| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 267,472 | C→G | 5.4% | P178P (CCG→CCC) | yafZ ← | CP4‑6 prophage; conserved protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 267,472 | 0 | C | G | 5.4% | 2556.1 / 22.3 | 748 | P178P (CCG→CCC) | yafZ | CP4‑6 prophage; conserved protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (403/292); new base G (2/51); total (405/343) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 757 total aligned reads displayed.
GGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCAAACGACTCACCGCAGAC > NC_000913/267324‑267621 | tcCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGt > 2:1102538/1‑150 (MQ=255) ccTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTg < 1:462611/150‑1 (MQ=255) gAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCa > 1:5159149/1‑150 (MQ=255) gAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCa > 2:1316556/1‑150 (MQ=255) aaTACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCaa > 1:2055270/1‑150 (MQ=255) tACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACa < 1:10057335/150‑1 (MQ=255) cTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCaa < 1:8797790/150‑1 (MQ=255) tGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAAc < 2:6896777/150‑1 (MQ=255) tGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAAc > 1:8224710/1‑150 (MQ=255) tGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAAc > 1:7281578/1‑150 (MQ=255) gTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGa < 2:4172249/150‑1 (MQ=255) aCGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACt > 2:6120137/1‑150 (MQ=255) aCGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACt < 2:2729482/150‑1 (MQ=255) tGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGAGTGCa > 2:6659175/1‑150 (MQ=255) gTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATg > 2:4838517/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGc > 1:6095619/1‑150 (MQ=255) ccACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGc > 1:3646212/1‑150 (MQ=255) caGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAACGCGTTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCACCAGCAACGACTGCATGGCATc < 2:10742391/150‑1 (MQ=255) ggTCATTGCTCTCATCCAGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGACGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATCGCATccc > 1:7096032/1‑150 (MQ=255) ctctCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcc < 2:5972211/150‑1 (MQ=255) tctcATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcct > 2:10050026/1‑150 (MQ=255) tctcATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcct > 1:5010090/1‑150 (MQ=255) tctcATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcct > 2:7483146/1‑150 (MQ=255) tctcATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcct > 1:2907487/1‑150 (MQ=255) tctaATCCTGCCAGCGTCTAGGGGATAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCAGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGTGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcct > 2:3614577/1‑150 (MQ=21) ctcATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCCCCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTCTGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGGGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCACCAGCCCCGACTGCATGGCATCCCGTTTctccgc > 2:9782137/1‑148 (MQ=255) ctcATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTctcctc < 2:4584175/150‑1 (MQ=255) ccTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCGTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCACCGACTGCATGGCATCCCGTGTCTCCTCCAccc > 2:3873616/1‑150 (MQ=255) ctgcctgcGGGGTGGGTCGAGGATCTGCTATTCAGCCCCGGGCTGGTGGTCTACACCAACGCGGTTTGTGCGGGGGGCTTTTGCCTGTGCCTGCTGGGCGGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCg < 1:3237519/150‑1 (MQ=21) cTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCg < 2:7952189/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCGGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCgg < 2:3101450/150‑1 (MQ=255) tGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCgg > 1:6965818/1‑150 (MQ=255) gCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTCTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGt < 2:1948942/150‑1 (MQ=255) gcggcgAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCaaa > 2:3176067/1‑150 (MQ=255) gcggcgAGGGGAGAGCATCTGCCATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTACACCAAACCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCaaa < 2:5190411/150‑1 (MQ=255) cgAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATc > 1:11078957/1‑150 (MQ=255) gAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATcc > 1:23416/1‑150 (MQ=255) gAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATcc > 2:330731/1‑150 (MQ=255) ggAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAg > 2:4445107/1‑150 (MQ=255) gagaGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCGGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTGCTCCACCCGGTCATAAATCCCCAGc > 2:9008470/1‑150 (MQ=255) gagaGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGc > 2:5433714/1‑150 (MQ=255) ggATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCt > 1:7460164/1‑150 (MQ=255) tttCTGCTATTCTGTCCCGGGGTGGTGGTCTTCACCAACGGGGTTTGTGTGGGGGGCTTTTGCCTGTGCCTGCTGTGCGGGGGGTGGCAAAAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTc < 1:4284948/148‑1 (MQ=21) aTCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCa < 2:4291057/150‑1 (MQ=255) aTCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCa > 2:1541943/1‑150 (MQ=255) tGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAACGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATAc < 2:10431724/150‑1 (MQ=255) tGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATAc > 2:7828980/1‑150 (MQ=255) tGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATAc > 2:2571294/1‑150 (MQ=255) aTTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTTTGTGTGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACgcgc < 2:5046132/150‑1 (MQ=255) aTTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACgcgc < 2:8393634/150‑1 (MQ=255) tCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCaa > 2:5319456/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCaa > 2:1618530/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCaa > 2:5740997/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCaa > 1:2999207/1‑150 (MQ=255) tCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCaa > 2:9711665/1‑150 (MQ=255) cACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGGGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAAt < 2:2246066/150‑1 (MQ=255) ggCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCAcc < 1:6657014/150‑1 (MQ=255) gCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCt > 1:3888426/1‑150 (MQ=255) gCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCt < 1:9901282/150‑1 (MQ=255) tggtggTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGa < 2:9443672/150‑1 (MQ=255) gtCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTcac > 2:1228909/1‑150 (MQ=255) tCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTcacc > 2:9898797/1‑150 (MQ=255) cTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTcacca > 1:1417566/1‑150 (MQ=255) ttCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCACCTTCAATCACCTGACTcaccac > 1:5649253/1‑150 (MQ=255) tCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACg > 1:6480344/1‑150 (MQ=255) tCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACg > 2:8125848/1‑150 (MQ=255) aCCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTc > 1:1239004/1‑150 (MQ=255) ccAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCTCCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTcc > 1:10829733/1‑150 (MQ=255) ccAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTcc > 1:8573091/1‑150 (MQ=255) caaaaGGGGTTTGTGTGGGGGGCTTTTGCCTGTGCGTGGTGTGCGGGGGGTGGAAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTcc < 1:4827991/148‑1 (MQ=21) cAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTccc > 1:2506038/1‑150 (MQ=255) aacgCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCGGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTcccc < 1:9751774/147‑1 (MQ=255) acgCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTccccc < 2:2365814/148‑1 (MQ=255) aaGCGGTTTGTGAGGGCGGATTTTGCCAGTGCGTGCTGTGCGGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTccccc < 2:10315137/150‑1 (MQ=255) aaGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTccccc < 2:1794132/150‑1 (MQ=255) gTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTagtg > 1:9097500/1‑150 (MQ=255) tATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTtgtgt < 2:295023/150‑1 (MQ=255) tATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTtgtgt < 2:7142474/150‑1 (MQ=255) tATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTACATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTtgtgt < 1:4405551/150‑1 (MQ=255) aTGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTtgtgtg < 1:2772726/150‑1 (MQ=255) aTGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTtgtgtg < 2:9275203/150‑1 (MQ=255) tgtgAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTtctc > 1:5304650/1‑75 (MQ=255) tgAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCa < 2:6395892/150‑1 (MQ=255) gAGGGCGGCTTTTGCCTGTGCCTGCTGTGCGGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCAc < 2:4713150/150‑1 (MQ=255) ggcggcTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAAAGACAGCATGGCATCCCGTTTCTCCACCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATCCGCGCCTTCAATAACCAGACACACCACGTCCCCCAAGTGTGGCAcccc > 1:10583137/1‑149 (MQ=21) gcggcTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGc > 1:9335705/1‑150 (MQ=255) cggcTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCa < 1:6924076/150‑1 (MQ=255) ttttGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTc > 1:10246087/1‑150 (MQ=255) ttttGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTc > 1:1522445/1‑150 (MQ=255) tttGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCg < 1:9595576/150‑1 (MQ=255) ccAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCaa > 2:7217403/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCaa > 1:7785482/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCaa > 2:8711469/1‑150 (MQ=255) cAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCaaa > 1:2854418/1‑150 (MQ=255) aGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCAAAc < 1:1818159/150‑1 (MQ=255) gTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCAAACg > 1:550165/1‑150 (MQ=255) cgtgctgTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCCCCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCAAACGACt < 2:5593170/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCAAACGACt > 2:1059947/1‑150 (MQ=255) gctgTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCAAACGACTCAc > 1:6330749/1‑150 (MQ=255) tgCGGGGGGGGGAACCCGCAACGACTGCAGGGCATCCGGTTTCTCCTCCACCCGGAAAAAAAGCCCCAGCACCTCATCCGCGCCTTCAATCCCCTGCCTCACCACGGCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCACACGACTCACCGCa < 1:3409622/150‑1 (MQ=18) | GGTTCTCCTGAATACGCTGGTACGTGGTCCACAGGTCATTGCTCTCATCCTGCCAGCGGCGAGGGGAGAGGATCTGCGATTCAGTCACCGGCTGGTGGTCTTCACCAAAGCGGTATGTGAGGGCGGCTTTTGCCAGTGCCTGCTGTGCCGGGGGTGGCAACAGCAACGACTGCATGGCATCCCGTTTCTCCTCCACCCGGTCAAAAATCCCCAGCACCTCATACGCGCCTTCAATCACCTGACTCACCACGTCCCCCTTGTGTGGCACCCGCACCTCGCCAAACGACTCACCGCAGAC > NC_000913/267324‑267621 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |