| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC JC | NC_000913 | 4,640,551 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (+9/‑383) | yjjY → / → yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 85 (0.930) | 49/274 | 0.1 | 94.1% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4640559 | 5 (0.060) | intergenic (+17/‑383) | yjjY/yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase | |||||
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TGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACT > NC_000913/4640420‑4640697 | tGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCg > 1:624422/1‑140 (MQ=255) cGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGa > 2:110249/1‑140 (MQ=255) cggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGAGGGGCCGGac > 2:752187‑M2/129‑140 (MQ=255) ttCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGggta > 2:801102‑M2/1‑136 (MQ=255) 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2:1481387‑M2/59‑1 (MQ=255) ggcagcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAg > 1:1481387‑M2/13‑71 (MQ=255) gcatcaccGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAg < 2:911080‑M2/132‑1 (MQ=255) cAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattga < 1:32087‑M2/39‑23 (MQ=255) cAGGCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattga > 2:32120‑M2/1‑17 (MQ=255) ggCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagctacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca < 1:1354602‑M2/140‑126 (MQ=255) ggCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagctacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca < 1:1064069‑M2/140‑126 (MQ=255) ggCTAAGAGGGGCCGggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctca < 1:1007784‑M2/140‑126 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |