| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 1,237,329 | IS2 (+) +5 bp | intergenic (‑88/‑238) | ycgB ← / → dadA | SpoVR family stationary phase protein/D‑amino acid dehydrogenase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1237329 = | 2 (0.030) | 66 (0.870) | 50/294 | 0.6 | 97.0% | intergenic (‑88/‑242) | ycgB/dadA | SpoVR family stationary phase protein/D‑amino acid dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | 1467910 = | NA (NA) | noncoding (1331/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 1237333 | 1 (0.010) | 91 (1.200) | 66/294 | 0.1 | 98.9% | intergenic (‑92/‑238) | ycgB/dadA | SpoVR family stationary phase protein/D‑amino acid dehydrogenase |
| ? | NC_000913 | = 2070271 | NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) | IS2 | repeat region | |||||
AATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > NC_000913/1467762‑1468056 | aaTGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCt < 1:1103218/149‑1 (MQ=255)aaTGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTCTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCt > 2:358273/1‑149 (MQ=255) aTACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTg > 1:222355/1‑149 (MQ=255) aTACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTg < 2:472436/149‑1 (MQ=255) aTACGACAATAAGCGGATAATTCCCTCTGTGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTTCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGATTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTg < 2:467128/149‑1 (MQ=255) tACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGc > 2:1128088/1‑149 (MQ=255) gACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTTTTCGGGTACAGGATAAAGATTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCGAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGcccc > 2:4589/1‑149 (MQ=255) gACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTAGTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGcccc > 2:1107727/1‑149 (MQ=255) aaTCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTAGAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCtat < 2:1219835/149‑1 (MQ=255) aGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATAttt > 1:1010231/1‑149 (MQ=255) gCGGAGAAATCCCGCTGGGGGTTGCCGGGGGTATTCGGGTACAGGATAACCCTTTGCTGGAAATTGGCCGTGGCGCTTCGCTAACAATGCAGTATCTTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAATAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTc < 1:141968/149‑1 (MQ=255) gtagaATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAATGCTTTGCTGGAAATTGGCAGGGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCa < 1:25211/147‑1 (MQ=255) ggAGAATGCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGGTAGTCGGGGACAATCTAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATAGTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACACTGGATTTGCCCCTATATTTCCa < 2:124971/149‑1 (MQ=255) agaATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGa > 1:1100450/1‑149 (MQ=255) ttCCCTCTGGGGATTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACTTc > 2:662933/1‑149 (MQ=255) tctGGGTTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGTAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGAAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAACAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATcattta > 2:693914/1‑144 (MQ=255) ttGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTaa < 1:1020069/149‑1 (MQ=255) cgCCGGGCCTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAc < 2:486352/148‑1 (MQ=255) gCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCATATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAAcc > 2:912892/1‑149 (MQ=255) cGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCa > 1:596150/1‑149 (MQ=255) ggTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTa < 2:190544/149‑1 (MQ=255) ggTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTa < 2:796924/149‑1 (MQ=255) ttATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACa > 1:1229367/1‑149 (MQ=255) aTTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAg > 2:863786/1‑149 (MQ=255) gggTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCg > 1:1184597/1‑149 (MQ=255) gTACAGGATAAATCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCAACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCt < 1:413818/149‑1 (MQ=255) aCAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGc < 2:1047883/149‑1 (MQ=255) cAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGcc > 1:103843/1‑149 (MQ=255) gATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCa > 2:557631/1‑149 (MQ=255) gATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCa > 2:687733/1‑149 (MQ=255) aaGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCATGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGata < 1:322843/149‑1 (MQ=255) aaGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGTCAGTTTTGAACATCATGGGACAAGACCCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATAACAAGCCCGCTGCCGCAGata < 1:215289/149‑1 (MQ=255) aGCTTTGCTGGAAATTGGCTGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCAGCTGCCGCAGatat > 1:233985/1‑149 (MQ=255) cTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTc < 1:1107727/149‑1 (MQ=255) tttGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATATCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTcc > 2:1103145/1‑149 (MQ=255) gCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGt < 2:222355/149‑1 (MQ=255) cTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGAAATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTg > 2:958643/1‑149 (MQ=255) tGGATATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGCACATCATGGGCCAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTGTACACATTACAAGCCAGCTGCCGCAGATATTCCAGTgg > 2:892269/1‑149 (MQ=25) ggAAATTGGCAGTTGCGCTACGCTAACAATGCAGTATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGgc < 2:1235191/149‑1 (MQ=255) ggAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGgc > 1:1221212/1‑149 (MQ=255) ggAAAGTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGgc < 2:1230555/149‑1 (MQ=255) aTTGGCAGTGGCGCGACGCTAACACTGCAGGATATTGACAGTTTTGAAGATCTTGGGACAAGAAACCTGGAGTTGCCCCTATAATTCCACACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGgcgagc < 2:261331/149‑1 (MQ=21) gctacgctaACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAgcg > 2:646983/1‑149 (MQ=255) tacgctaACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGCGGCGAGCGATAACCCAGCGCa < 2:171585/149‑1 (MQ=255) cAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGcc > 1:527187/1‑149 (MQ=255) aGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTTCCGCAGAAATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCa > 2:349988/1‑149 (MQ=255) ggATATTTACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAAACCTGGATTTGAACCTATATTTAGAGACATCTGTTATCTCTTAACCCATTACATGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCAt < 1:693914/149‑1 (MQ=17) ttatTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCCCTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTc < 1:499948/148‑1 (MQ=255) atTGACAGTTTTGAACATCAAGGGACAAGAACCCTTGATGTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCTATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGt < 1:539066/149‑1 (MQ=255) ttGAGAGTTTTTATCATCATGCGACAAGTACTCTGGATTTGCCGCTTTATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCGGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGtt < 1:858196/149‑1 (MQ=14) ttGACAGTTTTGAACATCATGGTACAAGAACCCTTGA‑TTGCCACTATATTTCCTGACATATGTTATGACTTAACCCATTACAATCAGGGTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGGGATAACCAAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTta < 1:1112423/149‑1 (MQ=17) ttGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGtt < 2:962181/149‑1 (MQ=255) ttGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGtt < 1:604591/149‑1 (MQ=255) cAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTACAGACATCTGTTATCACTTAACCAATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATaa > 1:105755/1‑149 (MQ=255) ttttGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCAATACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGGGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGc < 2:1100450/149‑1 (MQ=255) tttGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCTATTCGTTATAATGCt < 1:1128088/149‑1 (MQ=255) tttGAACATCATCGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGAGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATACGGATGCCATTCGTTATAATGCt > 1:97239/1‑149 (MQ=255) ttGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTCCCGCAGATATTCCCGTGGCCAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTc > 2:147437/1‑149 (MQ=255) aCATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAc < 1:863786/149‑1 (MQ=255) aCATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAAc < 1:358273/149‑1 (MQ=255) atGGGACAAGAACCCTTGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATGACTTAACCCATTAAAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTTGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCctc < 2:793947/149‑1 (MQ=255) tGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGAGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCctct < 2:106262/149‑1 (MQ=255) aCAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGGGGATGCCATTCGTTATATTGCTCGATCGCCTCTGCaa > 2:45564/1‑149 (MQ=255) aaGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAgg < 2:1010231/149‑1 (MQ=35) cccTGGATTTGCCCCTCTATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATCACCCAGCGCACTATGCGTCTGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCtt < 1:1199634/149‑1 (MQ=9) ccTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCttt < 1:687733/149‑1 (MQ=11) ccTGGAATTTCCCCTATCTTTCCCGCCATCTGTTATCACTTCACCCAATACAAGCCCGATGCCGCAGATCTTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCttt < 2:242907/149‑1 (MQ=11) | AATGGAGATACGACAATCAGCGGAGAATTCCCTCTGGGGTTTGCCGGGGTTATTCGGGTACAGGATAAAGCTTTGCTGGAAATTGGCAGTGGCGCTACGCTAACAATGCAGGATATTGACAGTTTTGAACATCATGGGACAAGAACCCTGGATTTGCCCCTATATTTCCAGACATCTGTTATCACTTAACCCATTACAAGCCCGCTGCCGCAGATATTCCCGTGGCGAGCGATAACCCAGCGCACTATGCGGATGCCATTCGTTATAATGCTCGAACGCCTCTGCAAGGTTCTTT > NC_000913/1467762‑1468056 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |