New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
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aTGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt < 1:2844741‑M2/150‑58 (MQ=255) aTGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagt > 1:2169034‑M2/1‑93 (MQ=255) gACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggc > 2:4151660‑M2/1‑90 (MQ=255) ggCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctataagctgtccctcctgttcatc < 1:2192991‑M2/150‑94 (MQ=255) gCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagct < 1:1936966‑M2/150‑95 (MQ=255) gATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactg < 1:1973905‑M2/150‑99 (MQ=255) tCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgc < 1:3451031‑M2/150‑111 (MQ=255) ggTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 1:2879994‑M2/1‑13 (MQ=255) ggTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg > 1:2879897‑M2/1‑13 (MQ=255) ggTAGGCGTTCCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtg < 2:2879897‑M2/63‑51 (MQ=255) ttacGTACATCATAGTGTTCCTGAACAAATGCGACATGGATGATGACGAAGAGCTGCTGGAACTGGTTGAAATGGAAGTTCGTGAACTTCTGTCTCAGTACGACTTCCCGGGCGACGACACTCCGATCGTTCGTGGTTCTGCTCTGAAAg > 2:3757874/4‑150 (MQ=0) ccGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatggtgtttttgaggtgctccagtggcttctgtttctatcagctgtccctcctgttcagctactgacggggtggtgcgtaacggcaaaagcaccgccggacatcagcgctatct > 1:2514622‑M2/1‑3 (MQ=255) | GTAGACTGCCCGGGGCACGCCGACTATGTTAAAAACATGATCACCGGTGCTGCGCAGATGGACGGCGCGATCCTGGTAGTTGCTGCGACTGACGGCCCGATGCCGCAGACTCGTGAGCACATCCTGCTGGGTCGTCAGGTAGGCGTTCCGTACATCATCGTGTTCCTGAACAAATGCGACATGGTTGATGACGAAGAGCTGCTGGAACTGGTTGAAATGGAAGTTCGTGAACTTCTGTCTCAGTACGACTTCCCGGGCGACGACACTCCGATCGTTCGTGGTTCTGCTCTGAAAGCG > NC_000913/4176181‑4176477 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |