New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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? | NC_000913 | 4123397 = | 191 (0.860) | intergenic (‑58/+34) | ftsN/cytR | essential cell division protein/Anti‑activator for CytR‑CRP nucleoside utilization regulon | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
CAATAGCGACCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGAT > NC_000913/4123222‑4123519 | caATAGCGACCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGAGTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCGGTCTTTATTCGTTCGTCAGc > 2:1978448/1‑150 (MQ=255) aTAGCGACCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGccc > 2:1479272/1‑150 (MQ=255) gCGACCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGcc < 2:3512469/150‑1 (MQ=255) gCGACCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGAGTTCGTGGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCATTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGcc < 1:3524288/150‑1 (MQ=255) gACCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCAt > 2:1386559/1‑150 (MQ=255) aCCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATg > 2:1086247/1‑150 (MQ=255) aTAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTa < 2:3035527/150‑1 (MQ=255) aTAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTa < 1:532078/150‑1 (MQ=255) aaaCCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTACTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAgcggc > 1:746875/1‑150 (MQ=255) aaCCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAgcggcg > 2:2715374/1‑150 (MQ=255) aaCCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAgcggcg < 2:2554272/150‑1 (MQ=255) cGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGc > 1:3034156/1‑150 (MQ=255) cGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGc > 2:3924907/1‑150 (MQ=255) 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cACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTAGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACgag > 1:3875194/1‑150 (MQ=255) cGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCTTGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCAc < 1:639594/150‑1 (MQ=255) cGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCAc < 2:3359164/150‑1 (MQ=255) cGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCa < 2:2893230/150‑1 (MQ=255) cTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAAc > 1:852036/1‑150 (MQ=255) cTGTATTTATTAGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTATGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTAGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAAc > 2:2384263/1‑150 (MQ=255) tGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACg > 2:757953/1‑150 (MQ=255) gTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACgt < 1:439081/150‑1 (MQ=255) tattCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGc < 2:482676/150‑1 (MQ=255) tattCGTACGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCATTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGc < 2:1646586/150‑1 (MQ=255) 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GCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGAt > 1:958145‑M1/1‑150 (MQ=255) GCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGCCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGAt > 2:3572680‑M1/1‑150 (MQ=255) | CAATAGCGACCATAGCGGGAGAAACCGCAGGCAGATTTCGTTGCTTTTTCCGTGAGGTGCTCTTTTTTCGCCGCGAAGGTGCCGGTTGGCTGCGGCGTACATAATCTCGTTGTGCCACTATCGTTTCGCTGTATTTATTCGTTCGTCAGCCCGCCATGTTACTTAAGCGGCGGGCCTTTGACCAGTCACGGCAGTCTTAAAGGTTTACTTTAAGGTAACGCGCGTGTTGATCCCCGGATGATAAGTTCGCAGTCCATTAAACGAGAGCCACTGCCAACGTGTTGCCCCTGCATTTGAT > NC_000913/4123222‑4123519 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |