New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3620363 | NA (NA) | 3 (0.030) | 3/266 | NT | 100% | coding (1172/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 3620412 | 0 (0.000) | coding (1221/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
CGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAAAAAGGAACACGCGGACGGCAGCGTCACGCAGAGTCAGTTTGACGCCGTGGGCAGGCTCAGGGCACAGACGGATGCCGCAGGCAGGACAACAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAA > NC_000913/3620361‑3620560 | cGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggt < 1:1144405‑M2/149‑98 (MQ=255) aGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacg < 1:1544828‑M2/149‑102 (MQ=255) gCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacgg < 1:17279‑M2/149‑103 (MQ=255) ggCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccc < 1:952917‑M2/149‑145 (MQ=255) ggCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccc < 2:1128950‑M2/149‑145 (MQ=255) ggCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggaaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccc < 2:1437664‑M2/149‑145 (MQ=255) gCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggcccc < 1:1285419‑M2/149‑146 (MQ=255) gCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggcccc < 2:1257907‑M2/149‑146 (MQ=255) gCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctggcgtaacggtaacggatttccggccggcccgggtgacggtgcgccaccatccggcccc > 2:634779‑M2/1‑4 (MQ=255) gCTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcaaactgatacgtgtagcttaagcctgccgggattagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggcccc < 2:1275581‑M2/149‑146 (MQ=255) gCTGtcggtgatggtgatgcggtcttactcatactgatacgtctagcttaagcctgcagggtttagctgttctgtcaccagcccgtcgctgtcgtaaaggtaactgatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggcccc < 1:76688‑M2/149‑146 (MQ=255) cTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccccg < 1:1005605‑M2/149‑147 (MQ=255) cTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccccg > 2:1293369‑M2/1‑3 (MQ=255) cTGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctggtctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccccg > 2:718061‑M2/1‑3 (MQ=255) tGtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccccgg < 1:1266004‑M2/149‑148 (MQ=255) gtcggtgatggtgatgcggtctttctcatactgatacgtgtagcttaagcctgccgggtttagctgttctgtcacccgcccgtcgctgtcgtaacggtaacggatttccggccggcccgtgtgacggtgcgccaccatccggccccggt > 1:73732‑M2/1‑1 (MQ=255) | CGACAGCCTGGACCGCCGTGAAGTGCTGCACACGCAGGGCGAAGCCGGGCTGAAGCGGGTGGTGAAAAAGGAACACGCGGACGGCAGCGTCACGCAGAGTCAGTTTGACGCCGTGGGCAGGCTCAGGGCACAGACGGATGCCGCAGGCAGGACAACAGAGTACAGCCCGGATGTGGTGACGGGCCTCATCACGCGCATAA > NC_000913/3620361‑3620560 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |