Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,809,354 | 0 | A | G | 5.3% | 307.4 / 6.5 | 115 | E272G (GAA→GGA) | waaA | 3‑deoxy‑D‑manno‑octulosonic‑acid transferase (KDO transferase) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (54/52); new base G (3/3); total (59/56) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.31e-01 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
CGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGATCTC > NC_000913/3809207‑3809502 | cGCTGCGCCGCCAGTTGGCACGACACCTCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGaa < 1:332783/149‑1 (MQ=255) gCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGAGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAAc < 1:736824/149‑1 (MQ=255) tGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGc < 1:641879/149‑1 (MQ=255) 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cGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATg > 1:838818/1‑149 (MQ=255) gAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTACCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGGGGGTGGCGATAGGATgg > 2:464770/1‑149 (MQ=255) aaTTAAATGCGCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGTTACGATggg < 1:1033250/149‑1 (MQ=255) gCTGATCCTGGTACCCCGTCCTCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGACCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGTGAAGTCTCATCCACCAGCTCGGAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGTGCGAGTTGa < 2:765250/149‑1 (MQ=255) gCTCATCCTGGTACACCGTCATACGGAACGCTTCCCGGATGCGATTACACTTGTCCTCCAGGCTGGACTAAGCGATATAACACGCACTTCAGAGGAAGTCCCCTCAACCAGCACGCAGTGTGTGGTTGGCGATCCGATGGGCTAGTGGa > 2:927021/1‑149 (MQ=255) cTCATCCTGGTACACCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGATGAGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGAt > 2:367828/1‑149 (MQ=255) cATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGt < 1:126565/149‑1 (MQ=255) tgcTGGGACCCCCGCCTCCGGAACGGTTGCCGGTTGGGGTTAACCTTTTGCGCCATGCTGGTCTTAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTa < 2:981317/147‑1 (MQ=255) cTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACt < 1:454879/149‑1 (MQ=255) aCCCCGTCATCCTGTAGGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTGAGGCAGGCTTGACTAAGGTATATCACTCGCTCTTCAGGGGAATTCACCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATg < 1:846376/149‑1 (MQ=255) ccccGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGACCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCTGCACGCAGCTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGCCTTGATGTTACTGTATgg > 1:844820/1‑149 (MQ=255) tcgcATCCGGGAAGCGTTCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCAt > 1:868466/4‑149 (MQ=255) cgcATCCGGGAAGCGTTCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATG‑TACTGTATGGCATTg > 2:777444/3‑149 (MQ=255) aTCCGGGAAGCGTTCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGcc > 2:262695/1‑149 (MQ=255) tCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCCCACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCg > 1:202809/1‑149 (MQ=255) cGGAAAGCTTCCCGGATGCGATTATCCTTGAGCGCCCGGCTGGACTAAGCTATAGCACCCGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATTCGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGAt < 2:442811/149‑1 (MQ=255) aaCGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTACCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGAtctc < 2:413770/149‑1 (MQ=255) | CGCTGCGCCGCCAGTGGGCACCACACCGCCCGGTATGGATTGCCACCAGCACTCACGAAGGCGAAGAGAGTGTGGTGATCGCCGCACATCAGGCATTGTTACAGCAATTCCCGAATTTATTGCTCATCCTGGTACCCCGTCATCCGGAACGCTTCCCGGATGCGATTAACCTTGTCCGCCAGGCTGGACTAAGCTATATCACACGCTCTTCAGGGGAAGTCCCCTCCACCAGCACGCAGGTTGTGGTTGGCGATACGATGGGCGAGTTGATGTTACTGTATGGCATTGCCGATCTC > NC_000913/3809207‑3809502 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |