| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,476,080 | G→T | 6.7% | G215V (GGG→GTG) | yjgL → | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,476,080 | 0 | G | T | 6.7% | 359.2 / 3.3 | 157 | G215V (GGG→GTG) | yjgL | SopA‑central‑domain‑like hexapeptide repeat protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (78/63); new base T (8/5); total (89/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
ATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGT > NC_000913/4475932‑4476228 | aTTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAggg < 2:1289732/149‑1 (MQ=255)aTTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAggg < 1:983082/149‑1 (MQ=255) cTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTa > 2:1563206/1‑149 (MQ=255) cTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTAAAGAAGTTAAAAAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGTTTa > 1:1079625/1‑149 (MQ=255) tAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTaa < 1:792234/149‑1 (MQ=255) tAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGGCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATACTCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGTGTTaa > 1:132959/1‑149 (MQ=255) aaCAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCAACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTaaa < 2:455609/149‑1 (MQ=255) aaGGTGATGGCGTGTTACCATAGTGAAGCTATCAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAaataa < 2:908690/149‑1 (MQ=255) tggtatGGCGTGTTAACCAAGTGAATCTAACAATAAACTTGATTGTGTATTAAATAATAATCAGTTGTTAAATAATCTACATAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATc < 2:1463122/144‑1 (MQ=255) ggTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATc < 2:626695/149‑1 (MQ=255) ttCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCt > 1:340471/1‑149 (MQ=255) cttgCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCa < 2:631429/146‑1 (MQ=255) ggCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAga > 2:1350585/1‑148 (MQ=255) gCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCATCAGGa > 2:235871/1‑149 (MQ=255) gtgtTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTTCAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGt < 2:1538933/149‑1 (MQ=255) gtgtTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGt < 2:88983/149‑1 (MQ=255) gtgtTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGCTTTAAATAATCCTCAGGAGt > 2:106284/1‑149 (MQ=255) ttACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTATATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATTATATACAGGCGTTAAATAATCCTCAGGAGTTaa > 2:139206/1‑149 (MQ=255) aCCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAaat > 2:923618/1‑149 (MQ=255) cAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAaataa > 1:968306/1‑149 (MQ=255) gTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGTGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCg > 1:442229/1‑149 (MQ=255) gAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGTTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCgaa > 1:1520594/1‑147 (MQ=255) gAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAAAATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCa > 2:1194028/1‑149 (MQ=255) aaGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAg > 2:939997/1‑149 (MQ=255) aaCAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAAttt < 2:151202/149‑1 (MQ=255) aaGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAAttt < 1:709356/146‑1 (MQ=255) aaGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAAttt > 2:709356/1‑146 (MQ=255) aaGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTaaa > 1:75014/1‑149 (MQ=255) aaGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTaaa > 2:1502348/1‑149 (MQ=255) aaGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCAACAGAAATAAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCAACTGAAGTTAAATAATATACATGTGTTAAATAATACTCAGGAGTTAAATAATCAGCAGAATTTaaa > 1:688782/1‑149 (MQ=255) aGAAAATAGAGCGTCAATTAAATAATAATCAGTAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAAt < 1:1488978/149‑1 (MQ=255) aaaaTAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGATAAATAATCCTCAGAATTTAAATGa > 1:148026/1‑149 (MQ=255) actAGCGCGTCTATTAAATAATATTCATGATTTAAATAATCTTCAGAAATTAAATAATCTACATAATTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATCTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGAtt < 2:842836/147‑1 (MQ=255) gcgcGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCATCAGGAGTTAAATAATACGCAGAATTTAAATGATTCTCa > 1:1052863/1‑149 (MQ=255) gcgTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGTTTAAATAATCATCAGGAGTTAAATAATCAGCAGAATTTAAATGATTCTCAgg > 1:918839/1‑149 (MQ=255) gagTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAgg < 1:624267/147‑1 (MQ=255) gTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAg > 1:559814/1‑149 (MQ=255) cTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATATTCTAAAGATATTAAATAATCTAGAGAAGTTAAATTATCTACTGATCTTAAATAATATACAGGGGTTATATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTATATGATTCTCAGGAGtt < 2:1138911/149‑1 (MQ=255) cTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTAAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGtt > 1:876048/1‑149 (MQ=255) tATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTa < 2:696178/149‑1 (MQ=255) aTTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaa < 1:375517/149‑1 (MQ=255) ttAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaaa < 2:135178/149‑1 (MQ=255) ttAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTaaa < 2:690626/149‑1 (MQ=255) aataataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTTAATAATATTCAGGGGTTAAATAATCCTCATGAGTTAAATAATCCTCAGAATTTAAATAATTCTAAGTAGTTAAATaa > 1:962779/1‑149 (MQ=255) aataataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAATTAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATaa > 1:1119391/1‑149 (MQ=255) aataataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAAGATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATaa > 1:1271665/1‑149 (MQ=255) taataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACt > 2:1375397/1‑149 (MQ=255) aataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTc < 2:1384479/149‑1 (MQ=255) aataatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCAACAGAAGTTAAATAAACAACTGAAATTAAATAATAAACAGGATTTAAATAAAAATCAGGAGTTAAATAATCAGCATAATTAAAATCATTATCACGAGTAAAATAACTc > 2:975912/1‑149 (MQ=255) taatCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGc < 1:877419/149‑1 (MQ=255) tCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAgt > 1:1335354/1‑148 (MQ=255) cAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGTTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCATGAGTTAAATAACTCGAAGGa > 2:380247/1‑149 (MQ=255) ggAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGCAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGGAGGAAt > 2:143408/1‑149 (MQ=255) ggAGTTAAATAAAATACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAAt < 2:1101843/149‑1 (MQ=255) ttAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTaaa > 1:1153111/1‑149 (MQ=255) tAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTAGCAGGAATTatat > 2:1194939/1‑149 (MQ=255) atCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCca > 1:649930/1‑149 (MQ=255) cTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCcaca > 1:149762/1‑149 (MQ=255) tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAg < 1:375298/149‑1 (MQ=255) tACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCAGCAGAATTTAAATTATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCAACAg > 1:931858/1‑149 (MQ=255) aaaTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGtt < 1:1563206/149‑1 (MQ=255) aaaTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATAGACAGGGGTTAAATAATCCTCATGAGTTAAATAATCCGAAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACACGCAGTAATTAAATAGACCACAGGAGtt > 1:1038060/1‑149 (MQ=255) aaTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCGCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGTAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTa > 2:712010/1‑149 (MQ=255) aTTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGTGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATCATTCTCAGCAGTAAAATAACTAGAAGGAATTAAATAATCCACATGAGTaaa > 2:1444606/1‑149 (MQ=255) ttaattaaTCTACAGTATTTAATTAATCTACTGAAGTTAAATAATATAGAGTTGTTAAATAATCCTCAGTAGTTAAATAATCCTCATAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTaaa < 1:975912/149‑1 (MQ=255) tAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAAt < 2:270746/149‑1 (MQ=255) taatCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATc > 2:191676/1‑149 (MQ=255) atCTACAGAATTTAAATAATATAATTAATTTAAATAATATACATGGGTTAAATAATACTCATGAGTTAAATAATCCTCAGAATTTAAATTATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCg < 1:1194028/149‑1 (MQ=255) aaGTTAAATAATCTACTTAAGTTAAATAATATACCTGTTTTAAATAATCCTCAGGATTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGtt < 2:968306/149‑1 (MQ=255) aaGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGtt > 1:1551350/1‑149 (MQ=255) aGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCAGCAGGAGTTa > 2:330227/1‑149 (MQ=255) tttAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGTGGTTAAATAATACTCATGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaa < 1:1027621/148‑1 (MQ=255) tttAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGTTTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTaa < 1:235818/148‑1 (MQ=255) aaaTAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAAATCGCAGGAATTAAATTGTCAAAATGAGTTAAATTATACGCAGGAGTTAaata > 1:1377729/1‑149 (MQ=255) aaaTAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAAACCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTAGAAGGAATTAAATAGTCCAAAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaata > 2:509275/1‑149 (MQ=255) ataatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAaataat > 2:1163186/1‑149 (MQ=255) taatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCTCAGGAGTTATATAAtt > 1:610337/1‑149 (MQ=255) taatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAAtt < 2:1260878/149‑1 (MQ=255) aatCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCATGAGTTAAATAACTCTAAGGAATTAAATAGTCAACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAAtta > 1:702876/1‑148 (MQ=255) atCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATtct > 2:260786/1‑149 (MQ=255) tCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTAAAATAACTCGCAGTAATTAATTAGTCCAAAGGAATTAAATGAACCGCAGGATTTAATTAAAtcac > 2:1424903/1‑147 (MQ=255) cTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCa < 1:1367450/149‑1 (MQ=255) cTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCa < 2:1309806/149‑1 (MQ=255) cTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGa < 1:928089/149‑1 (MQ=255) aaGTTAAATAATCTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGACTTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACtt < 2:1052863/149‑1 (MQ=255) aaGATAAATTATATACAGTGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATATAACTGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGTGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGTACtt < 1:208946/149‑1 (MQ=255) aGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTa > 1:1344372/1‑149 (MQ=255) ttAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGTACTTaaa > 1:581743/1‑149 (MQ=255) ttAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTaaa > 2:560940/1‑149 (MQ=255) aataatATACATGGGTTAAATAATCATCATGATTTAAATAATCAGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATaa < 1:235871/149‑1 (MQ=255) aataatATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATaa < 1:419403/149‑1 (MQ=255) ataataTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGATTTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGGAGGAATTAAATAGTCCACAGGATTTAAATAAACCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAAc > 1:1140999/1‑149 (MQ=255) taataTACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAAct < 1:476886/149‑1 (MQ=255) ataCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTATCAGGACTTAAATAAATCTaa > 2:428673/1‑149 (MQ=255) ttaagtggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCAGCAGAATTTAAATGATTCTCAGTAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACATGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAg < 1:509275/143‑1 (MQ=255) taCAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAg < 1:563574/149‑1 (MQ=255) aGGGGATAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATACTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACACGACTTAAATGATCCGAAGGAGTAAAATAATTATCAGGACTTAAATAACTATAAGGTg > 1:1201814/1‑149 (MQ=255) gggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAg > 2:1333158/1‑149 (MQ=255) gggTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCATCAGAATTTAAATTATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAg < 1:106284/149‑1 (MQ=255) gggTTAAATAATCATCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAg < 1:691115/149‑1 (MQ=255) | ATTACTAACAAGGTTCTGGCGTGTTACCAAAGTGAAGCTAACAAGAAAATAGCGCGTCTATTAAATAATAATCAGGAGTTAAATAATCTACAGAAATTAAATAATCTACAGAAGTTAAATAATCTACTGAAGTTAAATAATATACAGGGGTTAAATAATCCTCAGGAGTTAAATAATCCGCAGAATTTAAATGATTCTCAGGAGTTAAATAACTCGCAGGAATTAAATAGTCCACAGGAGTTAAATGATCCGCAGGAGTTAAATAATTCTCAGGACTTAAATAACTCTAAGGTGAGT > NC_000913/4475932‑4476228 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |