| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,181,279 | G→T | 8.2% | R12L (CGT→CTT) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,181,279 | 0 | G | T | 8.2% | 301.4 / 7.3 | 92 | R12L (CGT→CTT) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (60/24); new base T (4/4); total (64/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGCGGAAAGTGTTCCATTTTCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGT > NC_000913/4181146‑4181411 | tGCGGAAAGTGTTCCATTTTCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGa > 2:66588/1‑140 (MQ=255) ttCCATTTTCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAAc > 1:679539/1‑140 (MQ=255) tCCATTTTCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCCGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAAct > 2:1275549/1‑139 (MQ=255) tttCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGCTGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCcac < 2:1023747/140‑1 (MQ=255) tttCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCcac < 2:1023831/140‑1 (MQ=255) tttCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCcac < 1:1242392/140‑1 (MQ=255) ttCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGACCCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCcaca > 2:1078321/1‑140 (MQ=255) ttCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCcaca > 2:1078357/1‑140 (MQ=255) tCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACaa > 1:660626/1‑140 (MQ=255) tCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACaa > 1:634890/1‑140 (MQ=255) tCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACaa > 2:522880/1‑140 (MQ=255) tCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACCTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACaa > 1:1150012/1‑140 (MQ=255) tCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAAAGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGGGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTTCTCCTATACCGAGAAAAAACTTATACGTAAGGATTTTGGTAAACGTCGACAAGATCt > 2:820544/1‑140 (MQ=255) aaaaTAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTTGATg < 1:1436903/140‑1 (MQ=255) aaaTAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGt < 2:205192/140‑1 (MQ=255) aaaTAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGt < 2:552393/140‑1 (MQ=255) aaaTAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGt < 2:552331/140‑1 (MQ=255) tgtTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCTTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTa < 2:1097565/140‑1 (MQ=255) tgtTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTa > 2:1048429/1‑140 (MQ=255) tgtTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTa > 2:1048392/1‑140 (MQ=255) tgtTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTa > 2:534105/1‑140 (MQ=255) tgtTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTa > 2:534195/1‑140 (MQ=255) tgtTGCACAAACTGTACGCTAAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTa > 1:1489576/1‑140 (MQ=255) tgtTGCACAAACAGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGATGAACCCTAAGGTTTACTCCTAAACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGTTAAACGTCCACAAGTTCAGGATTTAACTTa > 2:1481764/1‑140 (MQ=255) tGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCTTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTAtct < 1:727413/140‑1 (MQ=255) tGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTAtct < 1:1111090/140‑1 (MQ=255) tGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGATGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTAtct < 1:936937/140‑1 (MQ=255) aCTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGTAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCt > 1:1178697/1‑140 (MQ=255) cTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTa < 2:825134/140‑1 (MQ=255) tGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTAt < 2:526261/140‑1 (MQ=255) tCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGGGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCTTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATcc > 1:202790/1‑140 (MQ=255) tCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCTTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATcc > 1:201034/1‑140 (MQ=255) tCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACAGTATCTCCTATCTATcc > 1:1685963/1‑140 (MQ=255) ccGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCa > 2:596553/1‑140 (MQ=255) gCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACACGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGc > 1:1679724/1‑140 (MQ=255) gCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGc > 1:290112/1‑140 (MQ=255) aTGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGAc > 1:1041944/1‑140 (MQ=255) ggACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTGCCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTc > 2:210105/1‑140 (MQ=255) ggACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTc > 2:1560934/1‑140 (MQ=255) ggACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTc > 2:1560985/1‑140 (MQ=255) gATGGGTCGACTTGACAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGATTACTCCTAAAACGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTATGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTAATCTCCTTTCTATCCAGCATGACTCTTTTc > 2:538648/1‑140 (MQ=255) aCTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCTTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTa < 1:1474722/140‑1 (MQ=255) aCTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTa < 2:1041944/140‑1 (MQ=255) ttGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCTTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATc > 2:1523059/1‑140 (MQ=255) ttGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATc > 1:725339/1‑140 (MQ=255) ttGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATc > 1:174249/1‑140 (MQ=255) ttGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATc > 1:724888/1‑140 (MQ=255) ttGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATc > 1:1013791/1‑140 (MQ=255) aGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCa < 1:617390/140‑1 (MQ=255) aGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCa > 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tGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTCATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTAt > 1:609456/1‑140 (MQ=255) tGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGAGTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTAt > 1:609415/1‑140 (MQ=255) tACTCCTATACCGAGAAAATACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACGTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGTCTCGTTTCTGTAATTTATAGAGCTAGATCCTGTAGGGCAGTATGGTCt > 1:925334/1‑140 (MQ=255) tACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCt > 1:76930/1‑140 (MQ=255) tACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCt > 1:1077116/1‑140 (MQ=255) tACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCt > 1:89779/1‑140 (MQ=255) tACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCt < 2:1017439/140‑1 (MQ=255) tACTCCTATACCGAGAAAAAACGTAGTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCt < 2:1017433/140‑1 (MQ=255) aCTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTa > 1:1154857/1‑133 (MQ=255) aCTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTa < 2:1154857/133‑1 (MQ=255) aCTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTg > 2:749001/1‑140 (MQ=255) aCTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTg > 2:18781/1‑140 (MQ=255) aCTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTg > 1:1576965/1‑140 (MQ=255) aCTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTGTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTg > 1:40120/1‑140 (MQ=255) ataCCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTGTCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAgct > 1:173905/1‑140 (MQ=255) ataCCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAgct < 1:430186/140‑1 (MQ=255) ataCCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAgct < 1:430185/140‑1 (MQ=255) ataCCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAgct < 1:430213/140‑1 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> 1:449479/1‑140 (MQ=255) agaAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTttc > 1:33083/1‑140 (MQ=255) agaAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTttc > 1:33020/1‑140 (MQ=255) agaAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTttc > 1:1298343/1‑140 (MQ=255) agaAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTttc > 1:1282556/1‑140 (MQ=255) agaAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTttc > 1:1215627/1‑140 (MQ=255) aaaaaaCGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTttccg < 1:565487/140‑1 (MQ=255) cGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTtccgttccgt < 2:1432778/140‑1 (MQ=255) | TGCGGAAAGTGTTCCATTTTCCGGTCAACAAAATAGTGTTGCACAAACTGTCCGCTCAATGGACAGATGGGTCGACTTGTCAGCGAGCTGAGGAACCCTATGGTTTACTCCTATACCGAGAAAAAACGTATTCGTAAGGATTTTGGTAAACGTCCACAAGTTCTGGATGTACCTTATCTCCTTTCTATCCAGCTTGACTCGTTTCAGAAATTTATCGAGCAAGATCCTGAAGGGCAGTATGGTCTGGAAGCTGCTTTCCGTTCCGT > NC_000913/4181146‑4181411 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |