Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 863,966 | A→C | 8.3% | T109P (ACC→CCC) | fsaA → | fructose‑6‑phosphate aldolase 1 |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 863,966 | 0 | A | C | 8.3% | 2014.8 / 43.2 | 770 | T109P (ACC→CCC) | fsaA | fructose‑6‑phosphate aldolase 1 |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (341/347); new base C (79/2); total (420/350) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.64e-20 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 781 total aligned reads displayed.
AGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTATTGAAAATGCATGCGCCG > NC_000913/863817‑864115 | gTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAAcc < 1:5352234/150‑1 (MQ=255) tGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGACCCGCgg > 2:136701/1‑150 (MQ=255) ggCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGt < 2:3153836/150‑1 (MQ=255) 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tAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACt > 2:6926707/1‑150 (MQ=255) aacaGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACtt < 2:8111168/147‑1 (MQ=255) aaGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGACCCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTac > 1:2608776/1‑150 (MQ=255) gCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTacac < 1:1673551/150‑1 (MQ=255) gCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGACGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTAGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGAGACCGACTTacac > 1:9731349/1‑150 (MQ=255) ggAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCa < 2:9743289/150‑1 (MQ=255) gAAGGGATTCCGACGCTGGGACCCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAg > 1:1364223/1‑150 (MQ=255) aaGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGt < 1:5703811/150‑1 (MQ=255) aGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGtt < 1:5815767/150‑1 (MQ=255) aGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGtt < 2:2344120/150‑1 (MQ=255) ggATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTAt < 1:7604565/150‑1 (MQ=255) ggATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTAt > 2:5465628/1‑150 (MQ=255) aTTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTATTg > 2:6483229/1‑150 (MQ=255) cGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTATTGaaaa < 2:8627094/150‑1 (MQ=255) cGACGCGGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATCCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTATTGaaaa > 2:5637622/1‑150 (MQ=255) 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gAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTATTGAAAATGCATgcgc > 1:113383/1‑150 (MQ=255) gAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTATTGAAAATGCATgcgc < 1:10312522/150‑1 (MQ=255) | AGGTAATGGCTACCACTGCCGAAGGGATGGTTAATGACGCGCTTAAGCTGCGTTCTATTATTGCGGATATCGTGGTGAAAGTTCCGGTGACCGCCGAGGGGCTGGCAGCTATTAAGATGTTAAAAGCGGAAGGGATTCCGACGCTGGGAACCGCGGTATATGGCGCAGCACAAGGGCTGCTGTCGGCGCTGGCAGGTGCGGAATATGTTGCGCCTTACGTTAATCGTATTGATGCTCAGGGCGGTAGCGGCATTCAGACTGTGACCGACTTACACCAGTTATTGAAAATGCATGCGCCG > NC_000913/863817‑864115 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |