Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,481,804 | G→T | 8.8% | P125T (CCA→ACA) | emrY ← | putative multidrug efflux system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,481,804 | 0 | G | T | 8.8% | 2676.2 / 40.8 | 891 | P125T (CCA→ACA) | emrY | putative multidrug efflux system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (485/281); new base T (2/110); total (487/404) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.94e-40 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 910 total aligned reads displayed.
TATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACC > NC_000913/2481655‑2481953 | atCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGa < 1:10648028/150‑1 (MQ=255) aCCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTaa > 1:10591443/1‑150 (MQ=255) aCCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTaa < 2:8366627/150‑1 (MQ=255) ccccAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAAc < 2:4287148/150‑1 (MQ=255) cccAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACg > 2:10836514/1‑150 (MQ=255) cTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGcccc > 1:2694946/1‑150 (MQ=255) aaGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGcc < 2:9843334/150‑1 (MQ=255) aGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCa < 2:8082928/150‑1 (MQ=255) aGTAATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAACGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCGGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCa < 1:6591187/150‑1 (MQ=255) gTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCAt > 2:10466373/1‑150 (MQ=255) ttATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCAtt < 2:772496/150‑1 (MQ=255) ttATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCAtt > 2:7641211/1‑150 (MQ=255) ttATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCAtt > 2:5802346/1‑150 (MQ=255) tCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACTGCCCCGCCATT‑AAc > 1:7456028/1‑150 (MQ=255) tCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AAc < 2:9389119/150‑1 (MQ=255) acaAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AAccc < 1:340299/150‑1 (MQ=255) acaAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AAccc > 1:4992102/1‑150 (MQ=255) caAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AAcccc > 1:3639767/1‑150 (MQ=255) aaaTATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCt < 1:6851516/150‑1 (MQ=255) tataACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGaa < 2:564921/150‑1 (MQ=255) tataACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGaa < 2:3165290/150‑1 (MQ=255) tataACCCCCCAATATCGGCCCACATATCTGATCGATAATCACGCTCATTGACCATAATCCCAGAGCAAATGTTCTTTTATCTGGCGTATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACTGCCCCGCCATT‑AACCCCTTaa < 2:1717596/150‑1 (MQ=255) cAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTaaa > 1:631065/1‑150 (MQ=255) aaTATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTaaaa > 2:2696363/1‑150 (MQ=255) atCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAat > 1:4769241/1‑150 (MQ=255) cGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAatat > 2:899309/1‑150 (MQ=255) gccaaaatatCGTAGCTATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCATATAAAATGTTATTTTTTCTGGCGTATAATTCCTTAATAATAAACTATGTGACAGTGTAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCa < 2:1338502/144‑1 (MQ=255) gCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTCACAGAGGAATTAACGGCCCCGCCATG‑AACCCCAGAACGACTCTAAAAAATATCa > 2:7338372/1‑150 (MQ=255) cccACATATGGGTGCGTTAATCAGGGTCTTTGACCTTAATGCCTGAGCAATTGTTCTTTTTTGTGGGGGATATTTCCTTAATATTAAACTCTGTGACTGTGGATTTAAGGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAg < 2:9646918/150‑1 (MQ=255) ccACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGc > 1:5723445/1‑150 (MQ=255) acaTATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGcac > 1:3838605/1‑150 (MQ=255) acaTATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGcac > 2:6146579/1‑150 (MQ=255) tCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCaa > 2:2938809/1‑150 (MQ=255) tCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCaa > 1:7087524/1‑150 (MQ=255) ggAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGa > 1:11081457/1‑150 (MQ=255) ggAGCGATAATCAAGGTCATTGACCCTAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAATCTCTGTGAAAGTGTAATTAACGGACCCGCCATT‑AACCCCTGAACTACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGa > 1:10865424/1‑150 (MQ=255) gataTAATCACGTTAATTGAAAATAATGCCATAGAAAATGTTCTTTTTTCTGGCGTATAATTCATTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTg < 2:7127727/147‑1 (MQ=255) taTAATCAGGTTAATTTACAATAATGCAAGAGAAATTTTTATTTTTTCTGGGGTATAATTCATTAATAATAAACTCTGTTACAGTGTAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGt < 1:7319163/149‑1 (MQ=255) taTAATCACGTTATTTTACCATAATGCCAGATAAATTGTTCTTTTTTCTGGGTTATATTTACTTAATAATAAACTCTGTGACTGTGTAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGt < 1:291240/149‑1 (MQ=255) aaTCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGa > 2:10601817/1‑150 (MQ=255) aaTCACGGTAATTTACCATATTGCATTAGCAATTGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAAGTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGa < 2:9551410/150‑1 (MQ=255) ncACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATa > 1:9324157/2‑150 (MQ=255) cACGGTAATTTACCATAATGCCATATCAATTGTTCTTTTTTGTGGCGTATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACTGTGGAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAg < 1:10216568/150‑1 (MQ=255) cGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGc > 2:1234691/1‑150 (MQ=255) cATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTaca < 2:6779504/150‑1 (MQ=255) ttGACAATATTGCCATAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGTATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTAcaca < 2:5292881/150‑1 (MQ=255) aCCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAAc < 1:1851214/77‑1 (MQ=255) aCCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAAc > 2:1851214/1‑77 (MQ=255) cATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAAt > 1:2295579/1‑150 (MQ=255) aaTAATGCCAGAGCAATTGTTATTTTTTCTGGCGGAAAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAAt < 2:2391231/149‑1 (MQ=255) aaTGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGaa < 2:8204264/150‑1 (MQ=255) aaTGCCAGAGAAATTGTTATTTTTTCTGGCGTATAATTCATTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGATTTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGaa < 1:1411998/150‑1 (MQ=255) agagCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGc > 2:6596544/1‑150 (MQ=255) agagCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAAGTCCTGAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑CACCCCGGAACGACGCTAAAATATATCAGCACGTCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACCGc > 2:4691359/1‑150 (MQ=255) cAATTGTTATTTTTTCTGGCGTATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTTACAGTGGAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGaaa < 2:6475069/150‑1 (MQ=255) cAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGaaa > 1:836498/1‑150 (MQ=255) aaTGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGaaaaa > 1:6496178/1‑150 (MQ=255) ttttttttttCTGGCGTATAATTCTTTAATAATAAAATCTGTTACTGTGTATTTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCATTAACGACTATAAAAAATATCAGAACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGaaaaaaaa < 2:8844000/146‑1 (MQ=255) ttCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAg > 1:5213823/1‑150 (MQ=255) cTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTg > 2:488596/1‑150 (MQ=255) ttttttCTTGCTGATAATTCCTTAATATTAAAATCTGTTACTGTGTAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCTAAAAAAAAGTGa < 2:10061109/150‑1 (MQ=255) ttttttCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGa > 1:4422185/1‑150 (MQ=255) ttttttCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGa > 1:5321790/1‑150 (MQ=255) ttttttCGGGCGTATATTTCCTTAATATTAAACTCTGTGACCGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGa < 2:3731754/150‑1 (MQ=255) ttttCTGGCGTATAATTCATTAATAAAAAACTCTGTGACTGTGTAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACt < 1:1610453/150‑1 (MQ=255) ttCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGa > 2:3081112/1‑150 (MQ=255) ttCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGa > 1:9562017/1‑150 (MQ=255) tCTGGCGTATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTTGAATTAACGGCCCCGCCATT‑ACCCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGaa < 2:8719223/150‑1 (MQ=255) cTGGCGTATAATTCCTTAATAATAAACTCTGGTACCTTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGaaa < 1:9870839/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAg > 1:10034084/1‑150 (MQ=255) tGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAg > 1:10988770/1‑150 (MQ=255) taTAATTCATTAAAAATAACCTCTGTTACAGTGTAATTAACGGCCCCGAAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTaaaa < 1:9739023/149‑1 (MQ=255) gATATTTCTTAAAAAATAAACTCTGTTACTGTGCATTTAACGGCCCCTCCATT‑AACCCCTGAACTACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTaaaa < 1:10370468/150‑1 (MQ=255) aatttCCTTAATAATAAACTCTGTGACTGTGGAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGCACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAaat < 1:8580896/147‑1 (MQ=255) aaTTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAaata > 2:11145512/1‑150 (MQ=255) aaTTCATTAATAATAACCTCTGTGACCGTGCAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAaata < 1:4024458/150‑1 (MQ=255) ttCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAaataat < 2:5459687/150‑1 (MQ=255) ttCATTAATAATAAACTCTGTGACAGTGTAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAaataat < 1:9086636/150‑1 (MQ=255) cTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCtt > 1:2418979/1‑150 (MQ=255) ttAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTa > 2:10363887/1‑150 (MQ=255) ttAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTa > 2:4513937/1‑150 (MQ=255) ttAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACT‑AAAGTAAAAATAATCTTaa > 2:701473/1‑150 (MQ=255) taataataaACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTaa > 2:1547833/1‑150 (MQ=255) ataataaACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAtt > 1:2113022/1‑150 (MQ=255) aataaACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCg > 1:8825034/1‑150 (MQ=255) aataaACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCg > 2:6030472/1‑150 (MQ=255) ataaACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGc > 1:325530/1‑150 (MQ=255) ctcgGTCACTGTGAAATTAAC‑GCCCCCCCATTAAACCCCTCAACTACTCTAAAAAATATCAGCACATCAACATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCTAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTAtt < 2:4009975/150‑1 (MQ=255) tctGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACAACAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTTACTGAAAGTAAAAATAATCTTAAATCGCCTAtac > 1:2582095/1‑148 (MQ=255) tgtgACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAGGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCtt > 2:3449112/1‑150 (MQ=255) gttaCAGTGGAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCttt < 2:2100911/147‑1 (MQ=255) gtgACCGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCttt < 1:5940036/150‑1 (MQ=255) gtgACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCttt < 1:3105043/150‑1 (MQ=255) tgACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTtg > 2:8517808/1‑150 (MQ=255) taCAGTGCAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTCAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTtgt < 2:6304339/149‑1 (MQ=255) gACAGTGTAATTAACGGCCCCGCAATT‑AACCCCTTCACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTtgt < 1:7893075/150‑1 (MQ=255) tGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCaa > 1:7715554/1‑150 (MQ=255) gAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGt > 2:1102246/1‑113 (MQ=255) gAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAAcc > 1:6179822/1‑150 (MQ=255) gAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAAcc > 1:8130491/1‑150 (MQ=255) | TATCCAACCCCAGCTAAAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATT‑AACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACC > NC_000913/2481655‑2481953 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |