New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2806786 = | 41 (0.690) | 3 (0.050) | 3/262 | NT | 7.5% | coding (777/1065 nt) | proW | glycine betaine/proline ABC transporter permease |
? | NC_000913 | 2806856 = | 35 (0.620) | coding (847/1065 nt) | proW | glycine betaine/proline ABC transporter permease |
TCCGGCGGATCTGATTGAAGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTGGGCGCGACTCACG > NC_000913/2806708‑2807004 | aacggtggcaagccccatatccagacgaccgatcccgcgaagaaccatctgacccaacccgccgacggcaatcatcgaGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCt > 1:50622‑M1/79‑149 (MQ=255) cggcggATCTGATTGTAGCCTCGCGCTGATTCGCTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGGTCAGTGACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCg < 1:236994/149‑1 (MQ=255) gcggATCTGATTCAAGCCTCGCGCTCATTCTGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTCACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTGGATGGTGGTCATCGCCTCgat > 1:991310/1‑149 (MQ=255) ggATGTGATTGAAGCGGCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTCCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCATACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGTTCATCGCCTCgatga < 2:53538/149‑1 (MQ=255) gagcTGATTGAAGCCTCGCGCTCAGTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTGCCGCTGGCGATGCCGCCCTTTATGGCGGGCGTTACCCAGCCGCTGAGGCTGGCCCGTTCTATGGTGGTCATCGCCGCgattat > 2:99146/4‑149 (MQ=255) cTGATTGAAGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGc > 1:129461/1‑149 (MQ=255) tGATTGAAGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGcc < 1:493193/149‑1 (MQ=255) gATTGAAGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGCTGCTGGCCCTTTCTATGGGGGTCTTCGCCGCGATGCTTGCCg > 1:1031324/1‑149 (MQ=255) aaGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGCTGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGTCGACAATTATGGCGGGCGTTACCCAGACGATGATGCTGGCCCTGACTATGGTCGTCAAAGACTCGATGATTGCCGTcggc > 1:787814/1‑149 (MQ=255) aaGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTcggg > 1:392178/1‑148 (MQ=255) aaGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCAGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGAGCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTGTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTcggc > 2:589763/1‑149 (MQ=255) gCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTcggcgg > 2:432521/1‑149 (MQ=255) ccTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCggg > 2:41257/1‑149 (MQ=255) tCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGTGGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGtt > 1:902180/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGCTGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGAt > 2:517039/1‑149 (MQ=255) ttCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGAt < 2:3885/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGATACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTcgc < 2:13291/149‑1 (MQ=255) gCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGGTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTcgc < 1:203217/149‑1 (MQ=255) cccGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTGCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTcgcg < 2:307744/149‑1 (MQ=255) tGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGTTGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTAGCGGTTTAggtggtgtt > 1:445791/1‑146 (MQ=255) ttCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGa > 1:445269/1‑149 (MQ=255) tCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGat < 1:790079/149‑1 (MQ=255) tCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGat > 1:92756/1‑149 (MQ=255) aaaGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCGTTTCTATGGTGGTCATCGCATCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTAGCGGTATCGGTCGTCTGGttat > 2:837960/1‑149 (MQ=255) tCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGc < 1:928703/149‑1 (MQ=255) cTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCTATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGGGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGt > 1:601114/1‑149 (MQ=255) aggcgatgaccaccatagaaagggccagcatcagcgtctggttaacgcccgccataatggtcggcatcgccTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTTCTTCGCGGGATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGtt > 1:50622‑M2/72‑149 (MQ=255) gcgatgaccaccatagaaagggccagcatcagcgtctggttaacgcccgccataatggtcggcatcgccTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTgg > 1:914172‑M2/70‑149 (MQ=255) cgatgaccaccatagaaagggccagcatcagcgtctggttaacgcccgccataatggtcggcatcgccTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGGATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTggc < 2:914172‑M2/81‑1 (MQ=255) CGATGCGAACCATTATGGCGGGCGTTCACCAGACTCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCTATGATGGCCGTAGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCTGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTggc > 1:909630‑M1/1‑149 (MQ=255) tATGCCGACCATTATGGCGGGCTTTAACCAGACGCTGAAGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCCTCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTggcg > 2:766034‑M1/2‑149 (MQ=255) GATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTggcg > 1:432521‑M1/1‑149 (MQ=255) gGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCGGGCCCGTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTGGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTggcggc > 1:978551‑M1/2‑149 (MQ=255) gACCATTTTGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCATTCTAAGGTGGTCATCGCCTCGATGCTTCCAGTCGGGGGGTTGGGTCAGAAGGTACTTCTAGGAATCGGTCGTCTGGAGATGGGGCGTGCCTCCGGTggcgtctgcg > 2:692455/1‑143 (MQ=255) gACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCg > 1:596266/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGCGTTCACCAGACGCAGAGGCTGGCCCTTTCTATGGGGGTCATCGCCGCGATGATTGCCCGCGGCGGGTTGGGGCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATtgtg < 2:888644/149‑1 (MQ=255) gTTAACCCGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGGCATCGGCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTTTCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGTTTGTGATCGTCGc < 2:376081/149‑1 (MQ=255) gTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGGACATCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCATGCCCCCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGc > 2:501895/1‑149 (MQ=255) tAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCa < 1:517039/149‑1 (MQ=255) tAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGGCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGTGATTGTGATCCTCGCCa < 2:902180/149‑1 (MQ=255) aCGCTGATGCTGGACCTTTCTATGGTGGTCATCTCCTCGATGATAGCCGTCGGCGGGTAGTGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTAGGCGGCGTCGGGATAGTGATCCTCGCCATTAACCt > 1:150858/1‑149 (MQ=255) tGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGGTCCTCGCCCTTTTCCTCGCTCGTCTg > 1:229134/1‑149 (MQ=255) ggCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCACGCCATTATCCTCGATCGTCTGa > 2:788836/1‑149 (MQ=255) gCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGAc > 1:417877/1‑149 (MQ=255) tggtggTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTAGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGTCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGtt > 1:519363/1‑149 (MQ=255) gtggtCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTgg > 1:752482/1‑149 (MQ=255) tggtCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCAGACGCAGGCCGTTggg > 2:652439/1‑149 (MQ=255) tCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTTTCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGAGTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTGGgcgc > 2:416657/1‑149 (MQ=255) tCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTGGgcgc > 2:482056/1‑149 (MQ=255) tCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTGGgcgc < 2:392178/149‑1 (MQ=255) gcatcgccTCGATGATTGCCGTCGGCGGGGTGGCTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGGTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTGGgagc < 2:601114‑M2/141‑1 (MQ=255) tCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATAGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTAGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTGGGCGCGACTCACg > 1:151700/1‑149 (MQ=255) | TCCGGCGGATCTGATTGAAGCCTCGCGCTCATTCGGTGCCAGCCCGCGCCAGATGCTGTTCAAAGTTCAGTTACCGCTGGCGATGCCGACCATTATGGCGGGCGTTAACCAGACGCTGATGCTGGCCCTTTCTATGGTGGTCATCGCCTCGATGATTGCCGTCGGCGGGTTGGGTCAGATGGTACTTCGCGGTATCGGTCGTCTGGATATGGGGCTTGCCACCGTTGGCGGCGTCGGGATTGTGATCCTCGCCATTATCCTCGATCGTCTGACGCAGGCCGTTGGGCGCGACTCACG > NC_000913/2806708‑2807004 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |