Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 782,800 | C→T | 5.9% | A239V (GCG→GTG) | nadA → | quinolinate synthase, subunit A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 782,800 | 0 | C | T | 5.9% | 347.8 / 7.9 | 102 | A239V (GCG→GTG) | nadA | quinolinate synthase, subunit A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (54/42); new base T (3/3); total (57/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.70e-01 |
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGT > NC_000913/782651‑782948 | gggTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGACTCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGc > 1:1471600/1‑150 (MQ=255) ggTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGcg < 1:1128323/150‑1 (MQ=255) tGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGcggt < 2:814417/150‑1 (MQ=255) ggAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGcggtc < 2:127052/150‑1 (MQ=255) gagaCATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGcggtcg < 1:1016154/150‑1 (MQ=255) gagaCATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGcggtcg < 1:983294/150‑1 (MQ=255) aCATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGtt < 1:333757/150‑1 (MQ=255) aTTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTcc > 2:400138/1‑150 (MQ=255) ttCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTcca > 2:803583/1‑150 (MQ=255) cTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCGCCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTccacc < 2:1129086/150‑1 (MQ=255) tATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTccacca > 1:771197/1‑150 (MQ=255) tATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTccacca > 1:1161594/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAg < 1:1498898/150‑1 (MQ=255) tGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCaa > 1:1599797/1‑150 (MQ=255) tGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCaa > 1:762919/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACt > 2:1091823/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACt > 2:1537219/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACt > 2:1091825/1‑150 (MQ=255) gCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACt > 1:129355/1‑150 (MQ=255) ccTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCgctg < 2:191998/150‑1 (MQ=255) ccTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCgctg < 2:192020/150‑1 (MQ=255) ccTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCgctg < 2:454918/150‑1 (MQ=255) ccTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCgctg < 1:1004447/150‑1 (MQ=255) cTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCgctgc < 1:1267436/150‑1 (MQ=255) aTTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCg < 2:896149/150‑1 (MQ=255) aTTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCg < 2:148761/150‑1 (MQ=255) aTTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCg < 2:1676680/150‑1 (MQ=255) aTTGTGCAGGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAAACCGCTTGCAAGTAGTATACCCGGATGCTGACATCATGGTGCATACAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGGGTATGCGGTCGTTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTTCg < 2:391023/150‑1 (MQ=255) ttGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGa < 1:927422/150‑1 (MQ=255) gtgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGaaa > 2:148164/1‑150 (MQ=255) gtgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGaaa > 2:1021172/1‑150 (MQ=255) tgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGaaaa > 2:1563038/1‑150 (MQ=255) tgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGaaaa > 2:1126612/1‑150 (MQ=255) tgCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGaaaa > 1:679073/1‑150 (MQ=255) tgCATGATGAATCTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGaaaa > 2:1563037/1‑150 (MQ=255) gCAGGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATCCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCAATTGTCGAAAGGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGACAACAGATCGCTGCTGCGAAAAc > 1:232049/1‑150 (MQ=255) cATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACa < 1:1297374/150‑1 (MQ=255) atgatgAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACAt > 1:665855/1‑150 (MQ=255) atgaATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGc > 1:617954/1‑150 (MQ=255) tgaATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGcc > 2:401483/1‑150 (MQ=255) aTTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCcaca < 2:312415/150‑1 (MQ=255) tttAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAGCATTGCCACAt > 2:597270/1‑150 (MQ=255) tttAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACAt > 2:414720/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGc < 2:406333/150‑1 (MQ=255) tCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCt < 1:803583/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTa > 2:1011380/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTa > 2:1580291/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTa > 2:527379/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTa > 2:578695/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGc > 1:845517/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGc > 1:845510/1‑150 (MQ=255) aaCCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGc < 2:472309/150‑1 (MQ=255) aCCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCa > 2:127945/1‑150 (MQ=255) 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cAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCgg > 1:532003/1‑150 (MQ=255) ccGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTAc > 2:81456/1‑150 (MQ=255) gATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACaaa > 2:1528383/1‑150 (MQ=255) aCTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGc > 2:1258687/1‑150 (MQ=255) cTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCg < 2:873969/150‑1 (MQ=255) tGGTGCCTCCAGAATCACCCCAAGCTCTTGTCGAGACGGCGGCTGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATAGCCACAACAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAACTGCACCAGGCgc < 2:1471600/150‑2 (MQ=255) gCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGcc < 2:1161594/150‑1 (MQ=255) gCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGcc < 2:771197/150‑1 (MQ=255) tCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGa > 1:1060289/1‑150 (MQ=255) cAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATa > 1:635479/1‑150 (MQ=255) 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cacaAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTAc > 1:100886/1‑150 (MQ=255) cacaAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTAc > 1:526175/1‑150 (MQ=255) aaGCTATTGTAGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTgg > 2:279765/1‑150 (MQ=255) gattttGTCGTTTGGGCGGTTGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGaa < 1:500647/146‑1 (MQ=255) tATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGc < 2:1599797/150‑1 (MQ=255) aTTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCa > 1:1636853/1‑150 (MQ=255) aTTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACAGATAGCTGCTGCGAAAACATTGCCACAACAGAGGCTTATTGTGGCAACCGAAAGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCa > 1:1624630/1‑150 (MQ=255) ttGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCAc < 1:1532890/150‑1 (MQ=255) ttGTCGATATGGCGGATGCGGGCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCAc < 1:1532908/150‑1 (MQ=255) tGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCAcc < 1:1021172/150‑1 (MQ=255) gTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCa > 2:562948/1‑150 (MQ=255) atatGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCg > 2:1590686/1‑150 (MQ=255) atatGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCg > 2:1590689/1‑150 (MQ=255) atatGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCGTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATTCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACAGGAAGCACCAAccc > 1:609154/1‑149 (MQ=255) atatGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCGGCTGCGAAAACCTTGCCACCTCAGAGGCGGATTGTGGCCACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCCGATAAAGAGTTACTGGACGCACCAAccc > 1:191212/1‑149 (MQ=255) tGGCGGATGTGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAg < 2:621965/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATGTGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAg < 2:621970/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATGTGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAg < 2:621963/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAg < 2:1384352/150‑1 (MQ=255) tGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAg < 2:780193/150‑1 (MQ=255) 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gCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGt < 2:1439017/150‑1 (MQ=255) gCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGt < 1:1132910/150‑1 (MQ=255) | GGGTGGAGACATTCTATGCTGGCAGGGTGCCTGTATTGTGCATGATGAATTTAAGACTCAGGCGTTAACCCGCTTGCAAGAAGAATACCCGGATGCTGCCATACTGGTGCATCCAGAATCACCACAAGCTATTGTCGATATGGCGGATGCGGTCGGTTCCACCAGTCAACTGATCGCTGCTGCGAAAACATTGCCACATCAGAGGCTTATTGTGGCAACCGATCGGGGTATTTTCTACAAAATGCAGCAGGCGGTGCCAGATAAAGAGTTACTGGAAGCACCAACCGCAGGTGAGGGT > NC_000913/782651‑782948 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |