| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,978,503 | Δ776 bp | insB1–insA | insB1, insA | |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1978503 | 1979278 | 776 | 85 [0] | [1] 86 | insB1–insA | insB1,insA |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1978502 | 0 (0.000) | 82 (1.080) | 69/280 | 0.1 | 100% | intergenic (‑305/+16) | flhD/insB1 | flagellar class II regulon transcriptional activator, with FlhC/IS1 transposase B |
| ? | NC_000913 | 1979279 = | 0 (0.000) | intergenic (‑64/‑474) | insA/uspC | IS1 repressor TnpA/universal stress protein | |||||
TCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAAT > NC_000913/1979138‑1979425 | gtctttacacttatctaagatttttcctaaatcgacgcaactgtactcgtcactacacgcacatacaacggaggggggctgcgattttcaataatgcgtgatgcagatcacacaaaaacactcaattccttaacataaatgTATAAGTc < 2:102432‑M2/8‑1 (MQ=255) gtctttacacttatctaagatttttcctaaatcgacgcaactgaactcgtcactacacgcacatacaacggaggggggctgcgatattcaataatgcgtgaagccgatcacacaaaacactcaattactaatcataattgTATAAGACa > 1:1142668‑M2/141‑149 (MQ=255) tttacacttatctaagatttttcctaaatcgacgcaactgtactcgtcactacacgcacatacaacggaggggggctgcgattttcaataatgcgtgatgcagatcacacaaaacactccattacgtaacagaaatgTATAAGTCATAc > 2:874962‑M2/138‑149 (MQ=255) 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taaatgTATAAGTCATAGTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGGTTTTCGCTCCGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGTAATTGGATGTTGCGCACAGTCTAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCtat < 2:69141‑M2/143‑1 (MQ=255) aTGTAT‑AGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATATGGTAAAAATTTTTTAGCGACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATAGAAATGGGATGGTGCGCACAGTCAAAATAACTGACCGTAAATAATCAACTGCTataaat > 2:1033533/1‑149 (MQ=255) | TCCGGCGGTGCTTTTGCCGTTACGCACCACCCCGTCAGTAGCTGAACAGGAGGGACAGCTGATAGAAACAGAAGCCACTGGAGCACCTCAAAAACACCATCATACACTAAATCAGTAAGTTGGCAGCATCACCCATAAATGTATAAGTCATACTTTTGTTTTGGGTGTATTTCAATCTGTTAAAAAGTTTTTCGCTACGCTAGCAAGCAAAAATGAAACAGGAATAATCGAAATGGGATGTTGCGCACAGTCAAAATAACTCACCGTAAATAATCATCTGCTATAAAT > NC_000913/1979138‑1979425 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |