Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 4,640,551 | IS1 (–) +9 bp | 100% | intergenic (+9/‑383) | yjjY → / → yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 3583428 = | NA (NA) | 85 (0.950) | 37/256 | NT | 97.5% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 4640551 = | 2 (0.020) | intergenic (+9/‑391) | yjjY/yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase | |||||
* | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 83 (0.930) | 50/254 | NT | 97.5% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 4640559 | 2 (0.020) | intergenic (+17/‑383) | yjjY/yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase |
Only 100 of 200 total aligned reads displayed.
TGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACT > NC_000913/4640420‑4640697 | gcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacatgtgggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcctacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGa < 2:955847‑M2/11‑1 (MQ=255) ttCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggta > 2:1068522‑M2/1‑136 (MQ=255) ttCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggta < 1:1169384‑M2/140‑5 (MQ=255) ggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGaca < 1:1213482‑M2/13‑1 (MQ=255) ggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGaca < 1:424515‑M2/13‑1 (MQ=255) ggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGaca < 2:1480911‑M2/13‑1 (MQ=255) tgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACAcc < 2:737756‑M2/15‑1 (MQ=255) tgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATaa > 1:691592‑M2/120‑140 (MQ=255) gCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactcc > 1:229037‑M2/1‑128 (MQ=255) gCACTTACCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTACCTCAGGACCCGACAGGGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCTTTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactcc > 2:1003542‑M2/1‑128 (MQ=255) aCTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAATCGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaa > 2:1243981‑M2/1‑126 (MQ=255) aCTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaa > 2:1421931‑M2/1‑126 (MQ=255) tttCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaact < 1:1376846‑M2/140‑17 (MQ=255) ttCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaactt < 2:350007‑M2/140‑18 (MQ=255) ccATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttat > 1:37081‑M2/1‑121 (MQ=255) acgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggactgctgatagacacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACTCCCAATAAAACTACg < 1:59183‑M2/28‑1 (MQ=255) acgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACg > 1:314590‑M2/113‑140 (MQ=255) acgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACg < 1:651973‑M2/28‑1 (MQ=255) ccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaactcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAACCTACGCTTCg < 1:1347457‑M2/33‑1 (MQ=255) ccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTg > 2:1154377‑M2/105‑140 (MQ=255) aaccacAACCTTAGCTTGGTCGAGGGTCATTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttt > 2:1667985‑M2/1‑110 (MQ=255) aacaacATCATTAGCTTGGTCGTGGGAACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAAAAGCAACATAACAGGCTAAGAGGTGCCGggtaatgactccaacttagtgatagtgttt < 1:1314846‑M2/140‑31 (MQ=255) acaacaTCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtttt > 2:1372470‑M2/1‑109 (MQ=255) cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACatat > 1:1268849‑M2/99‑140 (MQ=255) cagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACagat > 1:1486587‑M2/99‑140 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACatatat > 2:1443678‑M2/97‑140 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACatatat > 2:277038‑M2/97‑140 (MQ=255) gtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACatatat > 1:519631‑M2/97‑140 (MQ=255) gtagctgaacacgagggacagctgatagaaacagaagccactcgagcaccacaaaaacaccaacaaacactaaatcagtaagttggcagcaacaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGATGACatatat > 2:1239398‑M2/97‑140 (MQ=255) tagctgaactggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATc < 1:928888‑M2/45‑1 (MQ=255) tagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATc < 1:406516‑M2/45‑1 (MQ=255) atcatTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAACACGGCTGTCATCCTAACCATTTTACCAGCAACATCACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgtt > 2:1065711‑M2/1‑104 (MQ=255) agctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCa > 2:453397‑M2/95‑140 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTc > 1:845484‑M2/90‑140 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTc > 1:97747‑M2/90‑140 (MQ=255) aacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTc > 1:194933‑M2/90‑140 (MQ=255) ttGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg < 2:1387085‑M2/140‑46 (MQ=255) ttGGTCGTGGGTACTGTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatg > 1:1116197‑M2/1‑95 (MQ=255) gTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 2:897025‑M2/140‑49 (MQ=255) gTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 2:1230495‑M2/140‑49 (MQ=255) gTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgccc < 1:1666571‑M2/140‑49 (MQ=255) ggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAg < 1:1085171‑M2/59‑1 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCa > 2:886568‑M2/80‑140 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCa > 1:875435‑M2/80‑140 (MQ=255) gggTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTATAACAGCAACATAACAGGCTAACAGGGGCCGggtaatgacaacaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga > 1:24254‑M2/1‑87 (MQ=255) tgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTa < 2:1411047‑M2/66‑1 (MQ=255) tCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 1:791586‑M2/1‑79 (MQ=255) tCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca < 1:955847‑M2/140‑62 (MQ=255) tCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtca > 1:552298‑M2/1‑79 (MQ=255) tCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgca < 2:539336‑M2/140‑66 (MQ=255) tCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCAGTTTAACAGCAACATAACAGGCTACGAGGGGCCGggtactgactccaacgtattgatagtgtgtgatgtgcagatcatgcccgatgacttggtcatgcc < 2:1238700‑M2/140‑66 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaatcaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTtga > 1:75961‑M2/66‑140 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTaa > 2:865133‑M2/66‑132 (MQ=255) aGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGTGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgatt > 2:236374‑M2/1‑63 (MQ=255) tCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgagtttga < 2:1623856‑M2/140‑82 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATc > 1:1533633‑M2/51‑140 (MQ=255) cacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATc > 1:193719‑M2/51‑140 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTa > 2:14251‑M2/49‑140 (MQ=255) cctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTa > 1:894432‑M2/49‑140 (MQ=255) aaaaCGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa > 1:895612‑M2/1‑56 (MQ=255) aaaaCGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa < 1:644939‑M2/140‑85 (MQ=255) aaaaCGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacgtattgaaagtgttgtatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaa < 1:781265‑M2/140‑85 (MQ=255) caaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGCGGGGCCGGACACCCAATAAAACTCCGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAAt > 2:300221‑M2/46‑140 (MQ=255) ggCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgaca < 2:1151620‑M2/140‑90 (MQ=255) acactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTcac < 2:1651578‑M2/110‑1 (MQ=255) cactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTcaca < 1:116022‑M2/111‑1 (MQ=255) cATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtccca > 2:1049592‑M2/1‑36 (MQ=255) aTTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccatcttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccag > 2:1570357‑M2/1‑35 (MQ=255) ttttAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactcccacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagc < 2:931713‑M2/140‑107 (MQ=255) tttAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagcc < 2:480798‑M2/140‑108 (MQ=255) aatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACattatt > 1:431693‑M2/25‑140 (MQ=255) ttAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccg < 2:1174575‑M2/140‑109 (MQ=255) agtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTtaa > 2:1343113‑M2/21‑140 (MQ=255) taagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTtaata > 1:1592776‑M2/19‑140 (MQ=255) taagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTtaata > 2:349909‑M2/19‑140 (MQ=255) taagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTAGTTtaata > 2:555071‑M2/19‑140 (MQ=255) aaCATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggt < 2:181853‑M2/140‑117 (MQ=255) aCATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg < 1:882748‑M2/140‑118 (MQ=255) aCATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgtgttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtg < 1:1659187‑M2/140‑118 (MQ=255) ggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACTCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCaa < 1:749382‑M2/128‑1 (MQ=255) aTAACAGGCTAAGAGGGGCCTggtaatgactccatctttttgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttagtcatgcagctccacagattttgataacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgct > 2:1491666‑M2/1‑21 (MQ=255) gcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAg < 2:375864‑M2/132‑1 (MQ=255) gcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAg < 1:968314‑M2/132‑1 (MQ=255) cAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcct > 2:361127‑M2/1‑17 (MQ=255) ggCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca < 2:835049‑M2/140‑126 (MQ=255) ggCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGtt > 1:1038332/1‑140 (MQ=255) gCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcag < 2:748110‑M2/140‑127 (MQ=255) tAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat > 2:116494‑M2/1‑12 (MQ=255) tAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat > 1:1477375‑M2/1‑12 (MQ=255) tAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat > 1:1256403‑M2/1‑12 (MQ=255) gggCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATAATAc < 1:1563921/140‑1 (MQ=255) ggCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtt < 1:1335010‑M2/140‑136 (MQ=255) ggCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACa > 2:291970/1‑140 (MQ=255) ggCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGGTGCATCATACa < 2:617122/140‑1 (MQ=255) gCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtta < 1:817673‑M2/140‑137 (MQ=255) gCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtta < 2:1242443‑M2/140‑137 (MQ=255) gCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggtta < 1:581505‑M2/140‑137 (MQ=255) gCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATAc < 1:1435184/138‑1 (MQ=255) ccGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAAc > 2:941550/1‑140 (MQ=255) cGggtaatgactcccacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatg > 1:1368015‑M2/1‑2 (MQ=255) | TGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACT > NC_000913/4640420‑4640697 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |