| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,005,308 | A→T | 5.2% | A149A (GCA→GCT) | pldA → | outer membrane phospholipase A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,005,308 | 0 | A | T | 5.2% | 2497.8 / 11.3 | 797 | A149A (GCA→GCT) | pldA | outer membrane phospholipase A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (376/349); new base T (4/66); total (380/417) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.81e-15 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 810 total aligned reads displayed.
GGGATTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGT > NC_000913/4005159‑4005457 | ggATTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAg > 1:8362106/1‑150 (MQ=255) aTTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGt < 2:9226367/150‑1 (MQ=255) ttttAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGtt < 1:4107827/150‑1 (MQ=255) ttttAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGtt < 1:7782341/150‑1 (MQ=255) ttttAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGtt < 1:10715292/150‑1 (MQ=255) tAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGa < 2:10888873/150‑1 (MQ=255) cccGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCt > 2:2437329/1‑150 (MQ=255) cccGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCt > 1:3455999/1‑150 (MQ=255) ccGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTg > 1:11150065/1‑150 (MQ=255) ccGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTg > 2:3401968/1‑150 (MQ=255) ccGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTg > 2:10705310/1‑150 (MQ=255) gAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTgcg < 2:9296765/150‑1 (MQ=255) tCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGAt > 2:5100326/1‑150 (MQ=255) cGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGAtg < 1:6343234/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGAtg < 1:2244442/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGAtg > 1:8079732/1‑150 (MQ=255) ggTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGAtgt < 1:6690536/150‑1 (MQ=255) gtgtTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGAtgtg < 1:6144771/150‑1 (MQ=255) gTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATgg < 1:3771476/150‑1 (MQ=255) tGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATggg < 2:488030/150‑1 (MQ=255) gCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATgggg < 2:3188638/150‑1 (MQ=255) gCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATgggg > 1:3954411/1‑150 (MQ=255) gCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATgggg < 2:876767/150‑1 (MQ=255) cGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGt > 2:2772306/1‑150 (MQ=255) cGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGt < 1:5743257/150‑1 (MQ=255) gTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGta > 1:5456284/1‑150 (MQ=255) tataCGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAAc < 1:989180/150‑1 (MQ=255) ataCGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAAcc > 2:1968750/1‑150 (MQ=255) ataCGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCATGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAAcc > 1:2063412/1‑150 (MQ=255) aCGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCGTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCAc < 2:3886837/150‑1 (MQ=255) gCAAAAATCCTGGTTGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGAAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGTTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGa < 1:5671532/150‑1 (MQ=255) gCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTTCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGa < 2:10299285/150‑1 (MQ=255) gCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGa < 2:4554672/150‑1 (MQ=255) gCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGa > 2:7361350/1‑150 (MQ=255) gCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACCACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGa > 1:4496910/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGAct > 2:7673551/1‑150 (MQ=255) aaaaaTCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGAct < 2:10087520/150‑1 (MQ=255) cTGGTGCCAACTGTCCAATAGCTAAGAGTATTCACCTTTTCGTGAAACCAACTACCAACCCAAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCTATTACCTTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGTAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACgg < 2:5213661/150‑1 (MQ=255) gtggCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCg > 1:1683192/1‑150 (MQ=255) gCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTc > 1:9532249/1‑150 (MQ=255) tGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACGGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTccgacc < 2:9628227/150‑1 (MQ=255) aaTAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCcgacccgacc > 1:6894625/1‑150 (MQ=255) aaTAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGGGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCcgacccgacc > 1:10510741/1‑150 (MQ=255) aTAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCt > 2:3050359/1‑150 (MQ=255) tAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTc > 1:7320339/1‑150 (MQ=255) cgCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCTGTTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTcc < 2:6019317/149‑1 (MQ=255) gCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGTTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTccc < 2:6931562/150‑1 (MQ=255) gAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGc > 2:2261629/1‑150 (MQ=255) aaGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCa < 2:6471147/150‑1 (MQ=255) agTCTTCACCTTTTCGTGAAACCAACTCCGAACCGAATTTGTTCCTGGGTTTTGCCACCTATTACCGTTTTGCTGTTTGGACGCTGCGCTATGTGGAGATGGGTTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCt < 1:3066634/150‑1 (MQ=255) ttCACCGTTTGGTGAAACCAACTACGAACCGAAATTGTTCCTCGTTTTTGCCACCGATTACCTTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGTTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGaa < 2:8407421/150‑1 (MQ=255) ttCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGaa > 1:1180074/1‑150 (MQ=255) ttCACCGTTTCGTGAAACCAACTACCAACCCAAATTGTACCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGATTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGACATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGaa < 2:819109/150‑1 (MQ=255) cACCTTTTCTTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGAGGCTGCGCGATGTGGAGTTGGGTTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAAcc < 1:7152484/150‑1 (MQ=255) gTTTCTTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGTTTTTGCCACCGTTTACCGTTTTGCCGGTTGGACGCTGCGCGTTGTGGAGATGGGTTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCt < 1:4233878/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTtata > 1:6517338/1‑150 (MQ=255) gTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTtata < 1:7581970/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTtata < 2:7214249/150‑1 (MQ=255) gTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTtata > 1:1009170/1‑150 (MQ=255) gTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCATCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTtata > 1:1950356/1‑150 (MQ=255) aCCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGc < 1:9275459/150‑1 (MQ=255) aCCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGc < 2:4470371/150‑1 (MQ=255) aaCTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTg > 1:5280810/1‑150 (MQ=255) aCTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGa < 2:5405207/150‑1 (MQ=255) cTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCTGGTTGGACGCTGCGCGTTGTGGATATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGAt < 1:2464127/150‑1 (MQ=255) aCGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATgg > 2:9821201/1‑150 (MQ=255) ccaaCCGCATTTTTTCCTCGTTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGTTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGc < 2:1107145/148‑1 (MQ=255) gAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATgggg < 1:1493849/75‑1 (MQ=255) aCCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGa > 2:10426505/1‑150 (MQ=255) cGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGaaa > 2:9413134/1‑150 (MQ=255) cAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCTATTACCGTTTTGCTGGTTGGACGCTGCGCTATGTGGAGATGGGTTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAAc < 2:1182596/150‑1 (MQ=255) aaTTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACg < 2:5820367/150‑1 (MQ=255) tGTTCCTCGGTTTTGCCACCTATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGTTGTGGAGTTGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTa < 2:4257628/150‑1 (MQ=255) tGTTCCTCGGTTTTGCCACCGTTTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTa < 2:9101080/150‑1 (MQ=255) gTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTaa > 2:1626040/1‑150 (MQ=255) gTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTaa < 2:3538285/150‑1 (MQ=255) tCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAActggc > 1:4894364/1‑150 (MQ=255) tCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAActggc > 2:7164714/1‑150 (MQ=255) cGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAActggct < 2:1055985/150‑1 (MQ=255) tttGCCACCGATTACCGTTTTGCTGGTTGGACGCGGCGCGATGTGGAGCTGGGGTATACCCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTa < 1:8824511/150‑1 (MQ=255) gCCACCGATTACGGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGaa < 1:7477903/150‑1 (MQ=255) ccACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAg > 2:6277979/1‑150 (MQ=255) cACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGt > 1:10368342/1‑150 (MQ=255) aCCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTg > 1:5096057/1‑150 (MQ=255) cGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGaa < 1:5928427/150‑1 (MQ=255) gATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAg > 2:5630026/1‑150 (MQ=255) gATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAg < 1:8922345/150‑1 (MQ=255) tACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCg > 2:2110104/1‑150 (MQ=255) aCCGTTTTGCTGTTTGGACGCTGCGCGATGTGTAGTTGGTGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGt < 2:6608296/150‑1 (MQ=255) aCCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGt < 1:2647204/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGATATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTg < 2:1420665/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTg < 1:10174679/150‑1 (MQ=255) ccGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTg < 1:7034137/150‑1 (MQ=255) cGTTTTGCAGGTTGGCCGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTgg < 1:3231786/150‑1 (MQ=255) gTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGt > 2:8565585/1‑150 (MQ=255) tttGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGTTGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTAt < 2:8881313/150‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTAtgt > 1:10264459/1‑150 (MQ=255) gCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTAtgtg < 1:4699207/150‑1 (MQ=255) cAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATgtgg > 1:8620558/1‑150 (MQ=255) aGGTTGGACGCTGCGCGCTGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATgtggt < 2:7944361/150‑1 (MQ=255) | GGGATTTTAGGCCCGAACTCGGTGTTGGGTGCGTCTTATACGCAAAAATCCTGGTGGCAACTGTCCAATAGCGAAGAGTCTTCACCGTTTCGTGAAACCAACTACGAACCGCAATTGTTCCTCGGTTTTGCCACCGATTACCGTTTTGCAGGTTGGACGCTGCGCGATGTGGAGATGGGGTATAACCACGACTCTAACGGGCGTTCCGACCCGACCTCCCGCAGCTGGAACCGCCTTTATACTCGCCTGATGGCAGAAAACGGTAACTGGCTGGTAGAAGTGAAGCCGTGGTATGTGGT > NC_000913/4005159‑4005457 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |