Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,777,769 | G→T | 6.0% | G192C (GGC→TGC) | ydiO → | putative acyl‑CoA dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,777,769 | 0 | G | T | 6.0% | 227.1 / 2.1 | 66 | G192C (GGC→TGC) | ydiO | putative acyl‑CoA dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/23); new base T (2/2); total (41/25) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.09e-01 |
CAAGGTCTACATCAACGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACAACTT > NC_000913/1777630‑1777908 | cAAGGTCTACATCAACGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCATGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCg > 2:345862/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 1:1410201/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 2:70020/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 1:1409975/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 2:70003/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 2:69843/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 2:1366696/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 2:497537/1‑140 (MQ=255) aCGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAc > 2:288046/1‑140 (MQ=255) ctgACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCAGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACACTGTGGTGGGTCGAATCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAcc > 2:1157267/3‑140 (MQ=255) cGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAcc > 1:1034687/1‑140 (MQ=255) cGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAAcc > 1:1219313/1‑140 (MQ=255) gACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCg > 2:1090234/1‑140 (MQ=255) gACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCg < 1:734768/140‑1 (MQ=255) gACAAAAAACCTTCATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCg < 1:349527/140‑1 (MQ=255) tttATTACCGGTGCGACAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAAt < 1:193601/140‑1 (MQ=255) tttATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAAt < 1:813669/140‑1 (MQ=255) attaCCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCgg < 1:942300/140‑1 (MQ=255) taCCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCt < 1:1090234/140‑1 (MQ=255) gTGCGAATGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGTTCCGCAACCGAAAGATGCCTCACAAGGCGTCACCCTGTGGTGGGTCGACGCCAGTATGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAACTCGGCTGGctt < 1:644850/140‑3 (MQ=255) gTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCa < 2:693548/140‑1 (MQ=255) tACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCAc > 1:189720/1‑140 (MQ=255) tACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCAc > 1:190131/1‑140 (MQ=255) tACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCAc > 1:67087/1‑140 (MQ=255) gTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCg > 2:1417549/1‑140 (MQ=255) tatGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCAGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAg < 2:760603/140‑1 (MQ=255) tgctggtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTc > 1:751396/1‑140 (MQ=255) tggtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAt > 2:1143682/1‑140 (MQ=255) ggtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtc > 1:1070059/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCTGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 2:1607377/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCTGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 2:1607097/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 2:1351857/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 2:1243111/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 2:151566/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 2:608394/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 2:608534/1‑140 (MQ=255) gtgctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTAtct > 1:728087/1‑140 (MQ=255) ctggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTACCCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGa < 1:1325730/140‑1 (MQ=255) tggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGAc < 2:288494/140‑1 (MQ=255) tggCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGAc < 2:289261/140‑1 (MQ=255) cgATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCTGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTgg < 1:719158/140‑1 (MQ=255) cgATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCTGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTgg < 1:718899/140‑1 (MQ=255) cGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGtt > 2:1532797/1‑140 (MQ=255) ccGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGAATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAaga < 2:243757/140‑1 (MQ=255) aaaGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAagagag > 2:587089/1‑140 (MQ=255) aaaGCCTTCACCCTGTGGTTGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTggg < 1:298905/140‑1 (MQ=255) aGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCg > 1:1348299/1‑140 (MQ=255) ccatCACCCGGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCgaa < 1:1209928/137‑1 (MQ=255) tCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCgaagaa > 2:377986/1‑140 (MQ=255) cACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGaagaag > 1:12612/1‑140 (MQ=255) aCCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTATGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAgg < 2:1652999/140‑1 (MQ=255) ggtggGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGt < 1:457248/140‑1 (MQ=255) ggTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTcc > 1:601283/1‑140 (MQ=255) ggTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTcc > 1:423391/1‑140 (MQ=255) ggTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTcc > 1:423476/1‑140 (MQ=255) gtagACTCCAGTAAGGCCGGTATTAAGTTTTACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGATCAGCACCTGCGAATTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGATGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGTATGGGTTTCCt < 1:85114/137‑1 (MQ=255) gTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCt < 1:228994/140‑1 (MQ=255) gTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCt < 1:85231/140‑1 (MQ=255) aCTCCAGTAAGCCCGGCTTTAAGATTATCCCGCTGCTTAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGTTTGTAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAAt < 1:133828/140‑1 (MQ=255) aCTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAAt < 1:1295836/140‑1 (MQ=255) aCTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAAt > 1:1025536/1‑140 (MQ=255) tAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGt > 2:1597222/1‑140 (MQ=255) tAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGt > 1:1603129/1‑140 (MQ=255) cccGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACaa > 1:1399879/1‑140 (MQ=255) cccGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACaa > 2:370899/1‑140 (MQ=255) cccGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACaa > 2:627627/1‑140 (MQ=255) cccGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACaa < 1:1243111/140‑1 (MQ=255) ggCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACAACtt > 1:1104/1‑140 (MQ=255) ggCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACAACtt > 1:527296/1‑140 (MQ=255) | CAAGGTCTACATCAACGGACAAAAAACCTTTATTACCGGTGCGAAAGAGTACCCGTATATGCTGGTGCTGGCGCGCGATCCGCAACCGAAAGATCCCAAAAAAGCCTTCACCCTGTGGTGGGTCGACTCCAGTAAGCCCGGCATTAAGATTAACCCGCTGCATAAAATCGGCTGGCATATGCTCAGCACCTGCGAAGTCTATCTCGACAACGTGGAGGTTGAAGAGAGCGACATGGTGGGCGAAGAAGGAATGGGTTTCCTCAATGTGATGTACAACTT > NC_000913/1777630‑1777908 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |