| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,368,982 | G→C | 7.5% | intergenic (+28/+32) | yhcG → / ← yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,368,982 | 0 | G | C | 7.5% | 276.1 / 13.8 | 104 | intergenic (+28/+32) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (60/36); new base C (4/4); total (64/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.67e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGG > NC_000913/3368836‑3369130 | gTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtg > 1:1511632/1‑149 (MQ=255) tttGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtgt > 1:1095555/1‑149 (MQ=255) tttGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtgt < 1:825467/149‑1 (MQ=255) tttGCCTAACACCGTTCAGGCAAGCTAATATAAGATGCAAAAACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtgt < 2:1171804/149‑1 (MQ=255) tGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCt < 1:1103154/149‑1 (MQ=255) ccTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGc > 1:539723/1‑149 (MQ=255) ccTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGc < 2:1056248/149‑1 (MQ=255) cTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGTGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACACTGTCTGCa < 1:253484/149‑1 (MQ=255) cTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTACTTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCa > 2:1232578/1‑149 (MQ=255) cTAACACCGTTCTGGCAAGCGAAGATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCGAGAGGAAGGCTATAGACGCGGTTTTTTTCAGCGGTGTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCa > 2:506094/1‑149 (MQ=255) tAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGCTGACAAACGACTCGCAGATGCACTCGCTCGAACACCGGCGGGGCGAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAg < 2:309508/149‑1 (MQ=255) aaCACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGa > 1:69443/1‑149 (MQ=255) acacCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTTCAGACAGTGTCTGCAGaa > 2:780753/1‑149 (MQ=255) cacCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGAAAGTCTCTGCAGAAt > 2:1118901/1‑149 (MQ=255) cacCGGTCTGGCAAGCGAATATAAGGTGCAACTACCTCATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGGTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAAt < 2:711814/149‑1 (MQ=255) acCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGTTGCAACTACCTTATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCTAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTGTCGAATTCTGCAGACACTGTCTGCAGAAtt < 1:446862/149‑2 (MQ=255) acCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACACTGTCTGCAGAAtt < 1:60355/149‑2 (MQ=255) cctttCTGGCATGAGAATCTAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACACTGTCTGCAGAAttc < 1:857162/146‑3 (MQ=255) ccGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGCAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCt > 1:1084902/1‑149 (MQ=255) cGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGAAGACAGTGTCTGCAGAATCtt > 1:690751/1‑149 (MQ=255) tCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaa < 2:1337440/149‑1 (MQ=255) tCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaa < 2:135667/149‑1 (MQ=255) tGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGCACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaa > 2:1494815/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTGAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaa > 1:459109/1‑149 (MQ=255) tGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaa < 1:682013/149‑1 (MQ=255) gAATATAAGTTGCAACAACCTGCTGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTaa < 2:1419697/149‑1 (MQ=255) tataAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAATGAACTAAGtt > 2:888913/1‑149 (MQ=255) taAGATGCACCTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACATGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGtttt > 1:319235/1‑149 (MQ=255) aaaGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTGCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGtttt < 1:1106801/148‑1 (MQ=255) aTGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGCAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGCTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGc > 1:379520/1‑149 (MQ=255) aaCTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGCCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGCTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCAtt > 2:353445/1‑149 (MQ=255) cTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAACTAATAAGCCATTAAATCa > 2:454733/1‑149 (MQ=255) tgatgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGATTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAg > 2:1296315/1‑149 (MQ=255) gatgaGAAACGACTCGCAGATGAACGCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGc < 1:1569905/149‑1 (MQ=255) atgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGcc < 2:437032/149‑1 (MQ=255) gagaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCtt > 1:1439615/1‑149 (MQ=255) gaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTaa < 2:266392/149‑1 (MQ=255) aaaCGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAAc > 1:1499813/1‑149 (MQ=255) aCGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCTTTAAATCAGCCTTAACCt > 1:111580/1‑149 (MQ=255) gACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTc > 2:798998/1‑149 (MQ=255) gACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGGGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGGCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTc < 2:698517/149‑1 (MQ=255) cTCGGAGATGAACGCGTTAGAACACTGGAGGTGCTAGAGGAAGGCTTTAGACGGCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCATACAGTGTCTGCAGAATCTTTAATACGATCTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcac < 2:1462138/149‑1 (MQ=255) tCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcacc > 2:364282/1‑149 (MQ=255) tCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcacc > 2:1536036/1‑149 (MQ=255) tCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcacc > 1:888760/1‑149 (MQ=255) gCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcaccac > 2:1300591/1‑149 (MQ=255) aaCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCttt < 1:1384969/149‑1 (MQ=255) aCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACTCCGTTAATTTCAGCGGGATCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtttt < 2:416237/149‑1 (MQ=255) aCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGGCGTTAATTTCTTCTGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGATCTAAGTTTTAAGACCTTAAATCTGCCTTAACGTTCACCCCAACCgttt > 2:1378489/1‑149 (MQ=255) gTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAt < 2:69443/149‑1 (MQ=255) gTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAt < 1:669338/149‑1 (MQ=255) ttCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAta > 1:25122/1‑148 (MQ=255) aaCACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGCCAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGACATTAAATCAGCCTTAACATTCACCACACCCTTTTTAAtctctc > 1:1398339/1‑149 (MQ=255) aaCACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAtctctc < 2:878987/149‑1 (MQ=255) acacAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGCCAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTcc > 1:894797/1‑149 (MQ=255) acacAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACCACCTTTTTAATCTCTcc > 2:1231431/1‑149 (MQ=255) acacAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTcc < 2:501667/149‑1 (MQ=255) acacAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTcc < 2:769037/149‑1 (MQ=255) aacaGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCa < 2:638519/148‑1 (MQ=255) acaGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAg > 2:596977/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGCCGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCAGTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTc > 2:831056/1‑149 (MQ=255) ggTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTAAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTATAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTAAACACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGc > 2:275048/1‑149 (MQ=255) agagGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACaa < 1:1367300/149‑1 (MQ=255) agGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAATGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACg < 1:888913/149‑1 (MQ=255) ggCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTATTTAATCTCACCAGGCTAGCCGACAACGCATcc > 1:663411/1‑149 (MQ=255) cTATAGTCGCCGTTAATTTGACCGGGTTCGAATTCTTCAGTCAGTGTCTGCAGAATTTTTAAAACGAACTAATTTTTAATGCATTAAATCAGCCTTAAACTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCATGCTCGCCGACAACGCATCCTg < 2:1213758/149‑1 (MQ=255) cTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTg < 1:1373564/149‑1 (MQ=255) tataGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCAGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTgg > 2:1508887/1‑149 (MQ=255) ataGACGCCGTTAATTTCAGCGGATTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGt < 1:659386/149‑1 (MQ=255) gACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGACCTAAGTTATAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCCCAACCTTTTTAATCTCTCCCGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTa > 2:793035/1‑149 (MQ=255) gACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACCACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTa > 1:1430879/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAATGCATCCTGGTTTAt > 2:208007/1‑149 (MQ=255) aCGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTAt > 1:1151421/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGc > 1:1042113/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATAAGCCTTAACCTTCAACACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTAGCCGACAACGCATCCTGGTTAATGc > 1:549607/1‑149 (MQ=255) gCCGTTAATTTCAGCGATTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGc < 1:1296315/149‑1 (MQ=255) ccGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGGCAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACACCCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGAAACCGCATCCTGGTTTATTCg > 2:1180663/1‑149 (MQ=255) ccGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCg > 2:619832/1‑149 (MQ=255) cGTTTATTTAAGCGGTTTAGAATTCTGAAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCAATTAAATGAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCGAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTATATGCgg < 2:1018610/149‑1 (MQ=255) cGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCgg < 1:601135/149‑1 (MQ=255) cGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCAAGGCTCGCCGACAAAGCATCCTGGTTTATGCgg < 2:1402820/149‑1 (MQ=255) ttAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGATTCTTAAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTACAGCATCGCCGTCAACGCGTCCTTGTTTATGCGGtt > 1:202617/1‑149 (MQ=255) ttAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGtt > 1:467635/1‑149 (MQ=255) ttAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGtt > 1:1312699/1‑149 (MQ=255) aaTTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCa > 2:124340/1‑149 (MQ=255) aTTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCAc > 2:50948/1‑149 (MQ=255) tCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCTCCGACAACGCATCCTGGTATATGCGGTTCACCTg > 2:1126354/1‑149 (MQ=255) cGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCAt < 1:1300591/149‑1 (MQ=255) ttCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGCACGAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTACCCTTCTCCCCAACCTTTTTAATATCTCCCGGGTAGCCGACCACCCATCCTGGGTTATCCGGGTCACCGGCCATAAac > 2:172263/1‑149 (MQ=255) ttCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAAACTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCCCCTGGCATAAac > 2:172262/1‑149 (MQ=255) tCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAacc > 1:1281443/1‑148 (MQ=255) tCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATATTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAacc > 2:1136555/1‑148 (MQ=255) gAATTCTGCAGGCAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACGAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTACCCTTCACCACAACCATTTTAATCTCTCCAGCATGGCCGCCAACGCATCCTGGTATATGCGGTACACGGGGCATaccaacg > 1:1054989/1‑143 (MQ=255) gaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACgg > 1:1206355/2‑149 (MQ=255) gaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACgg > 1:451809/2‑149 (MQ=255) tCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGa > 2:82978/1‑149 (MQ=255) aGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACAtt > 2:574145/1‑149 (MQ=255) aCAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAAACAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCACCAGGCTCGCCGACAACCCATCCTGGTATATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACaaacc > 2:1207642/1‑145 (MQ=255) cAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTccc < 1:596977/149‑1 (MQ=255) gtgtCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCCGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGCCAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGATCATGCCCgg > 1:1407626/1‑149 (MQ=255) | GTTTGCCTAACACCGTTCTGGCAAGCGAATATAAGATGCAACTACCTGATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACGCATCCTGGTTTATGCGGTTCACCTGGCATAAACACGGCGAACATTCCCGG > NC_000913/3368836‑3369130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |