Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 222,958 | Δ1 bp | 100% | coding (126/576 nt) | gmhB → | D,D‑heptose 1,7‑bisphosphate phosphatase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 222,958 | 0 | A | . | 100.0% | 436.1 / NA | 88 | coding (126/576 nt) | gmhB | D,D‑heptose 1,7‑bisphosphate phosphatase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base . (46/42); total (46/42) | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
CTTATTAAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATCTA > NC_000913/222812‑223101 | cTTATTAAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaa > 1:1087270/1‑150 (MQ=255) cTTATTAAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaa > 2:206634/1‑150 (MQ=255) ttattaAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaa < 1:839058/150‑1 (MQ=255) ttattaAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaa < 2:285988/150‑1 (MQ=255) ttattaAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaa < 1:1720959/150‑1 (MQ=255) ttaAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaat > 1:62944/1‑149 (MQ=255) ttaAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaat > 1:831745/1‑149 (MQ=255) taAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaatg > 2:512743/1‑148 (MQ=255) taAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTaaaaaaatg > 2:1718161/1‑148 (MQ=255) gAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCt > 1:219380/1‑150 (MQ=255) aGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCtt > 2:679405/1‑150 (MQ=255) aGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCtt < 1:1688939/150‑1 (MQ=255) cTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTg > 2:789549/1‑150 (MQ=255) cTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTg > 2:789470/1‑150 (MQ=255) taAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTgcgc > 1:575961/1‑150 (MQ=255) taAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTgcgc < 2:1561489/150‑1 (MQ=255) taAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTgcgc < 2:629716/150‑1 (MQ=255) taAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTgcgc < 2:1561481/150‑1 (MQ=255) aaaaGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCt > 1:425850/1‑150 (MQ=255) aaaGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtg > 2:339305/1‑150 (MQ=255) aaGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCTCGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑TAAAAAATGGGCTTTGCGCtgg < 2:1305143/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtggtg < 1:994023/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtggtg < 1:994007/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtggtg < 1:994002/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtggtg < 1:748395/150‑1 (MQ=255) ggTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCtggtg < 1:32137/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgta < 1:318194/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgta < 1:747905/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgta < 1:480872/150‑1 (MQ=255) ggCGAAGAGCGTACCCGCAATGTTTCTGGCCCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTGATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgta < 1:507466/150‑1 (MQ=255) gCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgtag < 1:369243/150‑1 (MQ=255) cGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgtagt < 1:1717461/150‑1 (MQ=255) gAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGgtagta > 1:1026794/1‑150 (MQ=255) aaGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTaa > 1:1686143/1‑150 (MQ=255) aaGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTaa > 1:610560/1‑150 (MQ=255) gagCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTaacc > 1:138659/1‑150 (MQ=255) cGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTaaccaac < 1:957650/150‑1 (MQ=255) cGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTaaccaac < 1:594131/150‑1 (MQ=255) tACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAaccaacca > 2:328237/1‑150 (MQ=255) cccGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGt < 1:1032287/150‑1 (MQ=255) ccGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTc > 2:483467/1‑150 (MQ=255) ccGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTc > 2:483449/1‑150 (MQ=255) ccGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTc > 1:780694/1‑150 (MQ=255) cGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCt > 2:989981/1‑150 (MQ=255) gCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTg > 2:1355360/1‑150 (MQ=255) gCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTg < 1:485899/150‑1 (MQ=255) tttttCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCAt > 1:689081/1‑150 (MQ=255) tGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTcgc > 2:717799/1‑150 (MQ=255) tGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTcgc > 1:968333/1‑150 (MQ=255) tGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTcgc > 1:94645/1‑150 (MQ=255) cGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTa > 1:530929/1‑150 (MQ=255) gTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTaa > 2:523718/1‑150 (MQ=255) ggCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTa < 1:1254520/150‑1 (MQ=255) 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aaTTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGc < 1:1258800/150‑1 (MQ=255) tCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGAcca > 1:112559/1‑149 (MQ=255) tCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCg > 1:850263/1‑150 (MQ=255) cGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCga < 2:425850/150‑1 (MQ=255) cGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGAt < 2:1374232/150‑1 (MQ=255) aTTGACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATc > 2:340476/1‑150 (MQ=255) gACGCCATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTgg < 2:310563/150‑1 (MQ=255) ccATGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATgg < 2:1569265/150‑1 (MQ=255) aTGCGCGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTa < 2:219380/150‑1 (MQ=255) gcgcGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATc > 2:143587/1‑150 (MQ=255) gcgcGAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATc > 1:650151/1‑150 (MQ=255) gcgAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATCta > 1:1375428/1‑150 (MQ=255) gcgAGCT‑AAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATCta > 1:1375356/1‑150 (MQ=255) | CTTATTAAGGAGCTATAAAAGGTGGCGAAGAGCGTACCCGCAATTTTTCTTGACCGTGATGGCACCATTAATGTCGATCACGGCTATGTCCATGAGATCGACAACTTTGAATTTATCGACGGTGTTATTGACGCCATGCGCGAGCTAAAAAAAATGGGCTTTGCGCTGGTGGTAGTAACCAACCAGTCTGGCATTGCTCGCGGTAAATTTACCGAAGCACAGTTTGAAACGCTGACCGAGTGGATGGACTGGTCGCTGGCGGACCGAGATGTCGATCTGGATGGTATCTA > NC_000913/222812‑223101 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |