| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,639,280 | C→A | 15.9% | E2* (GAA→TAA) | yfgM ← | ancillary SecYEG translocon subunit; putative anti‑RcsB factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,639,280 | 0 | C | A | 15.9% | 1572.3 / 63.8 | 540 | E2* (GAA→TAA) | yfgM | ancillary SecYEG translocon subunit; putative anti‑RcsB factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (111/315); new base A (100/2); total (223/317) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.20e-45 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 546 total aligned reads displayed.
GCGTGCAGAATCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGCACCACAGCAAC > NC_000913/2639131‑2639429 | cGTGCAGAATCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTcc < 2:9586037/150‑1 (MQ=255) gCAGAATCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTGGTTGTCGTAAATTTGCAcc > 1:10725872/1‑149 (MQ=255) cAGAATCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTGTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTGGGTCGCGGAAATTTCCCCGc > 2:4406848/1‑150 (MQ=255) aaTCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGt < 2:7225361/150‑1 (MQ=255) aTCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGATTAACCGCTTCTACCTGGACGTTTTCGTTAACGAAAAATTACACCCAGtc > 2:10779051/1‑150 (MQ=255) aTCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACACCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGtc < 2:1630003/150‑1 (MQ=255) tCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTCGTTCTCGTAAATTTACACGCGGtcc > 2:8891882/1‑150 (MQ=255) aCCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTGGTTGTGGTTTATTTGGACGCTGtgcgtg > 1:8878296/1‑145 (MQ=255) aTGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTGGTTGGCGGAAATTTACACCCTGtccgtctccat > 2:5323928/1‑148 (MQ=255) aTGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTACACGCTGtccttctcctt > 1:6394452/1‑150 (MQ=255) aTGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGGTGGCGTAAATTTACACCCGGtccgtctcctt > 1:391881/1‑150 (MQ=255) ggCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCtccttcc < 2:10232484/150‑1 (MQ=255) tGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTAGTTGTGGTTAATTTTCACGCTGTGCTTCTacttgcttt > 2:7847732/1‑149 (MQ=255) ttCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAAc < 1:7302540/150‑1 (MQ=255) ttCCAGTAGCGCCAGACAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTCGGTATCGTAAATTTCCACGCGGTCCTTCTCCTTCGTTAAc > 1:9941555/1‑150 (MQ=255) tCCAGTAGCGCCAGCCAAACAGAGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCATTGCCAATTTCAGCAAAAAAGCGATTAACCGCTTCTACCTCGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAAcc < 1:10251686/150‑1 (MQ=255) gTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCCACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTCGGGCGCCTAAATGTACAAGCTGTCCTACACCGTCCCAAACCCAgg > 1:7432282/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAAc < 1:2577460/150‑1 (MQ=255) ccagccaATCAGTGCGCCAACGCCCTAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCTTTTTCAGCAAAAAAGCTTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTg < 1:10997753/150‑1 (MQ=255) ccagccaATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTAGGTGTGGTAAAATTACACCCGGTGCGTATCGATGCATAAACCAGTAAAGTg > 1:9373794/1‑150 (MQ=255) gccaATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTGGTTCGCGGAAATTTACAAGCTGTCCGTCTCCGTCCGTTAACCAGGAACGTgcgc > 2:10875193/1‑150 (MQ=255) aTCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAAt < 1:4378267/150‑1 (MQ=255) aTCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAAt < 2:2012737/150‑1 (MQ=255) cAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTCGGTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGGAACGTGCGCcaaatc > 1:6228864/1‑147 (MQ=255) aGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTGGTTCTCGTAAAATTACACCCTGGCCGTGTCCGTACTTAACCCAGGAACGTGCGCAAATgcg > 1:764526/1‑150 (MQ=255) gTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATgcgc < 1:2303348/150‑1 (MQ=255) cgcCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTGGTTCTCGTAAATTTACACGCGGTACTTGACCATACTTAAACCAGTAAAGTGCGCAAATGCGCGGc > 2:2315108/1‑150 (MQ=255) cAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTAc < 2:453345/150‑1 (MQ=255) aaCGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTGGGTGGCGTAAATTTGCACCCGGTCCATCTCCATCCGTAAACCAGGAACGTGCGCAAAATCGCCGCTaac > 2:5390056/1‑148 (MQ=255) cGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCt < 1:7743178/150‑1 (MQ=255) gCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTa < 2:6333892/150‑1 (MQ=255) ccAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTAGTTGTAGTAAAATTACACCCTGTCCATCAACATCATTAAACCCCTAAAGAGGGCAAAAGCGCGGCTACGCTATc > 1:6754651/1‑150 (MQ=255) cAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATcc < 1:9120534/150‑1 (MQ=255) cAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCGGTCCGTCTCCGTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCGACGCTATcc > 2:1699434/1‑150 (MQ=255) aaaaTCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCt < 1:10959573/150‑1 (MQ=255) aaTCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTgc < 1:693802/150‑1 (MQ=255) aaTCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTgc < 1:10682395/150‑1 (MQ=255) aaTCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCCATCCTgc < 1:5625533/150‑1 (MQ=255) aTCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTgcg < 1:2706732/150‑1 (MQ=255) ccccAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAAc < 2:6601862/150‑1 (MQ=255) cccAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTGGGTCGAGTAAAATTCAACCCAGTACATCTCCATACTTAAACCAGGAAAATGCGCAAAATGGCCGCGACGCGATACTGCGCAAca > 1:1552725/1‑149 (MQ=255) cccAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACt < 1:3455294/150‑1 (MQ=255) cccAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTAGGTCTCGTAAATTTACACCCAGTCCGTCTACATCCATAACCCAGTAAACTGCGCAAATGCGCGGCGACGCTCTCCAGCGCCAca > 2:2516960/1‑149 (MQ=255) ccAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTAGTTGTCGTAAATTTACACGCTGTCCTTCTACTTGCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCGATCCAGCGCAACTg > 2:6859630/1‑150 (MQ=255) ccAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTGGTTCTCGTAAATTTCCACGCGGTCCTTCTCCGTCCGTAACCCACTAACCTGCGCAAATGCGCGGCTACGCGATCCAGCGCAAcag > 2:3385604/1‑148 (MQ=255) cAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGc < 2:2751514/150‑1 (MQ=255) cAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGc < 2:8397796/150‑1 (MQ=255) cAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTATCCGTGCTTAAACCAGTAACGTTCGCAAAAGCGCGGCTAAGCAATACTGCGCAACAGc > 2:9123652/1‑150 (MQ=255) cAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGt < 1:5290055/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGttt < 2:616532/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGttt < 1:328081/150‑1 (MQ=255) gCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTGGTTCTCGTAAATTTACACCCGGTCCGGCTCCATCCATAAACCACGAAACTGCGCCAAATCGCGGCGACGCGATCCAGCGCCACAGCCCttt > 2:1164956/1‑150 (MQ=255) ccAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTCGTTCTCGGAAATTTGAACCCGGTCCATATCCGTACATAAACCACTAACCTTCGCAAAAGCCCGGCGACGCTATCCAGCGCAACAGCCGTTTg > 2:1046847/1‑150 (MQ=255) tGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCa < 1:5001113/150‑1 (MQ=255) gCTGTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCAc < 1:10417244/150‑1 (MQ=255) tttGCCATTATCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCa < 1:6590265/150‑1 (MQ=255) gCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCagag < 2:5210674/150‑1 (MQ=255) cATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAgcg < 1:5153371/150‑1 (MQ=255) ttttCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCa < 1:12706/150‑1 (MQ=255) ttCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCaaa < 1:5394805/150‑1 (MQ=255) tCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTAGTAAATTTCCACCCTGTCCTTCTCCGTCCTTAAAACAGTAAACTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACAGCCGTTTGCTCACCACAGCGCaaaa > 2:8022861/1‑149 (MQ=255) aGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTACACGCTGTCCTTCTCCTTCCATAAACCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTAAACTGCGCAACATCCGTTTTCTCACCAGAGCGCaaaaac > 2:3594506/1‑147 (MQ=255) gCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCt < 2:6747850/150‑1 (MQ=255) cAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCtt < 2:970534/150‑1 (MQ=255) aaaaaaGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTc < 1:8355074/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCa < 2:9384911/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCa < 2:1489103/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCa < 2:5029905/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTCGTTGTGGTAAATTTACAAGCAGTCCTTGTCCTTACATAAACCAGAAAAGTTCGCAAAAGCGCGGCTACGCAATCCTGCGCAACAGCCGTTTGATCAACCCAGCCCAAAACCCTCa > 2:7541135/1‑150 (MQ=255) gTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTGGTTTTCGTAAATTTCCACGCTTTACTTATCCTTACTTAACCCAGTAACGTTGGCAAATTCGCGGCTAAGCTATACTGCGCAACTGGCGTTTTCTAACCAGTGCGCAAATCCTTAACAActgc > 2:698996/1‑150 (MQ=255) tttAACCGCTTCTACCTGGTCGTGTTAGTTCTCGTAAATTTACACGCTGTCCGTCTACATCCATAACCCAGTAAAGTGCGCAAAATCGCGGCTACCCAATACTGCGCAAAAGCCGTTTTCTCACCAGAGCGCAAATCCTTAACAAatgct > 2:9002645/1‑150 (MQ=255) tAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCtgt < 1:4749911/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCtgtg < 1:8017183/150‑1 (MQ=255) aaCCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCtgtg < 1:9729976/150‑1 (MQ=255) gCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGt < 2:5752782/150‑1 (MQ=255) ttCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTa < 2:5938153/150‑1 (MQ=255) cttccTGGTCGTTTTCGTTCTCGTATATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGc < 1:10019908/147‑1 (MQ=255) cTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGc < 1:3686924/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCAc < 2:8210025/150‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCAc < 2:3746071/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACCCTATCCAGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACt > 2:7317939/1‑150 (MQ=255) tGGTCGTTTTCGTTATCGTAAATTTACAACCTGTCCTTCTCCTTCCATAACCCACTAACGTGCGCAAAAGCGCGGCTACGCTATACAGCGCAACATCCCTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTAAACAAAAGCTGTTCCGTTAGCCAcat > 2:6017371/1‑148 (MQ=255) ggTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTc < 1:1413653/150‑1 (MQ=255) ggTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTc > 2:9271233/1‑150 (MQ=255) gTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCa < 1:2441064/150‑1 (MQ=255) gTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTACACGCTGTACTTCTACTTACTTAACCCAGTAACGTGCCCAAAATCGCCGCTACGCTATCCATCGCAACAGCCCTTTGATCACCAGATCGCAAATCCATCACTAATGCTGTTCCGTTAGCCACTACa > 2:4338211/1‑150 (MQ=255) cGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGa > 2:9172630/1‑150 (MQ=255) cGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGa < 2:10106904/150‑1 (MQ=255) ttttCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACt > 1:7120284/1‑150 (MQ=255) tttCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTc < 1:4175827/150‑1 (MQ=255) ttCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCa < 2:8589382/150‑1 (MQ=255) ttCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCa < 1:6031459/150‑1 (MQ=255) ttCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCa > 1:7340399/1‑150 (MQ=255) ctcGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGc > 2:4737967/1‑150 (MQ=255) gTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGcacc > 2:8830843/1‑150 (MQ=255) tAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGcacca > 1:9580114/1‑150 (MQ=255) tAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGcacca < 2:3097083/150‑1 (MQ=255) aaaTTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGtt < 2:3935925/82‑1 (MQ=255) ttCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGCACCACAGCa > 2:1067167/1‑150 (MQ=255) ccACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGCACCACAGCAAc < 1:1644829/150‑1 (MQ=255) | GCGTGCAGAATCAACCTGATGGCTGTTCCAGTAGCGCCAGCCAATCAGTGCGCCAACGCCCAAAATCACCCCAACAGCCAGTGCTTTGCCATTTTCAGCAAAAAAGCGTTTAACCGCTTCTACCTGGTCGTTTTCGTTCTCGTAAATTTCCACGCTGTCCTTCTCCTTCCTTAACCCAGTAACGTGCGCAAATGCGCGGCTACGCTATCCTGCGCAACTGCCGTTTGCTCACCAGAGCGCAAATCCTTCACTACTGCTGTGCCGTTAGCCACTTCAGACTCACCCAGCACCACAGCAAC > NC_000913/2639131‑2639429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |