| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,809,354 | 0 | A | G | 5.8% | 313.7 / 7.4 | 121 | E272G (GAA→GGA) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase (KDO transferase) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (52/59); new base G (4/3); total (59/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
CGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGATC > NC_000913/3809207‑3809500 | cGCTGCGCCGCCAGTGGGCTCCACACAGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGaa < 2:530193/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGATTGTGGTGATCGCAGCACATCAGGCATTTTTACAGCAATTCCCGAATTAATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCAGCAGGAAc > 2:1521904/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATACGGCAcc > 2:1456491/1‑148 (MQ=255) 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tCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTa < 1:1354843/149‑1 (MQ=255) tCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTa < 1:1497299/149‑1 (MQ=255) tCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGGCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTa < 1:1372799/149‑1 (MQ=255) ccTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTAc > 1:744104/1‑149 (MQ=255) ggTACCCCCTCATCCGGAACGCTTCCCGGTTGCGATTAACGTTGTCCTCCAGGCTTGACTAAGCTATATCACACTCTCTTCATGGGACGTCCACTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGTTACGATGGTCGAGTTGATGTTACTGt < 2:692819/149‑1 (MQ=255) 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ggAACGCTTCCCGGATGCGATTCACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACCCGCTCATCACGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGAtc < 2:1254818/149‑1 (MQ=255) ggAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGAtc > 2:1073787/1‑149 (MQ=255) | CGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGATC > NC_000913/3809207‑3809500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |