| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 4,183,399 | Δ3 bp | 71.4% | coding (2155‑2157/4029 nt) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 4183402 = | 28 (0.310) | coding (2158/4029 nt) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit | |||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
GATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTG > NC_000913/4183264‑4183535 | gATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTCGGGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTGGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTcgggg > 2:1091111‑M1/1‑135 (MQ=255)gATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTcgtgg > 2:545172‑M1/1‑135 (MQ=255)gATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTAAGGAACGTGCTGATGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACg > 2:1604673/1‑140 (MQ=255) cGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTcgtggtggtg < 2:1177312‑M1/140‑11 (MQ=255) 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cTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTcgtggtggtgtcgttcagtacgtggatgcttcccgtatcgttatcaaagttaacgaagacgagatgtatccgggtgaagcaggtatcgacatctacaacctgaccaaatacacccgtt > 2:1011698‑M1/1‑22 (MQ=255) cTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTcgtggtggtgtcgttcagtacgtggatgcttcccgtatcgttatcaaagttaacgaagacgagatgtatccgggtgaagcaggtatcgacatctacaacctgaccaaatacacccgtt < 2:1050204‑M1/140‑119 (MQ=255) cTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTcgtggtggtgtcgttcagtacgtggatgcttcccgtatcgttatcaaagttaacgaagacgagatgtatccgggtgaagcaggtatcgacatctacaacctgaccaaatacacccgtt < 2:593895‑M1/140‑119 (MQ=255) tAACTGCGGTAGCTcgtggtggtgtcgttcagtacgtggatgcttcccgtatcgttatcaaagttaacgaagacgagatgtatacgggtgaagcaggtatcgacatctacaacctgaccaaatacacccgttctaaccag < 1:1084416‑M1/140‑127 (MQ=255) cTGCGGTAGCTcgtggtggtgtcgttcagtacgtggatgcttcccgtatcgttatcaaagttaacgaagacgagatgtatccgggtgaagcaggtatcgacatctacaacctgaccaaatacacccgttctaaccagaac < 1:327619‑M1/140‑130 (MQ=255) cTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAg 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gCGGTAGCTcgtggtggtgtcgttcagtacgtggatgcttcccgtatcgttatcaaagttaacgaagacgagatgtatccgggtgaagcaggtatcgacatctacaacctgaccaaatacacccgttctaaccagaacac < 1:508910‑M1/140‑132 (MQ=255) gCTcgtggtggtgtcgttcagtacgtggatgcttcccgtatcgttatcaaagttaacgaagacgagatgtatccgggtgaagcaggtatcgacatctacaacctgaccaaatacacccgttctaaccagaacacctgtat < 1:1386335‑M1/140‑138 (MQ=255) | GATGACGCCAACCGTGCATTGATGGGTGCGAACATGCAACGTCAGGCCGTTCCGACTCTGCGCGCTGATAAGCCGCTGGTTGGTACTGGTATGGAACGTGCTGTTGCCGTTGACTCCGGTGTAACTGCGGTAGCTAAACGTGGTGGTGTCGTTCAGTACGTGGATGCTTCCCGTATCGTTATCAAAGTTAACGAAGACGAGATGTATCCGGGTGAAGCAGGTATCGACATCTACAACCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTG > NC_000913/4183264‑4183535 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |