| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,897,613 | G→A | 7.2% | P36P (CCG→CCA) | cbrB → | PRK09823 family inner membrane protein, creBC regulon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,897,613 | 0 | G | A | 7.2% | 286.7 / 9.7 | 110 | P36P (CCG→CCA) | cbrB | PRK09823 family inner membrane protein, creBC regulon |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/50); new base A (5/3); total (57/53) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.18e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
GCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGC > NC_000913/3897466‑3897760 | gCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGTGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATAAATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGc < 1:1509095/149‑1 (MQ=255) tAAATTTGAGCTCTAAGTTAAGTAAATGTAGTTTTATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGTACTTTATTTTGCTGTTTTATGACCTTTAATTGTTGTTCTGTTTCTTTTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACAGCTgg < 1:262852/149‑1 (MQ=255) tGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCAGCGGTTCtt < 2:1551047/149‑1 (MQ=255) ctcgcAAATGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGTTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTgg < 1:494348/145‑1 (MQ=255) cgcTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCAGCGGTTCttttg < 1:188193/149‑3 (MQ=255) tCAAAGGGAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGGCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTg < 1:998622/149‑1 (MQ=255) cAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGa > 1:1314481/1‑149 (MQ=255) cAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGa > 2:8925/1‑149 (MQ=255) cAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGGTCTTTGGGTGa > 1:1020897/1‑149 (MQ=255) aaGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGata < 1:1355817/149‑1 (MQ=255) aGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAAATGGTGTTCTGTATCTTGTGCTCTACATATTCTTCACAAAAGAACCACTGTTTCTTTGGTTGataa > 1:389980/1‑149 (MQ=255) ggTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGataat < 2:1261284/149‑1 (MQ=255) gtaagtaaAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGCCCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTATTCTCAAAAGACCCGCTGGTTCTTTGGGTGataata > 2:114797/1‑149 (MQ=255) gtaagtaaAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGataata > 2:835706/1‑149 (MQ=255) gtaagtaaAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGataata > 1:139096/1‑149 (MQ=255) tatctaaAGGTAGTTAGATATGTCTGTCTCCCGTCTGGGAATACATCACGGTCATTATTTTGCAGTGTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTTTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGTTGATAATAc < 1:304218/145‑1 (MQ=255) agtaaAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACAt < 1:1449118/149‑1 (MQ=255) gtaaAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTAGTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATc > 2:1352176/1‑149 (MQ=255) ggAGTTTGATATTTCTGTTTCACGTCGTGTAATACATCACGGACTTTTTTTAGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCAACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAAttt < 2:108183/149‑1 (MQ=255) ggAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCAGCGGTTCttttg < 2:1071526/130‑3 (MQ=255) ggAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCAGCGGTTCttttg > 1:1071526/1‑128 (MQ=255) aggttGATATGTCTGTTGCACGGCGGGTTATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACAGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAAttttt < 2:956071/146‑1 (MQ=255) gTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCAAAtttcta > 1:254566/1‑146 (MQ=255) gATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGGGTTGTGTTTCTTGTCCTCAACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCtt > 2:1485020/1‑149 (MQ=255) atatGGCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAGGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTa < 2:636642/149‑1 (MQ=255) tatGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTTTTATGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTTATAATACATCCAATTTTTCTCTTAt > 2:745669/1‑149 (MQ=255) atGTCTGTTTCACGTCGGTTAATACATGACGGACTTTATTTTGCAGTGTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTAtt < 2:305734/149‑1 (MQ=255) atGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTAtt > 1:719866/1‑149 (MQ=255) tCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTc < 2:479673/149‑1 (MQ=255) tGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGa < 1:515687/149‑1 (MQ=255) tttCACGTCGGGTAATACATAACGGACTTTATTATGCAGTTTTATGACCGATAATTGGTGATCTCTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCTCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTCATAATACATCCAATTTTTCTATTATTGTCGATa > 2:550258/1‑149 (MQ=255) aCGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTa > 1:1249739/1‑149 (MQ=255) gTCGTGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTATTTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACg < 1:628209/149‑1 (MQ=255) cGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACggg < 2:762258/149‑1 (MQ=255) gTAATACATCACGTAATTTATTTTGCAGTTTTAGTACCGTTTATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGTTAACTACGGGAGc < 1:878559/149‑1 (MQ=255) gTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGc < 1:1109420/149‑1 (MQ=255) gTAATAAATCACTGACTTTAAATTGCATTTTTAGTACAGTTAATTGGTTTTCTGTTTCTTGTCCTCTAAATATTCTTCGCAAAATAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGc < 1:1112085/149‑1 (MQ=255) aTCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCt > 1:506656/1‑149 (MQ=255) aTCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCATCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCt > 1:263680/1‑149 (MQ=255) aTCACGGACTTTAATTTGCAGTTTTAGGACCGTTACTAGGTGTTCTGTTTCTTGTCCGCTACATATTCTACGCCACCGACCCGCTGGATCTTTGGGTGATAATACATCCAATTGTTCTCTTATAGTCGAAAACTACGGGAGCTATTCCt < 2:326100/149‑1 (MQ=255) tCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTg > 2:837408/1‑149 (MQ=255) aCGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTTGTGTTCTGTTTATTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGTTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCg < 2:930648/149‑1 (MQ=255) aCGGACCTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCg > 2:544273/1‑149 (MQ=255) aCGGACCTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTGTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGGTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCg > 2:245721/1‑149 (MQ=255) gACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTTGTGTTCTGTGTCTTGTCCTCTACATATTCTTCTCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCgttg < 1:1534165/149‑1 (MQ=255) cTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCgttgtt > 2:1264987/1‑149 (MQ=255) ttttGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCg < 2:1371486/149‑1 (MQ=255) ttttGCAGTTTTAGGACCGGTAATTGGTGTGCTGTTTCTTGTACTATACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCg < 2:417417/149‑1 (MQ=255) tGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACAACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGgtg > 1:185683/1‑149 (MQ=255) ttttAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTATTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCTTTGTTAAACGGTGTAAtt > 1:464410/1‑148 (MQ=255) ggACCGTTAATTGGTGGTCTGTTTCTAGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAAATTTTCTCTTATTGACTATAACTACGGTAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGc < 1:1106804/149‑1 (MQ=255) gACCGTTAATTGGTGTTCTGTATCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTCATAATAAATCCAAATTATCTCTTATTGTCGATAACTACGGGATCTATTCCTGCGTTCTTAACCGGTTTAATGGTTGca > 2:791657/1‑148 (MQ=255) aCCGTTATTTGGTGTTCTTTTTCTTGTCCTCTACATCTTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGTGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCt < 2:1220007/149‑1 (MQ=255) aCCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCt < 2:1249739/149‑1 (MQ=255) gTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTc > 2:364905/1‑149 (MQ=255) ttAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCt > 1:156184/1‑149 (MQ=255) aaTTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTTCCTGTCTGc > 1:1540099/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGTTCTGTTTCTTGTCATCTACATATTCTTCGAAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTATCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGcc < 2:292297/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGTTCTGTTTCTTGTACTCTACATATTCTTCGCAAATGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGcc < 1:460995/149‑1 (MQ=255) ttGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCg < 2:778459/149‑1 (MQ=255) ggTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGa > 1:985748/1‑149 (MQ=255) gtgtTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTTACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGaa > 1:216525/1‑149 (MQ=255) gtgtTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGGGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGaa > 2:504083/1‑149 (MQ=255) tgtTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGaaa > 2:140208/1‑149 (MQ=255) ttCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAg < 1:978730/149‑1 (MQ=255) ttCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGGGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAg < 1:837459/149‑1 (MQ=255) cTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGAt < 2:1314481/149‑1 (MQ=255) gTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATTACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCg > 2:1266399/1‑149 (MQ=255) gTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCg < 1:1204627/149‑1 (MQ=255) tttCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCgg < 1:871367/149‑1 (MQ=255) tttCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCgg < 1:243207/149‑1 (MQ=255) tCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGt < 2:409283/149‑1 (MQ=255) ttGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGACCCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTca > 1:244080/1‑149 (MQ=255) ttGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGGGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTca > 1:102275/1‑149 (MQ=255) tGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTCCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCATCCGGAAAAGATCGGGTcac > 2:316865/1‑149 (MQ=255) ctctACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGGCGGAAAAGATCGGGTCACAGaa > 2:908139/1‑149 (MQ=255) ctctACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGaa > 2:819968/1‑149 (MQ=255) ctctACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTACTGCGTTGTTAACCTGTGTAATGATTGCATGTCTGCCTGAAAAGATCGGGTCACAGaa > 1:1008186/1‑149 (MQ=255) ctctACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTAATCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGaa < 1:835706/149‑1 (MQ=255) ctctACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTAATTTGGATGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCTATAACTACGGGAGCTATTCATGCGTATTTAACAGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGaa > 1:392519/1‑149 (MQ=255) ctACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATTATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACTGGAGCTATTACTGCGTTGTTAACCGCTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAAc > 1:419249/1‑149 (MQ=255) aCATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATTACTACGGGAGCTATTCCTGAGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGt > 1:1538116/1‑149 (MQ=255) atatTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATACCTACGGGAGCTATTCCTCCGTTTTTAACCGGTGTAATGGTTGCATGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTa > 2:852919/1‑149 (MQ=255) atatTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTa < 1:1282409/149‑1 (MQ=255) atTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTATTATTGTAGATAACTACGGGAGCTATTCCAGCGATGTTAACCGGTGTAATGTTTGCCTGTCTGCAGGAAAATATCTGGTCACAGAAACGTTAta > 2:858793/1‑148 (MQ=255) tcttcGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGt > 2:507820/1‑149 (MQ=255) cttcGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGtt < 1:121694/149‑1 (MQ=255) cGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGTGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCAGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGCAAAAGATCTGGTCACAGAAACGATATCGTTGta > 2:1382692/1‑148 (MQ=255) gCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTACTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTct > 2:1460081/1‑149 (MQ=255) ccaaaGAACCAGCGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTctg > 1:770405/3‑149 (MQ=255) caaaGAACCAGCGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCTCAGAAACGTTATCGTTGTctgg > 2:824497/2‑149 (MQ=255) aaGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTctggct < 1:775686/149‑1 (MQ=255) aGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTctggctg < 2:407150/149‑1 (MQ=255) gAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTctggctgg > 2:1520245/1‑149 (MQ=255) aaCCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATAGATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCtggt < 2:185683/149‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCtggt < 2:156184/149‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCtggtgg > 2:325764/1‑149 (MQ=255) ccGCGGGTTCTTTGGGTGATAATTCTTCGTATTTTTGTCTTATTGTCGATATCTTCGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTATCCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCtggtgg < 2:1082541/149‑1 (MQ=255) cGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCTGTGTAATGGTTGCCTGTATGACGGAAAAGATCGGGTCACATAAACGTTATCGTTGTCTGGCTTGTGGc > 1:1377776/1‑149 (MQ=255) cGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGc < 1:8925/149‑1 (MQ=255) | GCTTAAATTGGCGCTCAAAGGTAAGTAAAGGGAGTTTGATATGTCTGTTTCACGTCGGGTAATACATCACGGACTTTATTTTGCAGTTTTAGGACCGTTAATTGGTGTTCTGTTTCTTGTCCTCTACATATTCTTCGCAAAAGAACCGCTGGTTCTTTGGGTGATAATACATCCAATTTTTCTCTTATTGTCGATAACTACGGGAGCTATTCCTGCGTTGTTAACCGGTGTAATGGTTGCCTGTCTGCCGGAAAAGATCGGGTCACAGAAACGTTATCGTTGTCTGGCTGGTGGC > NC_000913/3897466‑3897760 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |