| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,239,609 | 0 | T | G | 12.1% | 369.0 / 23.0 | 149 | intergenic (+64/‑335) | alx/sstT | putative membrane‑bound redox modulator/sodium:serine/threonine symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (83/37); new base G (2/14); total (85/64) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.87e-05 | |||||||||||
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Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
GGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAA‑TTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTATT > NC_000913/3239462‑3239758 | gCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAA‑TTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 2:266083/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAA‑TTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 1:153932/150‑1 (MQ=255) gCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGATTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAA‑TTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCa < 2:2626902/150‑1 (MQ=255) 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ttCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTGTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAt > 1:2727302/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTAtt < 1:1279652/150‑1 (MQ=255) | GGCGTGGTGTTTGGCATTCTGGTGATGACGTTTATTATCAACGCCTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAA‑TTTTTAATCTGCCTAAGCCGTG‑TACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTTCTCCCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCAAACGGGGCGAGGGGACTGACCGAGTCCTTTTTTGATGTTGTCATCAGTCTGGAAGCCGCACGTTGGCTTTATT > NC_000913/3239462‑3239758 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |