| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,902,785 | G→T | 8.6% | S306Y (TCC→TAC) | bglB ← | cryptic phospho‑beta‑glucosidase B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,902,785 | 0 | G | T | 8.6% | 1999.1 / 19.0 | 651 | S306Y (TCC→TAC) | bglB | cryptic phospho‑beta‑glucosidase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (300/258); new base T (2/83); total (302/349) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.34e-23 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 679 total aligned reads displayed.
GTTTTTGATAACGATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTGGGAAACACAACCAGTCATGTAATAACTAAAAGAGATGAAATCGACGGTATGTTTTAAATCTTCTGCGTCACTTTCAGTCATCTCAATGGTGATATTGTGGTCGCGGAAGAAACGCTGCATATAGCCGGGATACTGGCCACGCGCCTGAACA > NC_000913/3902636‑3902934 | tttttGATAACGATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTGGGa > 2:4757679/1‑150 (MQ=255) tttttGATAACGATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTGGGa > 1:8927993/1‑150 (MQ=255) tttGATAACGATCCCAAAGCGTATTTAACAGAACCCGTAATCCAACCGGATCAATTTGCCACCCCCACTCTGAACTTTTCAGATGCGGATTGGGGATCATATTCAGTATGTTGCCCTGCGCATTTTTATTAATGCTTTCGTCGTGGGaaa < 1:7768021/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |