGCCATTCGTGGGACAGTATCCCTGACAGCCTACAAAACGCAATTGAAGAACGCGAGGCATCGTCTTAACGAGGCACCGAGGCGTCGCATTCTTCAGATGGTTCAACCCTTAAGTTAGCGCTTATGGGATAATTCCCCGG‑TTTTTTTACGCCTGTTAATCAGCTAATGGCTGCGGGCGACCAATCAAATACCCTTGCAGATATTGCACCCCGAGCTTATGCAATAGCGCCTGCTGCTGTTGCGTCTCGACAAACTCCGCGACCACACTCAATGACT > NC_000913/2515471‑2515764 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |