New junction evidence | |||||||||||
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? | NC_000913 | = 2290113 | NA (NA) | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
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aaactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTaa > 2:2500876‑M1/147‑150 (MQ=255) aGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTaa < 2:1751256/150‑1 (MQ=255) aGGCGTTGTGCCGCAGCTTGTTAAAGAGATCACTTCTACTGATGATTTCTACCGTCTGGGTAAAGAACTGGCTCTGCAGAGCGGTCTGGCACACAAAGGTGACGTTGTAGTTATGGTTTCTGGTGCACTGGTACCGAGCGGCACTACTaa > 2:3655532/1‑150 (MQ=255) aactggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAac < 1:2829037‑M1/5‑1 (MQ=255) actggggataacgccttaaatggcgaagaaacggtctaaataggctgattcaaggcatttacgggagaaaaaatcggctcaaacatgaagaaatgaaatgactgagtcagccgagaagaatttccccgcttattcgcaccttccCTAaca > 2:202736‑M1/145‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |