| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 224,768 | C→G | 5.3% | noncoding (998/1542 nt) | rrsH → | 16S ribosomal RNA of rrnH operon |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 224,768 | 0 | C | G | 5.3% | 839.2 / 31.3 | 241 | noncoding (998/1542 nt) | rrsH | 16S ribosomal RNA of rrnH operon |
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Only 100 of 242 total aligned reads displayed.
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1:347086/140‑1 (MQ=255) aagaaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAcc < 1:891133/140‑1 (MQ=255) aagaaCCTTACCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAAcc < 1:1273416/140‑1 (MQ=255) tACCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATTGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCtt > 1:1526601/1‑140 (MQ=255) aCCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCttt > 2:95288/1‑140 (MQ=255) ggTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAgg < 2:620903/62‑1 (MQ=255) ggTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAgg > 1:620903/1‑62 (MQ=255) tCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGc > 1:1417648/1‑140 (MQ=255) tCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGGTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGc > 1:1688684/1‑140 (MQ=255) | TAACGCGTTAAGTCGACCGCCTGGGGAGTACGGCCGCAAGGTTAAAACTCAAATGAATTGACGGGGGCCCGCACAAGCGGTGGAGCATGTGGTTTAATTCGATGCAACGCGAAGAACCTTACCTGGTCTTGACATCCACAGAACTTTCCAGAGATGGATTGGTGCCTTCGGGAACTGTGAGACAGGTGCTGCATGGCTGTCGTCAGCTCGTGTTGTGAAATGTTGGGTTAAGTCCCGCAACGAGCGCAACCCTTATCTTTTGTTGCCAGCGGTCC > NC_000913/224633‑224907 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |