Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 4,596,823 | 0 | A | C | 7.8% | 1763.4 / 32.8 | 584 | E278D (GAA→GAC) | lgoD | L‑galactonate oxidoreductase; L‑gulonate oxidoreductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (380/144); new base C (2/57); total (383/201) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-26 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 604 total aligned reads displayed.
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |