| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,544,689 | A→T | 5.4% | R52R (CGT→CGA) | bioH ← | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,544,689 | 0 | A | T | 5.4% | 262.8 / 2.5 | 96 | R52R (CGT→CGA) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/34); new base T (3/3); total (59/37) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.60e-01 | |||||||||||
CGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGAT > NC_000913/3544542‑3544835 | cgcCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTAc < 2:1217764/149‑1 (MQ=255) ccTGAACCCGCTCGGGATGGGTAAACGCAATCTGGCGTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTGCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGc < 2:82428/149‑1 (MQ=255) ccTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGGAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCGGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGc < 2:263258/149‑1 (MQ=255) ccTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGc > 2:661218/1‑149 (MQ=255) ccTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGc < 2:607346/149‑1 (MQ=255) ccTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGc < 2:1430819/149‑1 (MQ=255) cTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGcc > 2:51533/1‑149 (MQ=255) aaCACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCgc > 1:76025/1‑148 (MQ=255) gCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAAACAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGcag > 2:735222/1‑147 (MQ=255) cTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTTCGGGCGTAGCCgg < 2:1531441/149‑1 (MQ=255) tagggATGGGTTAAGCCAATCTGGCGTGCAACCAGCCCGCCCAGCCTCCTTCCTAACCAATTGTCTTTATCAGGTCCCTGTAGCAGCACGTCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGAGCCCCAAATCCCCGGCTTCGGGCGTAGCCggg < 2:843286/147‑1 (MQ=255) gggATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCa > 2:1354696/1‑149 (MQ=255) gATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCTAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAgg > 1:405377/1‑149 (MQ=255) gATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAgg > 1:45886/1‑149 (MQ=255) aTGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCCGGTGCCTGGTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGt < 1:1262428/149‑1 (MQ=255) gggTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTca < 1:5212/149‑1 (MQ=255) ttAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCGCAGACTCCAGCCTAAGCAAATGGCTTAATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGTCTTCGGACATATCAGCAAGAGACAGAGCACAAAATCCCAGTCTACCCCCGAAGCCGGGAAGGacaaca > 2:857961/1‑149 (MQ=255) ttAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGCAGCCGGGCAGGTcaaca > 2:463985/1‑149 (MQ=255) 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cGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGt < 2:979121/149‑1 (MQ=255) gCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTAACAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTg > 1:558004/1‑149 (MQ=255) aTCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGGCGCCGGGCCGGTCAACCAGGTGCAg > 2:1509814/1‑149 (MQ=255) tCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCCGCCTACCCAATTGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCTGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGc < 1:1032026/149‑1 (MQ=255) ggCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTa < 2:788160/149‑1 (MQ=255) ttGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGCAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTaaaa > 2:405707/1‑149 (MQ=255) cccAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTc > 2:1392077/1‑149 (MQ=255) ccAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTcc > 1:248179/1‑149 (MQ=255) aGAATCCATCATAACAAATTGGCGTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGATTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCGCGGCTACGCCAGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTc < 2:1075367/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTc < 2:1358207/149‑1 (MQ=255) 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aCAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGACGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTgc > 2:1421921/1‑148 (MQ=255) aCAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACTCCACCCTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACATGATGAACATTCCCCtta > 2:312002/1‑147 (MQ=255) cAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGAc > 2:574491/1‑149 (MQ=255) cAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGAc < 1:1191528/149‑1 (MQ=255) aGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACCCTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCCCCAGATGAACCTTCCCCTGccc > 1:1140494/1‑149 (MQ=255) cACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTg < 2:1201372/149‑1 (MQ=255) aCCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTgg > 1:1195054/1‑149 (MQ=255) aCCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGACGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCGGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTgg < 1:188652/149‑1 (MQ=255) cAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTc > 1:1555690/1‑149 (MQ=255) cAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCGCGTCAAGGCAACGCCACCCTTCGGCATTCAGTCCCCGTCCGTGCAGCAGCACGAGATGATCATTCCCCTGCCGTTTgggg > 1:673914/1‑147 (MQ=255) acctgcccGGCTTCGGGCGTAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCTACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCt > 1:1097362/6‑149 (MQ=255) aTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCCGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCGCACTTAGGCAGTCAGTCCCCCTCCGTGCAGCAGCCCAAGATGCACCTTCCCCTGACCTTTAGTCAGc > 2:842144/1‑149 (MQ=255) aTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACCCTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGc > 2:1264934/1‑149 (MQ=255) tCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGcc < 2:622439/149‑1 (MQ=255) gcccGGCTTCGGGCGTAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGcca > 2:497310/2‑149 (MQ=255) ccccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACCCTTCGGCATTCAGTCCCCCTCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGCCCTTTGGTCTGccc > 1:1026323/1‑148 (MQ=255) ccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGccacc > 1:586269/1‑149 (MQ=255) cTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCATCAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACTCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTTGTCTGCCACCAGAt < 1:377372/149‑1 (MQ=255) | CGCCTGAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGAT > NC_000913/3544542‑3544835 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |