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? | NC_000913 | 2514273 = | NA (NA) | noncoding (1/1345 nt) | IS186 | repeat region |
GCAGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTCCCATAAGCGCTAACTTAAGGGTTGTGGTATTACGCCTGATATGATTTAACGTGCCGATGAATTACTCTCACGATAACTGGTCAGCAATTCTGGCCCATATTGGTAAGCCCGAAGAACTGGATACTTCGGCACGTAATGCCGG > NC_000913/2514125‑2514416 | gccggtAAAGGCCTGACTGAAGAGCAAGGTAACGTGGGTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGGTTACGGCGCTACCCTGGTGAGTGCGCTGTCTGCGGCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATCCATAAAAAAGCCGGGGATAAtt < 1:88452/144‑1 (MQ=255) aGTTAAAGGCCTGAATGAAGAGCAAGGTAACGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTcc > 1:583406/1‑149 (MQ=255) tttAAAGGCCTTAATGAAGTGCAAGGTTAAGTGGTTTCTCGCTTCGGGCTGAAGCTGGTTTACGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc < 1:1050548/148‑1 (MQ=255) gTTAAAGGCCTGAATGACGCGCAAGGTACCGTGGTTTCTCGCTTCGGTCTGACGCTGGTTTCCGGCTCTACCCTGGTGAGTGTGCTGTCTGCGTCAATCGCAGCACTGGTGCTGTAAGACCATACATAAAAAAGCCGGGGATAATTccc 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |