| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 181,276 | C→G | 6.3% | H131Q (CAC→CAG) ‡ | degP → | serine endoprotease (protease Do), membrane‑associated |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 181,276 | 0 | C | G | 6.3% | 203.7 / 5.3 | 77 | H131Q (CAC→CAG) ‡ | degP | serine endoprotease (protease Do), membrane‑associated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (47/25); new base G (3/2); total (50/27) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.45e-01 | |||||||||||
CCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCG > NC_000913/181132‑181420 | ccAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgttg > 1:1520445/1‑149 (MQ=255) cAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGCTGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACgttgt > 2:56460/1‑149 (MQ=255) ggAATGTTCTCCGGTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGttgttg < 2:1250336/149‑1 (MQ=255) ggAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGttgttg > 2:413595/1‑149 (MQ=255) aaGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACGTGGttgttggt < 1:448563/149‑3 (MQ=255) tctcCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAAcgc > 2:477365/1‑149 (MQ=255) ctcCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACGTGGTTGTTGGTGAcgac < 2:689029/149‑3 (MQ=255) tcCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGa > 2:987331/1‑149 (MQ=255) ccGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGGTGTTGATAACGCGAc > 1:688664/1‑149 (MQ=255) cGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACg > 2:761212/1‑149 (MQ=255) cGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACg > 1:1204700/1‑149 (MQ=255) cGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACg > 2:1217523/1‑149 (MQ=255) cGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTACGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACACCAACGTTGTTGATAACGCGACg > 1:805606/1‑149 (MQ=255) gTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACgg > 2:1022381/1‑149 (MQ=255) tCCAGAGCGCTGCGTTCTGCCAGGGTCGCCAGGGCGGAAATCGGGGCGTCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGGCATCATTGATGCGGATAAAGGCTATGGCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTc < 2:78222/149‑1 (MQ=255) gCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTaaa < 2:810501/149‑1 (MQ=255) ctctCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTTATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAg < 2:1460724/149‑1 (MQ=255) ctctCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTCGGTTCCGGCGTCAGCATTGATGCCGATAAAGTCTATGTCGTCACCAACAACCACGGTGTTGATACAGCGACGGTCATTaaat > 1:1026312/1‑148 (MQ=255) tctcCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCAGGTTGTTGATAACGCGACGGGCATTAAAGt > 1:394083/1‑149 (MQ=255) ctcCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGtt > 1:1113023/1‑149 (MQ=255) tcCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGATATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTc < 1:661413/149‑1 (MQ=255) tcCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTc > 1:209246/1‑149 (MQ=255) tcCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTCGCGTCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCTCGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTc > 1:874600/1‑149 (MQ=255) cGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCaa < 2:142990/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGCCAGGGTGTCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTACGGCGGCATCATTGATGCCGCTAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCaa < 2:148453/149‑1 (MQ=255) ccAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCg > 1:256251/1‑149 (MQ=255) gggTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATg < 1:814401/149‑1 (MQ=255) cAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGCCGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTaa > 1:1184809/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACCTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTaa > 2:24426/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGGTCCGGCGACATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACAACGTTGTTGATAACGCGCCGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTaa > 1:1188200/1‑149 (MQ=255) aGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCTCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAg < 1:299374/149‑1 (MQ=255) gggCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGt > 1:624086/1‑149 (MQ=255) gTAATGGTGGCGGACAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGAc < 2:1007636/149‑1 (MQ=255) aaCAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCaaa > 2:27998/1‑149 (MQ=255) aCAGAAATACATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGAAGCCGATAAAGGCTATGTCTTCACCAACAACAACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGTGCTATGGCCGTAAGTTCGACGCGTAGATGGTTGGCAAAg < 2:452302/149‑1 (MQ=255) aGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCCACAACCACGTTGTTGATAACGCGCCGGTCATTAAAGTTCACCGGAGCGATGGCCATAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGAt > 1:398282/1‑149 (MQ=255) aGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGAt > 1:1508714/1‑149 (MQ=255) aaaTTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACACACACGTTGTTGATACCGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTTAGCGATGGCCGTAAGGTCGACGCGATGATGGTTGGCAAAGATcc > 1:1033880/1‑149 (MQ=255) aaaTTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATcc < 1:761212/149‑1 (MQ=255) aaTTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcg < 2:22547/149‑1 (MQ=255) aTTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCcgc < 1:1235209/149‑1 (MQ=255) tCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGAGGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGGTGGCAAAGATCCgcgc > 2:106632/1‑149 (MQ=255) gcTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGTCTATGTCGTCAACAACAACGACGTTGTTGATTACGCTACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATTGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGata < 1:46742/149‑1 (MQ=255) tGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAATTACAACTGAGCGATGGCAGTAAGTTCGAAGCGAAGATTGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGatata > 1:856229/1‑148 (MQ=255) gggTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATcg < 1:1538501/149‑1 (MQ=255) gTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATcgcg < 2:1520445/149‑1 (MQ=255) ggcggcATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGAt < 2:552445/149‑1 (MQ=255) ggCGTCATCATTGATGCCGATAAATGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGAt < 1:322330/149‑1 (MQ=255) ggCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCCCGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGAt < 1:241490/149‑1 (MQ=255) gTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCa > 1:870527/1‑149 (MQ=255) gTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCa > 2:955458/1‑149 (MQ=255) gTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTAGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCTCGATCTTATATCGCTCTGATCCa > 2:371427/1‑149 (MQ=255) atcatTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAAt < 1:1022381/149‑1 (MQ=255) tcatTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATc > 1:1237735/1‑149 (MQ=255) tcatTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTAGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCAGCGCTCTGATATCGAGCTGATCAAAATc > 1:306764/1‑149 (MQ=255) catTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATcc > 2:775568/1‑149 (MQ=255) catTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATcc < 2:533828/149‑1 (MQ=255) catTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATcc > 1:837242/1‑149 (MQ=255) ttGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAg > 1:1026750/1‑149 (MQ=255) aTGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCTCGCTGATCCAAATACAGAAc > 2:1466271/1‑149 (MQ=255) aTAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATACCGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGaaa > 1:157165/1‑149 (MQ=255) aaaGGCTATGTCGTCACCAACACCCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGAGCCAAATCCAGAACCCGaaaaa > 1:1556208/1‑149 (MQ=255) aaaGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTGGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGaaaaa < 1:710581/149‑1 (MQ=255) aaGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAAc < 2:209246/149‑1 (MQ=255) ggCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCt > 1:1469082/1‑149 (MQ=255) tATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGAc > 1:431011/1‑149 (MQ=255) aTGTCGTCACCATCAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCACCTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATACTCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGAcc > 2:302207/1‑149 (MQ=255) tGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCg > 1:1175903/1‑149 (MQ=255) tcgtcACCAACAACCACGTTGTTGATAAAGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCTACGCGAAGAAGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCa > 2:762787/1‑149 (MQ=255) cgttatcaacaaCGTGGTTGTTGGTGACGCGCCGGTCATTAAAGTTCACCTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAACTCCAGCCCCCGAAAGACCTGACCGCaa > 1:957855/7‑149 (MQ=255) gtcACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAAt > 2:742334/1‑149 (MQ=255) ttatcaacaaCGTGGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTTGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGACCCCGAAACACCTGCCCGCAAtt > 1:625533/5‑149 (MQ=255) aCCAACAACCACGTTGATTATAACCCGACGGTCATTAAAGATCAACTGAGCGATGGCAGTAAGTTCGACGCGAAGAAGGATGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTaa > 2:949403/1‑149 (MQ=255) ccAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAg > 1:940738/1‑149 (MQ=255) caacaaCCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGa > 1:641860/1‑149 (MQ=255) aacCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGc > 2:1244779/1‑149 (MQ=255) acCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCg < 2:624086/149‑1 (MQ=255) | CCAGGAAGGTTCTCCGTTCCAGAGCTCTCCGTTCTGCCAGGGTGGCCAGGGCGGTAATGGTGGCGGCCAGCAACAGAAATTCATGGCGCTGGGTTCCGGCGTCATCATTGATGCCGATAAAGGCTATGTCGTCACCAACAACCACGTTGTTGATAACGCGACGGTCATTAAAGTTCAACTGAGCGATGGCCGTAAGTTCGACGCGAAGATGGTTGGCAAAGATCCGCGCTCTGATATCGCGCTGATCCAAATCCAGAACCCGAAAAACCTGACCGCAATTAAGATGGCG > NC_000913/181132‑181420 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |