Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 708,015 | T→A | 6.5% | intergenic (+258/‑319) | glnS → / → chiP | glutamyl‑tRNA synthetase/chitoporin, uptake of chitosugars |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 708,015 | 0 | T | A | 6.5% | 1885.8 / 15.4 | 606 | intergenic (+258/‑319) | glnS/chiP | glutamyl‑tRNA synthetase/chitoporin, uptake of chitosugars |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (234/309); new base A (58/2); total (295/311) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.28e-17 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 622 total aligned reads displayed.
ATGATCTCTGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCGG > NC_000913/707866‑708164 | aTGATCTCTGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAAt < 2:5865832/150‑1 (MQ=255) tGATCTCTGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAAtt > 1:10165040/1‑150 (MQ=255) tctcTGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGAAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTAt < 1:5556929/150‑1 (MQ=255) ctctGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATc < 1:6046988/150‑1 (MQ=255) ctctGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATc < 1:1347878/150‑1 (MQ=255) ctctGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATc < 2:3420353/150‑1 (MQ=255) gCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATATGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAATAAACAGCAAAAAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCata < 1:4261/150‑1 (MQ=255) cAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCataa < 1:3529987/150‑1 (MQ=255) cAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCaaaa > 1:1736845/1‑150 (MQ=255) atatTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCataaaata < 1:10954907/150‑1 (MQ=255) atTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCataaaataaa < 2:4627432/150‑1 (MQ=255) atTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCataaaataaa < 2:6589331/150‑1 (MQ=255) atTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGAATCCGTCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCataaaataaa < 1:5220603/150‑1 (MQ=255) ttGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGAAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAaaataaat < 1:1498193/150‑1 (MQ=255) gTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTaa < 1:6828549/150‑1 (MQ=255) tttGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTaaa < 1:1994774/150‑1 (MQ=255) cGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCTTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCTAACAATCCACACCGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCGGCTTCGCAATTTATCCATTATATAAATTTAAAATaa < 2:4017488/150‑1 (MQ=38) cGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATaa < 2:1657430/150‑1 (MQ=255) ttttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTAGCGAATTAATTCCGCTTCGCAAATTATCCAAAAAATAAAATTAAAATAACaaaa > 1:2656050/1‑150 (MQ=39) tttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAACCGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAAc < 1:6400943/150‑1 (MQ=255) tttGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAATAAACAAAAc > 2:7151021/1‑150 (MQ=255) ggCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAAtt > 2:8700692/1‑150 (MQ=255) gCCGGATGCGGCGTGAACGCCTTATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAAATCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATta > 2:2400384/1‑150 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTGTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTACGCGTCGCAATTTATCCATAAAAAAAATTTAAAATAACAAAACAAAATta > 1:10026540/1‑150 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCAAAAAATAAATTTAAAAAAACAAAAAATAATta > 1:9962469/1‑150 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTAGTCGCCAAATAATTCCCCGTCGCAAGTTAAACAAAAAATAAAATTAAAATAAAAAAAaataaata > 1:10569354/1‑150 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTATGCTTTTATTCGCCAATTAAATACGCTTAGCAAATTATACAAAAAAAAAAATTAAAATAAAAAAAAAAAATta > 1:5318069/1‑150 (MQ=255) gCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTTTTCTGCTTTTCGTCGCGAAAAAATTCCGCGTCGCAATTTATCCCTAAAATAAATTTAAAAAAACAAAACAAAAAta > 2:6788888/1‑150 (MQ=255) cGGATGCGGCGTTAACGCCTTATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATtaaa < 2:985328/150‑1 (MQ=255) cGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAGCAAAACATAATtaaa < 2:8399355/150‑1 (MQ=255) gATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGGATTTATTCCGCGTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAAAAAAaataaata > 1:4456476/1‑150 (MQ=255) gATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCCATTTATACAAAAAATAAATTTAAAATAAAAAAACATAATtaaata > 2:1216111/1‑150 (MQ=255) gATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCAGCTTCGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAAaataaataaata > 1:7211925/1‑150 (MQ=255) atggCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATaaaa < 2:1106641/148‑1 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAACAAAAAATAATTAAATAAAATGt > 2:7907205/1‑150 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTTGTCGGCGTTTCTTCCCGAAATAATTACCCGGCCCAAAATAACCAAAAAAAAAAGTTAAAAAAACAAAAAATAATTAAATAAAAAGt > 1:7970982/1‑150 (MQ=255) gCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGAGTTCAGCGGCGTTTTTTGTTGTTTTAATAGCGAAATAAATAAGAGTAGCAATTTATAAATAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAAAATAAATAAATAAAAttt > 1:8809937/1‑148 (MQ=255) ttCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTGTGGTTTTCTGCGCGAATTAATTCCCCTTCGCACTTTATGCATAAAAAAAATTTAAAAAAACAAAAAAAAATTTAATAAAAAGTaca > 1:8670714/1‑148 (MQ=255) tCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCGTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCGTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAAcc > 2:4178331/1‑150 (MQ=255) cACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCAAAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATTTAAACg > 2:10668079/1‑150 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGc < 2:2212938/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGc < 2:8941202/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTACGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGc > 2:688522/1‑150 (MQ=255) ccgcATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTATGCTTTTCGTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAAATTATACATAAAATAAAATTAAAATAACAAAACATAAATAAATAAAATGTAACCGCttt > 2:3056854/1‑150 (MQ=255) cgcATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTGTGCTTTTGTTAGCGAATTAATTACGCGTCGCAAATTATCACTAAAATAAATTTAAAATAAAAAAACAAAAATAAATAAAATGTAAACGcgatc > 1:10721639/1‑146 (MQ=255) cgcATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTc < 2:8188706/150‑1 (MQ=255) cATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTGTTTTATGCTTTTGTTCGCGAATTAATTAAGCGTAGCCATTTATCCAAAAAATAAATTTAAAATAAACAAAAATAAATAAATATAATGTAAACGCgttgag > 1:9452941/1‑147 (MQ=255) aTCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATc < 2:6359617/150‑1 (MQ=255) tCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCt < 2:4929456/150‑1 (MQ=255) tCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTATGCTTTTCTTCGCGAATAAATTCCGCTTAGCAATTTATACATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAAAATAATAAAATAAAATTTAAACGCTTTAAtat > 2:1020654/1‑148 (MQ=255) ggCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGc < 2:4297388/150‑1 (MQ=255) gCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCt < 1:3009245/150‑1 (MQ=255) gCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCt < 1:5466653/150‑1 (MQ=255) gAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑aa < 1:8128285/150‑1 (MQ=255) gAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑aa < 1:9226480/150‑1 (MQ=255) aaaCCGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AAt < 1:5777265/150‑1 (MQ=255) aCAGCAAACAATCCAACACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AAttt < 2:5689142/150‑1 (MQ=255) cAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTc < 1:7022669/150‑1 (MQ=255) aGCAAACAATCCACAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCa < 2:2768788/150‑1 (MQ=255) aGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCa < 1:8356338/150‑1 (MQ=255) gCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCAc < 2:6191584/150‑1 (MQ=255) cAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACg < 2:9115412/150‑1 (MQ=255) cAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAAAAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTTCTGG‑GATTTCACGCTTTTAttc > 2:1780001/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTAACGCTTTTAttct > 2:7309780/1‑150 (MQ=255) aaaaCGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCGTTTCGTAGCGAATTAATTCCCCGGCGCAAATTATCCAAAAAAAAAAATTAAAAAAAAAAAACAAAAATAAAAAAAATGTAACCGCGTTCAAAGTGCTGG‑AATTTAACGCTTTTAttat > 2:4803349/1‑148 (MQ=255) aaaCGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAAATAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCGTTTAttctt > 2:4557413/1‑150 (MQ=255) aaCGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTAttcttc < 2:5498426/150‑1 (MQ=255) gccgcGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTATTAGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCAAAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTGTCAACTTGCTGG‑CATTTCACGCTTTTATTCTTCTGc > 2:615567/1‑150 (MQ=255) ccgcGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCa < 2:7521414/150‑1 (MQ=255) gTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAAATAAATAAAATGTAACCGCTTTCATAATGCTGG‑AATTTCAAGCTTTTATTCTTATGCAAGcc > 2:10799738/1‑150 (MQ=255) gTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCATCGCGAATTAATTCCCCGTCGCAAATTATCCCAAAAAAAAATTTAAAAAAACACAACATAAATAAAAAAAAATTAACCCCTTGCATCATGCTGG‑AAATTCACGCGGTTATTCTTCTGCAAGcc > 2:9333925/1‑150 (MQ=255) ttttttCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCa < 1:6910284/150‑1 (MQ=255) ttttttCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCa < 2:9483555/150‑1 (MQ=255) tGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAATCCTTTCAACCGCAAACTTaa > 1:6631280/1‑150 (MQ=255) tGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTaa < 1:2807038/150‑1 (MQ=255) tGCCTTTCTTCGCGAAGTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAACTAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTaa < 1:2193037/150‑1 (MQ=255) gCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAg > 1:9725585/1‑150 (MQ=255) cTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGc > 1:3850736/1‑150 (MQ=255) cTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGc > 2:7765842/1‑150 (MQ=255) ttttCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGcc > 2:9755919/1‑150 (MQ=255) ttttCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGcc > 1:6193586/1‑150 (MQ=255) ttcttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCtt < 1:3278091/150‑1 (MQ=255) tcttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTg < 1:10431982/150‑1 (MQ=255) tcttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTg < 1:2525534/150‑1 (MQ=255) tcttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTg < 2:3835357/150‑1 (MQ=255) cttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGt < 2:3227996/150‑1 (MQ=255) ttcGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTa < 2:1984714/150‑1 (MQ=255) gcgAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACa > 1:3624116/1‑150 (MQ=255) cgAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACaa < 1:4036664/150‑1 (MQ=255) attaattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACaaaaa < 1:4896835/150‑1 (MQ=255) ttaattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAat < 2:288887/150‑1 (MQ=255) ttaattCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAat < 2:2609644/150‑1 (MQ=255) attCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGGAAATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatca < 2:5411997/150‑1 (MQ=255) ttCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatcatc < 1:7480250/150‑1 (MQ=255) ttCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAatcatc > 1:9133262/1‑150 (MQ=255) tCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAAtcatca > 2:882847/1‑150 (MQ=255) tCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTCGTAACAAAAAtcatca > 2:5157145/1‑150 (MQ=255) cGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCaaa < 2:3699166/150‑1 (MQ=255) cGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCaaa > 2:60154/1‑150 (MQ=255) cAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATAtgtg > 2:1440325/1‑150 (MQ=255) | ATGATCTCTGCAATATATTGAGTTTGCGTGCTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAAGAAACAGCAAACAATCCAAAACGCCGCGTTCAGCGGCGTTTTTTCTGCTTTTCTTCGCGAATTAATTCCGCTTCGCAATTTATCCATAAAATAAATTTAAAATAACAAAACATAATTAAATAAAATGTAACCGCTTTCATCTTGCTGG‑AATTTCACGCTTTTATTCTTCTGCAAGCCTTTCAACCGCAAACTTAAGCCTTGTAACAAAAATCATCAAAATATGTGCGG > NC_000913/707866‑708164 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |