| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,096,379 | C→T | 5.5% | A187V (GCG→GTG) | yggT → | putative inner membrane protein; compensates for loss in K+ uptake |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,096,379 | 0 | C | T | 5.5% | 369.8 / 7.8 | 109 | A187V (GCG→GTG) | yggT | putative inner membrane protein; compensates for loss in K+ uptake |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/73); new base T (3/3); total (33/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.48e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
CTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACGGCCAGGCCAA > NC_000913/3096231‑3096525 | ctgcGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCg < 1:309241/150‑1 (MQ=255)ctgcGCCCGAGTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCg < 1:309278/150‑1 (MQ=255) tgcGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCACTGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCACTATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGt < 1:1586470/150‑1 (MQ=255) tgcGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCATAAGTATTACAGGCAACCGGAAACATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGt < 1:1422426/150‑1 (MQ=255) tgcGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGt < 2:503997/150‑1 (MQ=255) tgcGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGt > 1:735647/1‑150 (MQ=255) tgcGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAACATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGt < 1:1422478/150‑1 (MQ=255) cgcCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTGCAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTa < 2:172361/150‑1 (MQ=255) cccGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATg > 1:1455891/1‑150 (MQ=255) ccGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGa > 1:559706/1‑150 (MQ=255) gATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCACCCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAAt > 2:355968/1‑150 (MQ=255) gATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAAt > 2:1518196/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGc < 2:134925/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGc < 2:187194/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGc < 2:187164/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGc < 2:374525/150‑1 (MQ=255) cgccgcCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCg < 2:1424149/150‑1 (MQ=255) cgccgcCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCg < 2:1424164/150‑1 (MQ=255) cgccgcCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCg < 2:1424162/150‑1 (MQ=255) gccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAAc < 2:1116507/150‑1 (MQ=255) gccTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAAc < 2:1451345/150‑1 (MQ=255) cTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAg < 2:1111888/150‑1 (MQ=255) tgcgtccGGCTATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATACGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGt < 2:931575/145‑1 (MQ=255) tGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCTTCCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGt < 2:931549/150‑1 (MQ=255) tGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGTGTTATGAATGCCGTAACAGt > 1:64743/1‑150 (MQ=255) tGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGTGTTATGAATGCCGTAACAGt > 1:1267839/1‑150 (MQ=255) tGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGTGTTATGAATGCCGTAACAGt > 1:1267829/1‑150 (MQ=255) tACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTaa < 2:1294755/150‑1 (MQ=255) tACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTaa < 2:1294720/150‑1 (MQ=255) tACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTaa < 2:1294653/150‑1 (MQ=255) aCCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAat < 1:795529/150‑1 (MQ=255) ccGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAatg > 2:559470/1‑150 (MQ=255) ccGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAatg > 2:1338160/1‑150 (MQ=255) ccGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAatg > 1:577302/1‑150 (MQ=255) cAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAAtgatga < 2:1330240/150‑1 (MQ=255) ggtgggATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTc < 1:1680312/150‑1 (MQ=255) gtattgattTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTTTATTTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATTCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCTTAACATTTAATGATGACTGTCTgtt < 2:1007510/148‑3 (MQ=255) ttgattTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGtttt > 2:1055673/1‑150 (MQ=255) tgattTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTa < 1:273695/150‑1 (MQ=255) tttCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCTATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGTTGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACTGTCTGGTTTTACgg < 2:1095876/150‑1 (MQ=255) tttCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACgg < 2:782002/150‑1 (MQ=255) ttCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGc < 1:1585194/150‑1 (MQ=255) ccGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCtata > 2:1297485/1‑150 (MQ=255) ccGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCtata > 2:1297503/1‑150 (MQ=255) ccGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGAGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCtata > 2:213650/1‑150 (MQ=255) tgatCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCa < 2:629317/150‑1 (MQ=255) tgatCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCa < 2:300008/150‑1 (MQ=255) ccTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCg > 2:180893/1‑150 (MQ=255) tCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGaa > 1:20697/1‑150 (MQ=255) tCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGaa < 1:839391/150‑1 (MQ=255) ttCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAagc < 2:1178586/150‑1 (MQ=255) ctgctgctgTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAagcca < 2:1238797/150‑1 (MQ=255) ctgctgctgTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAagcca < 1:38512/150‑1 (MQ=255) ctgctgctgTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAagcca < 2:637136/150‑1 (MQ=255) ctgctgTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAagccagcc > 2:1343432/1‑150 (MQ=255) tgctgTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCg < 1:602260/150‑1 (MQ=255) tgctgTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCg < 2:627788/150‑1 (MQ=255) gctgTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGt < 2:1271066/150‑1 (MQ=255) tATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGAtt < 1:123442/150‑1 (MQ=255) tcaATATGGGTGACGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGt > 1:717876/1‑150 (MQ=255) tatGTGTGTCTAAGAAGTATTAAAGTCAACCTTAAATATTCTTCTTCAAGTTCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCTTAACATTTAATGATGAAGTTCTTGTTTTACGTATCTATATTCAGCCGAAAGCAATACGTGATTCTATTTTCgtt < 2:1010744/150‑3 (MQ=255) tatGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGt < 2:1490007/150‑1 (MQ=255) gggTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTa < 1:559470/150‑1 (MQ=255) gtgtCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACa > 2:1129662/1‑150 (MQ=255) tCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATgg < 1:303091/150‑1 (MQ=255) tCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATgg < 2:167720/150‑1 (MQ=255) gCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGcg > 2:310966/1‑150 (MQ=255) cAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGcga < 2:846127/150‑1 (MQ=255) aGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGcgac > 1:1034617/1‑150 (MQ=255) aGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGATGTGGATGACGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGcgac > 1:240923/1‑150 (MQ=255) tATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGt < 2:20697/150‑1 (MQ=255) tATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGAGTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGt > 2:1540815/1‑150 (MQ=255) ttACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTa > 1:205223/1‑150 (MQ=255) ttACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTa > 1:205211/1‑150 (MQ=255) aCAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTaaa < 2:375699/150‑1 (MQ=255) gCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCg > 2:1588639/1‑150 (MQ=255) gCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCg > 2:794616/1‑150 (MQ=255) cAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGc < 2:926485/150‑1 (MQ=255) gAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTAc > 2:206883/1‑150 (MQ=255) gAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTAc > 1:443746/1‑150 (MQ=255) aaTATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACcg < 1:1113388/150‑1 (MQ=255) atatGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACcgc < 2:962847/150‑1 (MQ=255) atatGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACcgc < 1:160481/150‑1 (MQ=255) atatGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACcgc < 1:160570/150‑1 (MQ=255) atatGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACcgc < 2:1392920/150‑1 (MQ=255) tgctgcCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCgccgcc > 2:922775/1‑150 (MQ=255) gcCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGtt < 1:95762/150‑1 (MQ=255) cAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGa < 2:1047180/150‑1 (MQ=255) cAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGa < 2:735647/150‑1 (MQ=255) gggCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACg < 2:860912/150‑1 (MQ=255) gggCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACg < 2:578824/150‑1 (MQ=255) gggCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACg < 2:578713/150‑1 (MQ=255) tgtgGATGGTGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACggcca < 2:1267829/150‑1 (MQ=255) tgtgGATGGTGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACggcca < 2:64743/150‑1 (MQ=255) tgtgGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACggcca > 1:338562/1‑150 (MQ=255) tgATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTATTGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACggacaggc < 2:794743/149‑1 (MQ=255) ggATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACggccaggc < 2:559348/150‑1 (MQ=255) ggATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACggccaggc < 2:794723/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACGGCCAGGCCaa < 2:1521054/150‑1 (MQ=255) tGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACGGCCAGGCCaa < 2:1521202/150‑1 (MQ=255) | CTGCGCCCGATTCGCCGCCTGCTACCGGCAATGGGTGGGATTGATTTCTCGCCGATGATCCTCGTTCTGCTGCTGTATGTCATCAATATGGGTGTCGCAGAAGTATTACAGGCAACCGGAAATATGCTGCTGCCAGGGCTGTGGATGGCGTTATGAATGCCGTAACAGTTAATGATGACGGTCTGGTTTTACGGCTCTATATTCAGCCGAAAGCCAGCCGTGATTCTATTGTCGGTTTACATGGCGACGAAGTTAAAGTCGCCATTACCGCGCCGCCGGTTGACGGCCAGGCCAA > NC_000913/3096231‑3096525 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |