| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 361,323 | G→C | 10.6% | R180G (CGG→GGG) | lacA ← | thiogalactoside acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 361,323 | 0 | G | C | 10.6% | 1608.2 / 31.0 | 513 | R180G (CGG→GGG) | lacA | thiogalactoside acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (135/313); new base C (59/4); total (196/317) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.79e-23 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 520 total aligned reads displayed.
ATGCCGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGA‑ATAACCCGACAAGGAACGCCAGCCGCCACGACGTTTGGTGGAATGTCTTTTGTGACGATACTACCCGCGCCAATAACAGAATTATCCCCGATGGTGACGCCTGGATTAATAACCACATGACTTCCGATCCAGACGTTATTGCCAATCGTTATCGGAA > NC_000913/361174‑361472 | ccGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGA‑ATAACCCGACa > 2:6372770/1‑150 (MQ=255) cGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGA‑ATAACCCGACaa < 2:4396888/150‑1 (MQ=255) cGGATGCGGCTAATGTAGATCGCTGAACTTGTAGGCCTGATAAGCGCAGCGTATCAGGCAATTTTTATAATTTAAACTGACGATTCAACTTTATAATCTTTGAAATAATAGTGCTTATCCCGGTCGTTTATTTCGCGA‑ATAACCCGACaa < 1:5204373/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |