| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 4,640,551 | IS1 (–) +9 bp | intergenic (+9/‑383) | yjjY → / → yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase |
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| * | ? | NC_000913 | = 3584195 | NA (NA) | 81 (1.060) | 66/294 | 0.1 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 4640559 | 0 (0.000) | intergenic (+17/‑383) | yjjY/yjtD | uncharacterized protein/putative methyltransferase | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TGACTAAAGTACGTAATTGCGTTCTTGATGCACTTTCCATCAACGTCAACAACATCATTAGCTTGGTCGTGGGTACTTTCCCTCAGGACCCGACAGTGTCAAAAACGGCTGTCATCCTAACCATTTTAACAGCAACATAACAGGCTAAGAGGGGCCGGACACCCAATAAAACTACGCTTCGTTGACATATATCAAGTTCAATTGTAGCACGTTAACAGTTTGATGAAATCATCGTATCTAAATGCTAGCTTTCGTCACATTATTTTAATAATCCAACTAGTTGCATCATACAACTA > NC_000913/4640403‑4640698 | gagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgatcaggagggccagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaccaccatcctaccctaagtcagtaagttggcagcatccccg > 1:1115699‑M2/149‑149 (MQ=255) agatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaaccggagggaccgctgatagacacagaagcccctggagcacctccaaaaccccctcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccgc > 2:103352‑M2/148‑148 (MQ=255) agatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagtagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccGa < 2:148323‑M2/2‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |