| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 208349 = | 53 (0.890) | 3 (0.050) | 3/262 | NT | 5.8% | coding (3224/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | NC_000913 | 208378 = | 48 (0.850) | coding (3253/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit | |||||
TGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGAT > NC_000913/208202‑208494 | tGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGGTGGAAAAATACCGCATAATTAACGTCAGCGGAAAGGTATGCTTTGATGACTACACCGTTGGGCTTAAAATCACCCCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGaa > 1:67188/1‑149 (MQ=255) tGATGTTGTTTACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCgg < 1:443952/149‑1 (MQ=255) tgttgtTTACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGaa > 1:383681/1‑149 (MQ=255) tgttTACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCAGGaaaaa > 1:714804/1‑149 (MQ=255) gttTACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAGGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAat > 2:490971/1‑149 (MQ=255) tttACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAata > 2:613309/1‑149 (MQ=255) tttACTGACGCCCTGGATAAAAACCAGCAATTGCTGCAAAAAGCCCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAata < 2:805405/149‑1 (MQ=255) tACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCTGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGAGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGGAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATg > 1:401584/1‑149 (MQ=255) aCTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGc > 1:538500/1‑149 (MQ=255) taCGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTTTAAAAAGACCTCATACTTATCGTCAGCTGAAATGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTTGGCTTAAAATGACCGATCGCGAAGTGATTGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTcg < 2:1003322/148‑1 (MQ=255) cGCCCTGGATCAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACTGGTCAGCCTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTcgcg < 2:477064/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTATGATGACTTCAGAGGTGGGCTAAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTCACGAAGCCCGGGAAAAATATGATCGCgg > 1:573345/1‑149 (MQ=255) gCCCTGGATAAATACCACCAATTGCTGGAAATAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCgg < 2:769044/149‑1 (MQ=255) cccTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCggg > 1:136896/1‑149 (MQ=255) ggATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAGGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTg < 1:490971/149‑1 (MQ=255) gATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATAGCCGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGc < 1:186844/149‑1 (MQ=255) tccgccctctgatagtagagatgtactggaattgtcccagagcggtggggttccagagactgacggagtcggtttaaaagctggtcatcaatttgcctgtccgtcagcgagatagcAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTa > 1:650391‑M1/117‑149 (MQ=255) aaaaTACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCCGCGGACAGCTCAGCTCTGATGACTTCAGCGGGGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACTAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTa < 1:258638/148‑1 (MQ=255) cAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCt > 1:400134/1‑149 (MQ=255) cAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCt < 1:613309/149‑1 (MQ=255) aGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGACTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTg > 2:1010349/1‑149 (MQ=255) tGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAgg > 1:782914/1‑149 (MQ=255) ggAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTAGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGc > 1:934399/1‑149 (MQ=255) gagatgtactggaattgtccagagcggtggggttccagagactgacggagtcggtttaaaagctggtcatcaatttgcctgtccgtcagcgagatagcAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACa < 1:136510‑M1/48‑1 (MQ=255) gagatgtactggaattgtccagagcggtggggttccagagactgacggagtcggtttaaaagctggtcatcaatttgcctgtccgtcagcgagatagcAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACa > 2:136510‑M1/99‑146 (MQ=255) gAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCa > 1:466942/1‑149 (MQ=255) gAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCa > 2:49358/1‑149 (MQ=255) aaGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAAtt < 1:715208/149‑1 (MQ=255) aaGACCGCATACATATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGAAGACTTCAGCCGTGGGCTAAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAAtt < 1:704054/149‑1 (MQ=255) aCCGCATACTTATCGTCCGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATtgat < 2:526546/149‑1 (MQ=255) cGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGACAAATTGATGACCAGCTTTTaa < 2:260416/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTaaa < 1:593185/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTaaa < 1:788883/149‑1 (MQ=255) cAGCGGACAGGTCAGCTGTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAAcc < 1:733696/149‑1 (MQ=255) cAGCGGACAGGGCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAAcc < 2:628153/149‑1 (MQ=255) aGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACATGCAAATTTATGACCAGCTTTAAAACCGACTccct > 1:965399/1‑147 (MQ=255) gTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGCCCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCa > 2:314221/1‑149 (MQ=255) gTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCa > 2:845631/1‑149 (MQ=255) ttCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGAAGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAAACCCa > 2:154638/1‑149 (MQ=255) cGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGct > 1:650296/1‑149 (MQ=255) cTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGCCCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGACCCCCACCGCTCTGGGAc > 2:188806/1‑149 (MQ=255) cTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGAc > 1:282577/1‑149 (MQ=255) tAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATAAGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACaa < 2:51997/149‑1 (MQ=255) aaaTGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAAtt < 2:573345/149‑1 (MQ=255) tGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTaa < 2:836230/102‑1 (MQ=255) tGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTaa > 1:836230/1‑102 (MQ=255) tGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCa < 2:319366/149‑1 (MQ=255) tGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCGCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCa < 1:833505/149‑1 (MQ=255) gACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCGCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGATGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAg < 2:106013/149‑1 (MQ=255) gACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCAGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAg < 2:714804/149‑1 (MQ=255) aCCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGCCTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAGTTCCAGt > 2:78138/1‑149 (MQ=255) cGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGGAc > 2:750925/1‑149 (MQ=255) cGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCGCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTAc < 2:67188/149‑1 (MQ=255) gtCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCGGGGAAAAATATGCTCGCTGGCTTTCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACAt < 1:19443/148‑1 (MQ=255) gATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTAACTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACATCTCTACTATCagag < 1:940946/149‑1 (MQ=255) atTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGc > 2:57861/1‑149 (MQ=255) ttGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTGTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGACCCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCg < 2:934399/149‑1 (MQ=255) tGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCgg < 1:49358/149‑1 (MQ=255) aCGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCGTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGAt < 1:154483/149‑1 (MQ=255) | TGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGCCCTGGATAAATACCAGCAATTGCTGGAAAAAGACCGCATACTTATCGTCAGCGGACAGGTCAGCTTTGATGACTTCAGCGGTGGGCTTAAAATGACCGCTCGCGAAGTGATGGATATTGACGAAGCCCGGGAAAAATATGCTCGCGGGCTTGCTATCTCGCTGACGGACAGGCAAATTGATGACCAGCTTTTAAACCGACTCCGTCAGTCTCTGGAACCCCACCGCTCTGGGACAATTCCAGTACATCTCTACTATCAGAGGGCGGAT > NC_000913/208202‑208494 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |