| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,087,867 | G→A | 5.1% | S664L (TCA→TTA) | pgaB ← | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,087,867 | 0 | G | A | 5.1% | 271.2 / 3.1 | 79 | S664L (TCA→TTA) | pgaB | poly‑beta‑1,6‑N‑acetyl‑D‑glucosamine (PGA) N‑deacetylase outer membrane export lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/32); new base A (2/2); total (44/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
ATGGACATAAAAAACGGCCAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTC > NC_000913/1087719‑1088016 | aTGGACATAAAAAACGGCCAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGa > 2:1521581/1‑150 (MQ=255)aTGGACATAAAAAACGGCCAGAAGAAAACGAACATCATCATCAGATCACCAGAGTGAAAGAACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGa > 1:1605125/1‑150 (MQ=255) tAAAAAACGGCCAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCa > 2:1519176/1‑150 (MQ=255) tAAAAAACGGCCAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTAAAAACTCa > 2:1096283/1‑150 (MQ=255) tAAAAAACGGCCAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTAAAAACTCa > 2:1096254/1‑150 (MQ=255) aaaaaaCGGCCAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAg < 1:1427205/150‑1 (MQ=255) cAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAg > 1:928835/1‑150 (MQ=255) cAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAg > 1:928852/1‑150 (MQ=255) agaaAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCt > 1:1060994/1‑150 (MQ=255) aaCGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTAttt > 1:221290/1‑150 (MQ=255) aCGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTc > 1:644555/1‑150 (MQ=255) ccTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAggtt > 1:340249/1‑150 (MQ=255) cTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGTTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAggttg < 2:1186812/150‑1 (MQ=255) cTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAggttg < 2:1552016/150‑1 (MQ=255) tcatcatcaGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAggttgg < 1:9883/150‑1 (MQ=255) catcatcaGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAggttggt > 2:773057/1‑150 (MQ=255) catcatcaGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAggttggt < 2:155802/150‑1 (MQ=255) tcatcaGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCACACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTa < 2:600334/150‑1 (MQ=255) tcaGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGATTAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGc < 2:1034811/150‑1 (MQ=255) tcaGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGc > 2:180172/1‑150 (MQ=255) tcaGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGc < 2:162158/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGa > 1:366808/1‑150 (MQ=255) gTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGa > 2:1245993/1‑150 (MQ=255) gTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGa > 1:366815/1‑150 (MQ=255) ttCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGaa < 2:1511756/150‑1 (MQ=255) ttCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGaa < 2:1511751/150‑1 (MQ=255) aaGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGata < 2:910838/150‑1 (MQ=255) tacgctacgcATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGataata > 1:1472380/1‑150 (MQ=255) tATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTc > 1:157729/1‑150 (MQ=255) tATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTc > 1:940361/1‑150 (MQ=255) cATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCAtt > 1:487782/1‑150 (MQ=255) cATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCAtt > 1:971690/1‑150 (MQ=255) acacCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGt < 1:1532595/150‑1 (MQ=255) acCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTg > 1:83506/1‑150 (MQ=255) acCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTg > 1:923875/1‑150 (MQ=255) ccAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGt > 2:359183/1‑150 (MQ=255) gACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAAt > 1:1622556/1‑150 (MQ=255) aCATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATa < 2:1622464/150‑1 (MQ=255) ataataTAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAgg > 1:763719/1‑150 (MQ=255) tataAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCa > 1:680073/1‑150 (MQ=255) tataAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCa > 1:679937/1‑150 (MQ=255) tataAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCa > 1:539183/1‑150 (MQ=255) aaaaaCGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCa < 2:273281/150‑1 (MQ=255) aaaaaCGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGAGACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCa < 1:381980/150‑1 (MQ=255) aaaaCGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAg < 1:505122/150‑1 (MQ=255) aaaaCGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAg > 2:1148660/1‑150 (MQ=255) aaaCGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGt < 2:221290/150‑1 (MQ=255) aaaCGAGACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGt < 1:1377565/150‑1 (MQ=255) cgatGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAgt < 1:451295/150‑1 (MQ=255) cGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGttgttg < 1:180172/150‑1 (MQ=255) ttAATCATTTTTCGGATACCATGCTGTTTAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTTGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCga < 2:1203271/150‑1 (MQ=255) ttAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCga < 2:646171/150‑1 (MQ=255) tAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaa < 1:1519176/150‑1 (MQ=255) tAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaa < 1:773057/150‑1 (MQ=255) tAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTAAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaa < 1:1096254/150‑1 (MQ=255) tAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTAAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaa < 1:1096283/150‑1 (MQ=255) aaTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaag < 2:1060994/150‑1 (MQ=255) aaTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaag > 2:1703657/1‑150 (MQ=255) aTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaaga > 1:1169945/1‑150 (MQ=255) aTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaaga > 1:1503128/1‑150 (MQ=255) aTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaaga > 1:806530/1‑150 (MQ=255) aTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaaga < 2:157729/150‑1 (MQ=255) aTCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaaga > 1:19468/1‑150 (MQ=255) tCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaagaa < 2:433479/150‑1 (MQ=255) tCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaagaa > 2:374005/1‑150 (MQ=255) tCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCgaagaa > 2:373899/1‑150 (MQ=255) tttttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATa < 2:644555/150‑1 (MQ=255) tttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGc > 2:1506155/1‑150 (MQ=255) tttCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGc > 2:994999/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGc > 1:1547067/1‑150 (MQ=255) tACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGc > 1:997800/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCGGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGa < 2:246228/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGa > 1:155760/1‑150 (MQ=255) cAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGa < 1:67495/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGa < 2:1300932/150‑1 (MQ=255) cAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATGCAGTGGTAATAGGCGAATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGa > 2:828374/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCa > 1:1112269/1‑150 (MQ=255) gCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCa < 2:1385731/150‑1 (MQ=255) gTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCAttt < 1:1694079/150‑1 (MQ=255) gAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTc < 1:38980/150‑1 (MQ=255) gAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTc > 2:1222154/1‑150 (MQ=255) gAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTc > 2:1222155/1‑150 (MQ=255) | ATGGACATAAAAAACGGCCAGAAGAAAACGAACCTCATCATCAGTTCACCAGAGTGAAAGTACGCTACGCATAGGGGTATGCATAACACCAGACATAATATAAAAAACGATACGATGCGATTAATCATTTTTCGGATACCAGGCTGTTGAAAACTCAGGACGAATAAGGTCTATTTCAGGTTGGTTATGCAGAAAATTGTCGGGATAATAACCATAGTTTTTCACTCCATTCAGTTGTAATAGGCTCATCCAGTGAGCGAGTTGTTGCGAAGAAATAGCCTGATGCTGACCATTTTTC > NC_000913/1087719‑1088016 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |