| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,258,317 | G→T | 9.2% | V192V (GTG→GTT) | dinF → | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,258,317 | 0 | G | T | 9.2% | 205.5 / 7.2 | 65 | V192V (GTG→GTT) | dinF | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/30); new base T (3/3); total (32/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
TCTTGAAATCCGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGC > NC_000913/4258188‑4258455 | tCTTGAAATCCGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTct < 2:1085869/140‑1 (MQ=255)tCTTGAAATCAGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTct < 2:1085866/140‑1 (MQ=255) cTTGAAATCCGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTctg < 2:1027039/140‑1 (MQ=255) cTTGAAATCCGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTctg < 2:1026969/140‑1 (MQ=255) tGAAATCCGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTctggc < 2:307321/140‑1 (MQ=255) tGAAATCCGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTctggc < 2:307774/140‑1 (MQ=255) ccGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGa < 2:52027/140‑1 (MQ=255) cTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTGTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATgg > 2:1237560/1‑140 (MQ=255) cTGGTTAAGCGCACCGGAGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATgg > 1:339098/1‑140 (MQ=255) ggTTAAGCGCCCCGGCGTCGCTGGCGAAGCAGGTATTACTCGGGTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATgggg < 2:1483845/140‑1 (MQ=255) ggTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCCATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGGTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCGGGTGATgggg < 2:1070869/140‑1 (MQ=255) ggTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATgggg < 2:878768/140‑1 (MQ=255) ggTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATgggg < 1:145195/140‑1 (MQ=255) ttAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCt < 2:704830/140‑1 (MQ=255) aCCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGa < 1:901615/140‑1 (MQ=255) aCCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGa < 1:901250/140‑1 (MQ=255) aCCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGa > 1:474003/1‑140 (MQ=255) ccGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGaa > 2:456265/1‑140 (MQ=255) ccGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGaa > 1:931102/1‑140 (MQ=255) ccGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGaa > 2:247672/1‑140 (MQ=255) ccGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACAGTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGaa > 2:1148604/1‑140 (MQ=255) cGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAAc > 2:1591990/1‑140 (MQ=255) cGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAAc > 1:1473543/1‑140 (MQ=255) tCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCa < 1:1608041/140‑1 (MQ=255) ggCGCATCTTGAAGTCCTCCGTTGTCTACTCCGCGTGCACTATGCCCGTGCGCCAGTAATGTCGGCAGTGGGCGGCAAGATCCACCACAGTGAGCTGGATGTCTGTCTGGTGATGGGTCTGCATGTGCACGTGCATggct < 2:496054/140‑2 (MQ=255) ggCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGggcg < 2:42429/140‑1 (MQ=255) cGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTa < 1:543669/140‑1 (MQ=255) cGGTTGGCTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTa < 1:1081624/140‑1 (MQ=255) gttggttACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTAtt > 2:129087/1‑140 (MQ=255) gttggttACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTAtt > 1:230317/1‑140 (MQ=255) aCTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAat > 1:284230/1‑140 (MQ=255) aCTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAat > 1:284212/1‑140 (MQ=255) cTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAata < 2:1201901/140‑1 (MQ=255) ggCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGc > 2:540114/1‑140 (MQ=255) cGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCac > 2:11007/1‑139 (MQ=255) cGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCaa > 2:10929/1‑140 (MQ=255) cGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTGAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATCTGAACGTGCTGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATTTGCaa > 2:132681/1‑140 (MQ=255) gTGCAATATGCCCGTTCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCa > 1:27430/1‑89 (MQ=255) gTGCAATATGCCCGTTCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCa < 2:27430/89‑1 (MQ=255) tGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACgg < 2:144685/120‑1 (MQ=255) tGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACgg > 1:144685/1‑120 (MQ=255) tGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCACCa > 1:1034060/1‑140 (MQ=255) gCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGAt > 1:1088073/1‑140 (MQ=255) cGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTgg < 1:315200/140‑1 (MQ=255) cGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTgg < 1:481729/140‑1 (MQ=255) cGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTgg < 1:481844/140‑1 (MQ=255) cGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTgg < 1:1311391/140‑1 (MQ=255) cGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTgg < 1:59530/140‑1 (MQ=255) cGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGACGTCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTgg < 1:313529/140‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTTCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATTAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAata < 1:1610020/120‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTTCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATTAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAata < 1:1610106/120‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTTCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATTAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAata > 2:610572/1‑120 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTTCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATTAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAata > 2:1610020/1‑120 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTTCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATTAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAata > 2:1610106/1‑120 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTTCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATTAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAata < 1:610572/120‑1 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTc > 2:1417477/1‑140 (MQ=255) tGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTc > 1:352612/1‑140 (MQ=255) 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(MQ=255) gTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCt > 2:1032129/1‑140 (MQ=255) tCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTAcgc < 2:1291905/140‑1 (MQ=255) tgtgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCg > 1:34109/1‑140 (MQ=255) tgtgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCg > 1:348426/1‑140 (MQ=255) tgtgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCg > 1:1520851/1‑140 (MQ=255) tgtgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCGAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCg > 1:1126341/1‑140 (MQ=255) tgtgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGGCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATATCCg > 1:192102/1‑140 (MQ=255) gtgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCgg > 1:1001307/1‑140 (MQ=255) tgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGc > 2:842722/1‑140 (MQ=255) tgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGc > 2:915588/1‑140 (MQ=255) tgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGc > 1:1640099/1‑140 (MQ=255) tgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGc > 1:1640297/1‑140 (MQ=255) tgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGc > 2:1653629/1‑140 (MQ=255) tgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGc > 1:195734/1‑140 (MQ=255) tgCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGc > 1:847617/1‑140 (MQ=255) | TCTTGAAATCCGCTGGTTAAGCGCACCGGCGTCGCTGGCGAATCTGGTATTACTCGGTTGGTTACTCGGCGTGCAATATGCCCGTGCGCCAGTAATTTTGTTAGTGGTCGGCAATATCCTCAACATTGTGCTGGATGTCTGGCTGGTGATGGGGCTGCATATGAACGTGCAGGGCGCGGCGCTGGCGACGGTTATTGCGGAATATGCAACATTGCTGATTGGTCTGCTAATGGTGCGTAAAATCCTCAAACTACGCGGAATTTCCGGC > NC_000913/4258188‑4258455 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |